seq1 = pF1KB4107.tfa, 1923 bp
seq2 = pF1KB4107/gi568815586r_14687068.tfa (gi568815586r:14687068_14901383), 214316 bp

>pF1KB4107 1923
>gi568815586r:14687068_14901383 (Chr12)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-96  (100601-100632)   100% ->
97-190  (101656-101749)   100% ->
191-387  (104381-104577)   100% ->
388-521  (106280-106413)   100% ->
522-721  (106648-106847)   100% ->
722-913  (107462-107653)   100% ->
914-1015  (110114-110215)   100% ->
1016-1309  (110635-110928)   100% ->
1310-1492  (112251-112433)   100% ->
1493-1923  (113886-114316)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACGGAGATCTACATCATCCACCAAGAGTGGAAAATTTATGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACGGAGATCTACATCATCCACCAAGAGTGGAAAATTTATGAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAGACCAAGCCC         GAAAGGAAGCCCGGAAGAGAGAATTAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAGACCAAGCCCGTA...AAGGAAAGGAAGCCCGGAAGAGAGAATTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAG         AACAAAAAACAGCGCATGATGGTTCGAGCTGCAGTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100628 AGAAGGTA...AAGAACAAAAAACAGCGCATGATGGTTCGAGCTGCAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTAAAGATGAAGGATCCAAAACAGATAATCCGAGACATGGAGAAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101692 TTAAAGATGAAGGATCCAAAACAGATAATCCGAGACATGGAGAAATTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAATGG         AGTTTAACCCAGTGCAACAGCCACAATTAAATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101742 TGAAATGGGTA...TAGAGTTTAACCCAGTGCAACAGCCACAATTAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGAAAGTACTGAAAGACAAGCGTAAAAAGCTGCGTGAAACCTTTGAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104414 AGAAAGTACTGAAAGACAAGCGTAAAAAGCTGCGTGAAACCTTTGAACGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATTCTACGACTCTATGAAAAAGAGAATCCAGATATTTACAAAGAATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104464 ATTCTACGACTCTATGAAAAAGAGAATCCAGATATTTACAAAGAATTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGCTAGAAGTAGAATATGAACAGAAGAGGGCTCAACTTAGCCAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104514 AAAGCTAGAAGTAGAATATGAACAGAAGAGGGCTCAACTTAGCCAATATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGATGCTGTCAAG         AATGCTCAGCATGTGGAAGTGGAGAGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104564 TTGATGCTGTCAAGGTA...CAGAATGCTCAGCATGTGGAAGTGGAGAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTCCTTTGCCAGATATGCCACATGCTCCTTCCAACATTTTGATCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106307 ATTCCTTTGCCAGATATGCCACATGCTCCTTCCAACATTTTGATCCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATTCCACTTCCTGGTGCCCAGCCACCCTCTATCCTAAAGAAAACCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106357 CATTCCACTTCCTGGTGCCCAGCCACCCTCTATCCTAAAGAAAACCTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTATGG         ACCTCCAACTCGGGCAGTTTCTATCCTTCCTCTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106407 CCTATGGGTA...CAGACCTCCAACTCGGGCAGTTTCTATCCTTCCTCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTTGGACATGGTGTTCCACGTTTGCCCCCTGGCAGAAAACCTCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106682 CTTGGACATGGTGTTCCACGTTTGCCCCCTGGCAGAAAACCTCCTGGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCCCCCTGGTCCACCTCCTCCTCAAGTCGTGCAGATGTATGGCCGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106732 TCCCCCTGGTCCACCTCCTCCTCAAGTCGTGCAGATGTATGGCCGTAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGGTTTTGCCCTAGATCTTCCCCCTCGTAGGCGAGATGAAGACATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106782 TGGGTTTTGCCCTAGATCTTCCCCCTCGTAGGCGAGATGAAGACATGTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATAGTCCTGAACTTG         CCCAGCGAGGTCATGATGATGATGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 106832 TATAGTCCTGAACTTGGTG...CAGCCCAGCGAGGTCATGATGATGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTCTAGCACCAGTGAAGATGATGGCTATCCTGAGGACATGGATCAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107487 TTCTAGCACCAGTGAAGATGATGGCTATCCTGAGGACATGGATCAAGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCATGATGACAGTACTGATGACAGTGACACCGACAAATCAGATGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107537 AGCATGATGACAGTACTGATGACAGTGACACCGACAAATCAGATGGAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGTGACGGGGATGAATTTGTGCACCGTGATAATGGTGAGAGAGACAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107587 