seq1 = pF1KB4124.tfa, 2979 bp
seq2 = pF1KB4124/gi568815592r_93143429.tfa (gi568815592r:93143429_93519341), 375913 bp

>pF1KB4124 2979
>gi568815592r:93143429_93519341 (Chr6)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-162  (104575-104639)   100% ->
163-832  (108172-108841)   100% ->
833-988  (160931-161086)   99% ->
989-1324  (162290-162625)   100% ->
1325-1449  (246920-247044)   100% ->
1450-1618  (249682-249850)   100% ->
1619-1727  (254640-254748)   100% ->
1728-1783  (255427-255482)   100% ->
1784-1909  (259863-259988)   100% ->
1910-2095  (261058-261243)   100% ->
2096-2157  (261819-261880)   100% ->
2158-2367  (263305-263514)   100% ->
2368-2517  (264546-264695)   100% ->
2518-2711  (272357-272550)   100% ->
2712-2867  (273889-274044)   99% ->
2868-2979  (275802-275913)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTCCGCTTTGCACACACAGGGGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 GCTGCTCCGCTTTGCACACACAGGGGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       TACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...CAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTTCCTCTCCACCCAATGGG         TGGGAAGAAATTAGTGGTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104619 ATTTCCTCTCCACCCAATGGGGTA...CAGTGGGAAGAAATTAGTGGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGCCAAGTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108192 GGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGCCAAGTCATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108242 AGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCACAAAGGATTTTTGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108292 GCACAAAGGATTTTTGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTAATTTGTACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108342 TCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTAATTTGTACTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108392 ATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAATAGACACCATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108442 AAAATAGACACCATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGAGATTGGACCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108492 TGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGAGATTGGACCTTTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108542 CCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTGGTTTCTGTCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108592 TTGGTTTCTGTCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCAGAATTTTCCTCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108642 CTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCAGAATTTTCCTCTTTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108692 TCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCCCCCAGGATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108742 GCCCCCAGGATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAAAAGGAGACACTTGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108792 AAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAAAAGGAGACACTTGTGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833          CCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108842 GTA...CAGCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGTGCTCTCGTTGTCCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160972 CAGTGCTCTCGTTGTCCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATCTGACCCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161022 CAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATCTGACCCACCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ACGTTGCATGCACAA         GGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTC
        ||||||| |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 161072 ACGTTGCGTGCACAAGTG...AAGGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ATTTTCAACATCAACCAAACCACAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162316 ATTTTCAACATCAACCAAACCACAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162366 AGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAGCGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162416 GCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 ATGCCCCAGCAGACTGGATTAGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162466 ATGCCCCAGCAGACTGGATTAGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162516 GCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATGGAGTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162566 CTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGTCAAGCAG         CTCCCTCGCAAGTGAGTGGAGTAATGAAGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 162616 GGTCAAGCAGGTA...CAGCTCCCTCGCAAGTGAGTGGAGTAATGAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246951 GAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CCAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 247001 CCAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGTA...

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1450    GATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAAAAACCAAGTCTACTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249679 TAGGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAAAAACCAAGTCTACTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 AGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249729 AGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GGGCTTTTACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249779 GGGCTTTTACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GCTACACTAGAGGAAGCTACAG         CTACAGCTGTCTCCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 249829 GCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTA...CAGCTACAGCTGTCTCCAGTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 ACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254659 ACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 254709 TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGTA...AAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGCGATGAAGAGCTTTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255428 CACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGCGATGAAGAGCTTTACTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TCATT         TTAAATTTCCAGGCACCAAAACCTACATTGACCCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255478 TCATTGTA...CAGTTAAATTTCCAGGCACCAAAACCTACATTGACCCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AAACCTATGAGGACCCAAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259899 AAACCTATGAGGACCCAAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 259949 GATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAGGTA...CAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 AGAATTCGGTGAAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261059 AGAATTCGGTGAAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 ATGTTGCAGTAGCCATAAAAACCCTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261109 ATGTTGCAGTAGCCATAAAAACCCTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAACAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 AGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGACCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261159 AGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGACCACCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 GAATGTTGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAG         GGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 261209 GAATGTTGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGTA...TAGGGAAAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGAAAATGGAGCCCTAGATGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261825 CAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGAAAATGGAGCCCTAGATGCATTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 CTCAGG         AAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261875 CTCAGGGTA...CAGAAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 AGGAATGCTGAGAGGAATTGCTGCTGGAATGAGATATTTGGCTGATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263340 AGGAATGCTGAGAGGAATTGCTGCTGGAATGAGATATTTGGCTGATATGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATTCTTGTCAACAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263390 GATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATTCTTGTCAACAGCAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 CTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263440 CTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 TCCAGAAGCTGTCTATACAACTACT         GGTGGAAAAATTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 263490 TCCAGAAGCTGTCTATACAACTACTGTA...CAGGGTGGAAAAATTCCAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 TAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCACATCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264562 TAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCACATCAGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 AGTGATGTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264612 AGTGATGTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 AGAAAGACCTTATTGGGACATGTCAAATCAAGAT         GTTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 264662 AGAAAGACCTTATTGGGACATGTCAAATCAAGATGTA...TAGGTTATAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 AAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272364 AAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 GGCCTTCACCAGCTAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272414 GGCCTTCACCAGCTAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 GCCAAAATTTGAACAGATAGTTGGAATTCTAGACAAAATGATTCGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272464 GCCAAAATTTGAACAGATAGTTGGAATTCTAGACAAAATGATTCGAAACC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 CAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAG         GCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 272514 CAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAGGTA...TAGGCCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 ATAAGCCCTCTTCTGGATCAAAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273893 ATAAGCCCTCTTCTGGATCAAAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766 AGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGATGGAAAGATATAAAGATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273943 AGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGATGGAAAGATATAAAGATAATT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 TCACGGCAGCTGGCTACAACTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 273993 TCACGGCAGCTGGCTACAATTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 GA         GGATGTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGTCATCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274043 GAGTA...CAGGGATGTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGTCATCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 AAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCACAAATGCTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275841 AAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCACAAATGCTACATT

   3100     .    :    .    :
   2957 TACATGGAACTGGCATTCAAGTG
        |||||||||||||||||||||||
 275891 TACATGGAACTGGCATTCAAGTG