seq1 = pF1KB4120.tfa, 1353 bp
seq2 = pF1KB4120/gi568815588r_26648573.tfa (gi568815588r:26648573_26960863), 312291 bp

>pF1KB4120 1353
>gi568815588r:26648573_26960863 (Chr10)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-285  (137559-137726)   100% ->
286-477  (183623-183808)   95% ->
478-578  (190519-190619)   100% ->
579-719  (191872-192012)   100% ->
720-820  (195546-195646)   100% ->
821-994  (201629-201802)   100% ->
995-1180  (209081-209266)   100% ->
1181-1353  (212119-212291)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGCTGCAGATGTTACTAGAGGAGGAGATCCCGTCTGGCAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAACCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGCTGATCGAGAGTTACCAGAACCTGACTCGGGTGGCAGACTACTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAACAACTACATACAG         GCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAACAACTACATACAGGTG...CAGGCTACAGACAAGAGAAAAGCTTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAGACCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137583 GAGGAGACCAAAGCCTATACAACCCAATCTCTAGCTAGTGTTGCTTATCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAGTTGCTGGATATCCAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137633 AATAAATGCATTGGCCAACAATGTACTCCAGTTGCTGGATATCCAAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 137683 CTCAGCTTCGGAGAATGGAGTCTTCCATCAATCATATCTCACAGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    ACTGTGGATATTCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183620 TAGACTGTGGATATTCATAAGGAGAAAGTGGCACGAAGAGAGATTGGTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183670 TTTGACAACAAATAAGAATACATCAAGAACTCACAAAATAATAGCACCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183720 CGAATATGGAGCGCCCTGTAAGGTATATTCGGAAACCTATCGATTACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAGTGGCTAAAAGCCAAG     
        ||||||||||||||||||||||||||||||-|--|||--|-||  >>>..
 183770 GTTCTGGATGATGTGGGCCATGGTGTCAAG G  TAA  G CATTTTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478     CATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183814 .TAGCATGGAAATAACCAGCCTGCAAGAACTGGCACACTGTCGAGAACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190565 ATCCTCCTACTCAGAAACCGCCAAGTCCTCCCATGTCAGGCCGGGGAACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGGG         ACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAACCTGTTAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190615 CTGGGGTA...TAGACGGAATACTCCTTATAAAACCCTGGAACCTGTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191908 ACCCCCAACAGTTCCTAATGACTATATGACCAGTCCTGCTAGGCTTGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTCAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191958 GTCAGCATAGTCCAGGCAGGACAGCATCTTTAAATCAGAGACCAAGGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACAG         TGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192008 CACAGGTA...CAGTGGAAGTAGTGGAGGAAGTGGAAGTCGAGAAAACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195582 TGGTAGCAGTAGTATTGGCATTCCCATTGCTGTGCCTACACCTTCGCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCACTATTGGACCAG         CCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 195632 CCACTATTGGACCAGGTG...CAGCCCCGGGCTCAGCTCCTGGTTCCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201655 TATGGCACAATGACCAGGCAGATATCTCGACACAACTCTACTACTTCTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201705 GACATCTTCTGGTGGATACAGACGAACTCCCTCTGTGACTGCTCAATTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 201755 CTGCTCAGCCTCATGTTAATGGAGGTCCACTTTATTCTCAAAATTCAAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    995        TTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201805 A...TAGTTGCTGATAGTCCAACTCCACCGCCACCACCTCCACCAGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209124 CATTCCCATGTTTGATGACTCTCCACCTCCCCCACCACCACCACCAGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209174 ATTATGAAGATGAGGAGGCTGCAGTAGTTCAGTATAATGATCCATATGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 209224 GATGGGGATCCTGCTTGGGCCCCCAAGAATTATATTGAGAAAGGTA...T

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1181   TTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCAT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212117 AGTTGTTGCAATATATGATTATACAAAAGACAAGGATGATGAGCTGTCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212167 TTATGGAGGGTGCAATCATTTATGTTATAAAGAAGAATGATGATGGCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212217 TATGAAGGAGTCTGCAATCGAGTGACTGGTCTGTTCCCTGGGAACTATGT

   1400     .    :    .    :    .
   1329 TGAATCAATCATGCACTATACTGAT
        |||||||||||||||||||||||||
 212267 TGAATCAATCATGCACTATACTGAT