seq1 = pF1KB4108.tfa, 2931 bp
seq2 = pF1KB4108/gi568815585r_37536906.tfa (gi568815585r:37536906_37883333), 346428 bp

>pF1KB4108 2931
>gi568815585r:37536906_37883333 (Chr13)

(complement)

1-378  (100001-100378)   99% ->
379-897  (136879-137397)   100% ->
898-1234  (190999-191335)   100% ->
1235-1374  (208967-209106)   100% ->
1375-1688  (219605-219918)   100% ->
1689-1884  (228051-228246)   100% ->
1885-2079  (231875-232069)   100% ->
2080-2121  (244035-244076)   100% ->
2122-2211  (244205-244294)   100% ->
2212-2931  (245709-246428)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAGTTCTATTACAAAAGAAATGTTAATGCTCCCTATAGAGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCAGTTCTATTACAAAAGAAATGTTAATGCTCCCTATAGAGACCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCCCTCTAAGGATAGTAAGAGCAGAATCAGAACTTTCGCCATCAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100051 CATCCCTCTAAGGATAGTAAGAGCAGAATCAGAACTCTCGCCATCAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCCTACTTGAATGCTGTGGAAAAGGGAGATTATGCCAGTGTCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGCCTACTTGAATGCTGTGGAAAAGGGAGATTATGCCAGTGTCAAGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCTAGAGGAAGCTGAAATTTATTTTAAAATCAATATTAATTGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCTAGAGGAAGCTGAAATTTATTTTAAAATCAATATTAATTGCATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCTCTCGGAAGAACTGCTCTCCTCATTGCAATTGAAAATGAGAACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCTCTCGGAAGAACTGCTCTCCTCATTGCAATTGAAAATGAGAACTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCTCATCGAACTACTCTTAAGCTTTAATGTCTATGTTGGAGATGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCTCATCGAACTACTCTTAAGCTTTAATGTCTATGTTGGAGATGCTCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTACATGCTATCAGAAAAGAAGTCGTCGGAGCTGTTGAGCTGTTATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTACATGCTATCAGAAAAGAAGTCGTCGGAGCTGTTGAGCTGTTATTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCACAAAAAACCTAGTGGAGAAAAACAG         GTGCCTCCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100351 CCACAAAAAACCTAGTGGAGAAAAACAGGTA...TAGGTGCCTCCTATAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCTTGATAAGCAGTTCTCTGAATTCACTCCAGACATTACACCAATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136892 TCCTTGATAAGCAGTTCTCTGAATTCACTCCAGACATTACACCAATCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTGGCAGCCCATACAAATAATTATGAGATAATAAAACTCTTGGTTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136942 TTGGCAGCCCATACAAATAATTATGAGATAATAAAACTCTTGGTTCAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGGAGTCTCAGTGCCTCGACCCCACGAGGTCCGCTGTAACTGTGTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136992 AGGAGTCTCAGTGCCTCGACCCCACGAGGTCCGCTGTAACTGTGTGGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCGTGTCCAGTTCAGATGTGGACAGCCTCCGTCACTCACGCTCCAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137042 GCGTGTCCAGTTCAGATGTGGACAGCCTCCGTCACTCACGCTCCAGACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AACATCTACAAGGCCTTGGCCAGTCCCTCTCTCATTGCACTGTCAAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137092 AACATCTACAAGGCCTTGGCCAGTCCCTCTCTCATTGCACTGTCAAGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGATCCTTTTCTCACAGCCTTTCAGTTAAGTTGGGAACTTCAGGAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137142 AGATCCTTTTCTCACAGCCTTTCAGTTAAGTTGGGAACTTCAGGAACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCAAGGTGGAAAATGAATTCAAGTCGGAGTATGAAGAGCTGTCACGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137192 GCAAGGTGGAAAATGAATTCAAGTCGGAGTATGAAGAGCTGTCACGGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TGCAAACAATTTGCTAAGGACCTACTGGATCAGACGAGAAGTTCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137242 TGCAAACAATTTGCTAAGGACCTACTGGATCAGACGAGAAGTTCCAGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACTGGAAATCATTCTTAATTACCGAGATGACAATAGTCTCATAGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137292 ACTGGAAATCATTCTTAATTACCGAGATGACAATAGTCTCATAGAAGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AAAGTGGAAATGATCTTGCAAGACTAAAATTGGCCATTAAGTACCGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137342 AAAGTGGAAATGATCTTGCAAGACTAAAATTGGCCATTAAGTACCGTCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAAGAG         TTTGTTGCCCAGCCCAATTGTCAACAGCTGCTGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137392 