AGTGACGGGGATGAATTTGTGCACCGTGATAATGGTGAGAGAGACAACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGAAGAAAAGAAGTCAG         GTCTGAGTGTACGGTTTGCAGATA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107637 TGAAGAAAAGAAGTCAGGTA...TAGGTCTGAGTGTACGGTTTGCAGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGCCTGGAAAATCAAGGAAGAAAAAGAAGAACATGAAGGAACTGACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110138 TGCCTGGAAAATCAAGGAAGAAAAAGAAGAACATGAAGGAACTGACTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTTCAAGCCATGATGCTTCGTATGGCAG         GTCAAGAAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 110188 CTTCAAGCCATGATGCTTCGTATGGCAGGTG...CAGGTCAAGAAATCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGAGGAGGGACGGGAAGTAGAGGAATTTTCAGAGGACGATGATGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110648 TGAGGAGGGACGGGAAGTAGAGGAATTTTCAGAGGACGATGATGAAGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATTCTGATGACTCTGAAGCAGAAAAGCAATCACAAAAGCAGCATAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110698 ATTCTGATGACTCTGAAGCAGAAAAGCAATCACAAAAGCAGCATAAAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAATCCCATTCTGATGGCACATCCACTGCTTCTTCACAGCAGCAGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110748 GAATCCCATTCTGATGGCACATCCACTGCTTCTTCACAGCAGCAGGCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCCGCAGTCTGTTCCTCCTTCTCAGATACAAGCACCTCCCATGCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110798 GCCGCAGTCTGTTCCTCCTTCTCAGATACAAGCACCTCCCATGCCAGGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CACCACCTCTTGGACCACCACCTGCTCCACCATTACGGCCTCCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110848 CACCACCTCTTGGACCACCACCTGCTCCACCATTACGGCCTCCTGGGCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCTACAGGCCTTCCTCCTGGTCCACCTCCAG         GAGCTCCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110898 CCTACAGGCCTTCCTCCTGGTCCACCTCCAGGTA...CAGGAGCTCCTCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ATTCCTGAGACCACCTGGAATGCCAGGACTCCGAGGGCCCTTACCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112261 ATTCCTGAGACCACCTGGAATGCCAGGACTCCGAGGGCCCTTACCCCGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TTTTACCTCCAGGACCACCACCAGGCCGACCCCCTGGCCCTCCCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112311 TTTTACCTCCAGGACCACCACCAGGCCGACCCCCTGGCCCTCCCCCAGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCACCTCCAGGTCTGCCTCCTGGTCCCCCTCCTCGTGGACCCCCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112361 CCACCTCCAGGTCTGCCTCCTGGTCCCCCTCCTCGTGGACCCCCACCAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCTACCTCCCCCTGCACCTCCAG         GTATTCCTCCACCTCGTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 112411 GCTACCTCCCCCTGCACCTCCAGGTG...TAGGTATTCCTCCACCTCGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CTGGCATGATGCGCCCACCTTTGGTGCCTCCCCTTGGACCTGCCCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113904 CTGGCATGATGCGCCCACCTTTGGTGCCTCCCCTTGGACCTGCCCCCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GGGCTGTTCCCACCAGCTCCCTTGCCAAACCCTGGGGTTTTAAGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113954 GGGCTGTTCCCACCAGCTCCCTTGCCAAACCCTGGGGTTTTAAGTGCCCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 ACCCAACTTGATTCAGCGACCCAAGGCGGATGATACAAGTGCAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114004 ACCCAACTTGATTCAGCGACCCAAGGCGGATGATACAAGTGCAGCCACCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TTGAGAAGAAAGCCACAGCAACCATCAGTGCCAAGCCACAGATCACTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114054 TTGAGAAGAAAGCCACAGCAACCATCAGTGCCAAGCCACAGATCACTAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCCAAGGCAGAGATTACTCGATTTGTGCCCACTGCACTGAGAGTACGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114104 CCCAAGGCAGAGATTACTCGATTTGTGCCCACTGCACTGAGAGTACGTCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GGAGAATAAAGGGGCTACTGCTGCTCCCCAAAGAAAGTCAGAGGATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114154 GGAGAATAAAGGGGCTACTGCTGCTCCCCAAAGAAAGTCAGAGGATGATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CTGCTGTGCCTCTTGCCAAAGCAGCACCCAAATCTGGTCCTTCTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114204 CTGCTGTGCCTCTTGCCAAAGCAGCACCCAAATCTGGTCCTTCTGTTCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 GTCTCAGTACAAACTAAGGATGATGTCTATGAGGCTTTCATGAAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114254 GTCTCAGTACAAACTAAGGATGATGTCTATGAGGCTTTCATGAAAGAGAT

   2000     .    :
   1911 GGAAGGGCTACTG
        |||||||||||||
 114304 GGAAGGGCTACTG