seq1 = pF1KB4126.tfa, 1299 bp
seq2 = pF1KB4126/gi568815591f_107374061.tfa (gi568815591f:107374061_107575359), 201299 bp

>pF1KB4126 1299
>gi568815591f:107374061_107575359 (Chr7)

1-1299  (100001-101299)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTTTTTCTCCCATTCTGGAAATCAACATGCAGTCTGAATCTAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTTTTTCTCCCATTCTGGAAATCAACATGCAGTCTGAATCTAACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACAGTGCGAGATGACATTGATGACATCAACACCAATATGTACCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACAGTGCGAGATGACATTGATGACATCAACACCAATATGTACCAACCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATCATATCCGTTAAGCTTTCAAGTGTCTCTCACCGGATTTCTTATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATCATATCCGTTAAGCTTTCAAGTGTCTCTCACCGGATTTCTTATGTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAATTGTGTTGGGACTTGGCAGCAACCTCACTGTATTGGTACTTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAATTGTGTTGGGACTTGGCAGCAACCTCACTGTATTGGTACTTTACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGAAATCCAACTTAATCAACTCTGTCAGTAACATTATTACAATGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGAAATCCAACTTAATCAACTCTGTCAGTAACATTATTACAATGAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCATGTACTTGATGTAATAATTTGTGTGGGATGTATTCCTCTAACTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCATGTACTTGATGTAATAATTTGTGTGGGATGTATTCCTCTAACTATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTATCCTTCTGCTTTCACTGGAGAGTAACACTGCTCTCATTTGCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTATCCTTCTGCTTTCACTGGAGAGTAACACTGCTCTCATTTGCTGTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCATGAGGCTTGTGTATCTTTTGCAAGTGTCTCAACAGCAATCAACGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCATGAGGCTTGTGTATCTTTTGCAAGTGTCTCAACAGCAATCAACGTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGCTATCACTTTGGACAGATATGACATCTCTGTAAAACCTGCAAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGCTATCACTTTGGACAGATATGACATCTCTGTAAAACCTGCAAACCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTCTGACAATGGGCAGAGCTGTAATGTTAATGATATCCATTTGGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTCTGACAATGGGCAGAGCTGTAATGTTAATGATATCCATTTGGATTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCTTTTTTCTCTTTCCTGATTCCTTTTATTGAGGTAAATTTTTTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCTTTTTTCTCTTTCCTGATTCCTTTTATTGAGGTAAATTTTTTCAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCAAAGTGGAAATACCTGGGAAAACAAGACACTTTTATGTGTCAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCAAAGTGGAAATACCTGGGAAAACAAGACACTTTTATGTGTCAGTACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATGAATACTACACTGAACTGGGAATGTATTATCACCTGTTAGTACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATGAATACTACACTGAACTGGGAATGTATTATCACCTGTTAGTACAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCAATATTCTTTTTCACTGTTGTAGTAATGTTAATCACATACACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCAATATTCTTTTTCACTGTTGTAGTAATGTTAATCACATACACCAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TACTTCAGGCTCTTAATATTCGAATAGGCACAAGATTTTCAACAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TACTTCAGGCTCTTAATATTCGAATAGGCACAAGATTTTCAACAGGGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGAAGAAAGCAAGAAAGAAAAAGACAATTTCTCTAACCACACAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGAAGAAAGCAAGAAAGAAAAAGACAATTTCTCTAACCACACAACATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCTACAGACATGTCACAAAGCAGTGGTGGGAGAAATGTAGTCTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCTACAGACATGTCACAAAGCAGTGGTGGGAGAAATGTAGTCTTTGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAGAACTTCAGTTTCTGTAATAATTGCCCTCCGGCGAGCTGTGAAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAGAACTTCAGTTTCTGTAATAATTGCCCTCCGGCGAGCTGTGAAACGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACCGTGAACGACGAGAAAGACAAAAGAGAGTCTTCAGGATGTCTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACCGTGAACGACGAGAAAGACAAAAGAGAGTCTTCAGGATGTCTTTATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATTATTTCTACATTTCTTCTCTGCTGGACACCAATTTCTGTTTTAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATTATTTCTACATTTCTTCTCTGCTGGACACCAATTTCTGTTTTAAATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCACCATTTTATGTTTAGGCCCAAGTGACCTTTTAGTAAAATTAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCACCATTTTATGTTTAGGCCCAAGTGACCTTTTAGTAAAATTAAGATTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TGTTTTTTAGTCATGGCTTATGGAACAACTATATTTCACCCTCTATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TGTTTTTTAGTCATGGCTTATGGAACAACTATATTTCACCCTCTATTATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGCATTCACTAGACAAAAATTTCAAAAGGTCTTGAAAAGTAAAATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGCATTCACTAGACAAAAATTTCAAAAGGTCTTGAAAAGTAAAATGAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGCGAGTTGTTTCTATAGTAGAAGCTGATCCCCTGCCTAATAATGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCGAGTTGTTTCTATAGTAGAAGCTGATCCCCTGCCTAATAATGCTGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATACACAACTCTTGGATAGATCCTAAAAGAAACAAAAAAATTACCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATACACAACTCTTGGATAGATCCTAAAAGAAACAAAAAAATTACCTTTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1251 AGATAGTGAAATAAGAGAAAAATGTTTAGTGCCTCAGGTTGTCACAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AGATAGTGAAATAAGAGAAAAATGTTTAGTGCCTCAGGTTGTCACAGAC