AAAGAGGTG...TAGTTTGTTGCCCAGCCCAATTGTCAACAGCTGCTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ATCTCGCTGGTACGATGAGTTTCCAGGCTGGAGGAGAAGACACTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191034 ATCTCGCTGGTACGATGAGTTTCCAGGCTGGAGGAGAAGACACTGGGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGAAGATGGTGACATGTTTCATAATAGGACTTCTTTTTCCTGTCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191084 TGAAGATGGTGACATGTTTCATAATAGGACTTCTTTTTCCTGTCTTCTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTGTGCTACCTGATAGCTCCCAAAAGCCCACTTGGACTGTTCATCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191134 GTGTGCTACCTGATAGCTCCCAAAAGCCCACTTGGACTGTTCATCAGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCCATTTATCAAGTTTATCTGCCACACAGCCTCCTATTTGACTTTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191184 GCCATTTATCAAGTTTATCTGCCACACAGCCTCCTATTTGACTTTTTTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TCCTGCTGCTGCTTGCCTCTCAGCACATCGACAGGTCAGACTTGAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191234 TCCTGCTGCTGCTTGCCTCTCAGCACATCGACAGGTCAGACTTGAACAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CAAGGTCCACCACCAACCATCGTCGAGTGGATGATATTACCGTGGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191284 CAAGGTCCACCACCAACCATCGTCGAGTGGATGATATTACCGTGGGTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GG         GCTTCATATGGGGAGAAATTAAACAGATGTGGGATGGCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191334 GGGTA...CAGGCTTCATATGGGGAGAAATTAAACAGATGTGGGATGGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GACTTCAGGACTACATCCATGATTGGTGGAATCTAATGGACTTTGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209006 GACTTCAGGACTACATCCATGATTGGTGGAATCTAATGGACTTTGTAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AACTCCTTATATTTAGCAACAATCTCCTTGAAAATTGTTGCATTTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209056 AACTCCTTATATTTAGCAACAATCTCCTTGAAAATTGTTGCATTTGTAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 G         TACAGTGCCCTTAATCCACGAGAATCATGGGACATGTGGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209106 GGTA...CAGTACAGTGCCCTTAATCCACGAGAATCATGGGACATGTGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ATCCCACTCTGGTGGCAGAGGCTTTATTTGCTATTGCAAACATCTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219645 ATCCCACTCTGGTGGCAGAGGCTTTATTTGCTATTGCAAACATCTTCAGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 TCTCTGCGTCTGATCTCACTGTTTACTGCAAATTCTCACCTGGGACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219695 TCTCTGCGTCTGATCTCACTGTTTACTGCAAATTCTCACCTGGGACCTCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GCAAATATCTCTGGGAAGAATGCTCCTGGACATTTTGAAGTTTCTATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219745 GCAAATATCTCTGGGAAGAATGCTCCTGGACATTTTGAAGTTTCTATTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TATACTGCCTTGTGTTGCTAGCATTTGCAAATGGCCTAAATCAATTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219795 TATACTGCCTTGTGTTGCTAGCATTTGCAAATGGCCTAAATCAATTGTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 TTCTATTATGAAGAAACGAAAGGGTTAACCTGCAAAGGCATAAGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219845 TTCTATTATGAAGAAACGAAAGGGTTAACCTGCAAAGGCATAAGATGTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 AAAGCAGAATAATGCATTTTCAAC         GTTATTTGAGACACTGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 219895 AAAGCAGAATAATGCATTTTCAACGTA...CAGGTTATTTGAGACACTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AGTCCCTGTTTTGGTCAATATTTGGGCTCATCAATTTATATGTGACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228068 AGTCCCTGTTTTGGTCAATATTTGGGCTCATCAATTTATATGTGACCAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GTCAAAGCACAGCATGAATTTACTGAGTTTGTTGGTGCCACCATGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228118 GTCAAAGCACAGCATGAATTTACTGAGTTTGTTGGTGCCACCATGTTTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GACATACAATGTCATCTCTCTGGTTGTTCTACTCAACATGTTAATAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228168 GACATACAATGTCATCTCTCTGGTTGTTCTACTCAACATGTTAATAGCTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TGATGAATAATTCTTACCAACTGATTGCT         GACCATGCAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 228218 TGATGAATAATTCTTACCAACTGATTGCTGTA...CAGGACCATGCAGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 ATAGAATGGAAATTTGCACGAACAAAGCTTTGGATGAGTTATTTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231887 