seq1 = pF1KB4144.tfa, 468 bp
seq2 = pF1KB4144/gi568815591f_1439193.tfa (gi568815591f:1439193_1640372), 201180 bp

>pF1KB4144 468
>gi568815591f:1439193_1640372 (Chr7)

1-36  (100001-100036)   100% ->
37-468  (100749-101180)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGACTAATCCCAAACCGAATAAGGCATTAAAG         GTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100001 ATGACGACTAATCCCAAACCGAATAAGGCATTAAAGGTA...CAGGTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAAGGAGGCGGGCGAGAACGCCCCGGTGCTCAGCGATGATGAGCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100754 GAAGGAGGCGGGCGAGAACGCCCCGGTGCTCAGCGATGATGAGCTGGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATGTCGGTGCGGGAGCTGAACCAGCACCTGCGGGGTCTCACCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100804 CCATGTCGGTGCGGGAGCTGAACCAGCACCTGCGGGGTCTCACCAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGTGACCCGCCTGAAGCAGCGTCGGCGCACACTCAAGAACCGCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 GAGGTGACCCGCCTGAAGCAGCGTCGGCGCACACTCAAGAACCGCGGCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCGGCCAGCTGCCGCATCAAGCGGGTGACGCAGAAGGAGGAGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100904 CGCGGCCAGCTGCCGCATCAAGCGGGTGACGCAGAAGGAGGAGCTGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCAGCGCGTGGAGCTGCAGCAGGAGGTGGAGAAGCTGGCGCGTGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100954 GGCAGCGCGTGGAGCTGCAGCAGGAGGTGGAGAAGCTGGCGCGTGAGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCAGCATGCGGCTGGAGCTGGACGCCCTGCGCTCCAAGTACGAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101004 AGCAGCATGCGGCTGGAGCTGGACGCCCTGCGCTCCAAGTACGAGGCGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCAGACCTTCGCGCGCACCGTGGCCCGGGGACCTGTGGCGCCCTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101054 GCAGACCTTCGCGCGCACCGTGGCCCGGGGACCTGTGGCGCCCTCCAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGCCACCACCAGCGTCATCACCATCGTCAAGTCCACCGAGCTCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101104 TGGCCACCACCAGCGTCATCACCATCGTCAAGTCCACCGAGCTCTCCTCC

    450     .    :    .    :    .
    442 ACCTCCGTGCCCTTCTCGGCTGCATCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 101154 ACCTCCGTGCCCTTCTCGGCTGCATCC