ATAGAATGGAAATTTGCACGAACAAAGCTTTGGATGAGTTATTTTGAAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 AGGAGGTACTCTGCCTACTCCCTTCAATGTCATCCCGAGCCCCAAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231937 AGGAGGTACTCTGCCTACTCCCTTCAATGTCATCCCGAGCCCCAAGTCTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 TCTGGTACCTGATCAAATGGATCTGGACACACTTGTGCAAGAAAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231987 TCTGGTACCTGATCAAATGGATCTGGACACACTTGTGCAAGAAAAAGATG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 AGAAGAAAGCCAGAAAGTTTTGGAACAATAGGG         AGGCGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 232037 AGAAGAAAGCCAGAAAGTTTTGGAACAATAGGGGTA...CAGAGGCGAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 TGCTGATAACTTGAGAAGACATCACCAATACCAA         GAAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 244043 TGCTGATAACTTGAGAAGACATCACCAATACCAAGTA...CAGGAAGTTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 TGAGGAACCTGGTGAAGCGATACGTTGCTGCAATGATTAGAGATGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244212 TGAGGAACCTGGTGAAGCGATACGTTGCTGCAATGATTAGAGATGCTAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 ACTGAAGAAGGCCTGACCGAAGAGAACTTTAAG         GAACTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 244262 ACTGAAGAAGGCCTGACCGAAGAGAACTTTAAGGTA...TAGGAACTAAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 GCAAGACATTTCTAGTTTCCGCTTTGAAGTCCTGGGATTACTAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245717 GCAAGACATTTCTAGTTTCCGCTTTGAAGTCCTGGGATTACTAAGAGGAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 GCAAACTTTCCACAATACAATCTGCGAATGCCTCGAAGGAGTCTTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245767 GCAAACTTTCCACAATACAATCTGCGAATGCCTCGAAGGAGTCTTCAAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 TCGGCAGACTCAGATGAAAAGAGTGATAGCGAAGGTAATAGCAAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245817 TCGGCAGACTCAGATGAAAAGAGTGATAGCGAAGGTAATAGCAAGGACAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 GAAAAAGAATTTCAGCCTTTTTGATTTAACCACCCTGATTCATCCGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245867 GAAAAAGAATTTCAGCCTTTTTGATTTAACCACCCTGATTCATCCGAGAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 CAGCAGCAATTGCCTCTGAAAGACATAACATAAGCAATGGCTCTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245917 CAGCAGCAATTGCCTCTGAAAGACATAACATAAGCAATGGCTCTGCCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 GTGGTTCAGGAGCCGCCCAGGGAGAAGCAGAGAAAAGTGAATTTTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245967 GTGGTTCAGGAGCCGCCCAGGGAGAAGCAGAGAAAAGTGAATTTTGTGAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 CGATATCAAAAACTTTGGGTTATTTCATAGACGATCAAAACAAAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246017 CGATATCAAAAACTTTGGGTTATTTCATAGACGATCAAAACAAAATGCTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 CTGAGCAAAATGCAAACCAAATCTTCTCTGTTTCAGAAGAAGTTGCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246067 CTGAGCAAAATGCAAACCAAATCTTCTCTGTTTCAGAAGAAGTTGCTCGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 CAACAGGCTGCAGGACCACTTGAGAGAAATATTCAACTGGAATCTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246117 CAACAGGCTGCAGGACCACTTGAGAGAAATATTCAACTGGAATCTCGAGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2670 ATTAGCTTCACGGGGTGACCTGAGCATTCCCGGTCTCAGTGAACAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246167 ATTAGCTTCACGGGGTGACCTGAGCATTCCCGGTCTCAGTGAACAATGTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2720 TGTTAGTAGACCATAGAGAAAGGAATACGGACACACTGGGGTTACAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246217 TGTTAGTAGACCATAGAGAAAGGAATACGGACACACTGGGGTTACAGGTA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2770 GGAAAGAGAGTGTGTCCATTCAAGTCAGAGAAGGTGGTGGTGGAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246267 GGAAAGAGAGTGTGTCCATTCAAGTCAGAGAAGGTGGTGGTGGAGGACAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2820 GGTTCCTATAATACCAAAGGAGAAACATGCAAAAGAAGAGGACTCTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246317 GGTTCCTATAATACCAAAGGAGAAACATGCAAAAGAAGAGGACTCTAGTA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2870 TAGACTATGATCTAAACCTCCCAGACACAGTCACCCACGAAGATTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246367 TAGACTATGATCTAAACCTCCCAGACACAGTCACCCACGAAGATTACGTG

   3000     .    :
   2920 ACCACAAGATTG
        ||||||||||||
 246417 ACCACAAGATTG