seq1 = pF1KB4094.tfa, 1845 bp
seq2 = pF1KB4094/gi568815587r_64704337.tfa (gi568815587r:64704337_64910109), 205773 bp

>pF1KB4094 1845
>gi568815587r:64704337_64910109 (Chr11)

(complement)

1-460  (100001-100460)   100% ->
461-669  (102011-102219)   100% ->
670-798  (102430-102558)   100% ->
799-839  (102891-102931)   100% ->
840-927  (103012-103099)   100% ->
928-1064  (103742-103878)   100% ->
1065-1200  (104340-104475)   100% ->
1201-1365  (104912-105076)   99% ->
1366-1845  (105294-105773)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTGAAGGCCGCCCAGAAGACGCTGTTCCCGCTGCGCTCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTGAAGGCCGCCCAGAAGACGCTGTTCCCGCTGCGCTCCATCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGTGGTGCGCCTGTTTGCTGCCGAGCTGGGCCGAGAGGAGCCGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACGTGGTGCGCCTGTTTGCTGCCGAGCTGGGCCGAGAGGAGCCGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGCTCCTTTCCTTGGTGCTGGGCTTCGTGGAGCATTTTCTGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGCTCCTTTCCTTGGTGCTGGGCTTCGTGGAGCATTTTCTGGCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCGCGTCATCCCTACCAACGTTCCCGAGCTCACCTTCCAGCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACCGCGTCATCCCTACCAACGTTCCCGAGCTCACCTTCCAGCCCAGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCCCCGACCCGCCTGGCGGCCTCACCTACTTTCCCGTGGCCGACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCCCCGACCCGCCTGGCGGCCTCACCTACTTTCCCGTGGCCGACCTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTATCATCGCCGCCCTCTATGCCCGCTTCACCGCCCAGATCCGAGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTATCATCGCCGCCCTCTATGCCCGCTTCACCGCCCAGATCCGAGGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCGACCTGTCCCTCTATCCTCGAGAAGGGGGTGTCTCCAGCCGTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCGACCTGTCCCTCTATCCTCGAGAAGGGGGTGTCTCCAGCCGTGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTGAAGAAGGTCTCCGATGTCATATGGAACAGCCTCAGCCGCTCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTGAAGAAGGTCTCCGATGTCATATGGAACAGCCTCAGCCGCTCCTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAAGGATCGGGCCCACATCCAGTCCCTCTTCAGCTTCATCACAGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAAGGATCGGGCCCACATCCAGTCCCTCTTCAGCTTCATCACAGGTTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCCAGTAG         GCACCAAATTGGACAGCTCCGGTGTGGCCTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCCCAGTAGGTG...CAGGCACCAAATTGGACAGCTCCGGTGTGGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCTGTGGTTGGGGCCTGCCAGGCCCTGGGTCTCCGGGATGTCCACCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102042 TGCTGTGGTTGGGGCCTGCCAGGCCCTGGGTCTCCGGGATGTCCACCTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCTGTCTGAGGATCATGCCTGGGTAGTGTTTGGGCCCAATGGGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102092 CCCTGTCTGAGGATCATGCCTGGGTAGTGTTTGGGCCCAATGGGGAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACAGCTGAGGTCACCTGGCACGGCAAGGGCAACGAGGACCGCAGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102142 ACAGCTGAGGTCACCTGGCACGGCAAGGGCAACGAGGACCGCAGGGGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GACAGTCAATGCCGGTGTGGCTGAGCGG         AGCTGGCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102192 GACAGTCAATGCCGGTGTGGCTGAGCGGGTA...AAGAGCTGGCTGTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGAAAGGATCATACATGCGCTGTGACCGCAAGATGGAGGTGGCGTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102443 TGAAAGGATCATACATGCGCTGTGACCGCAAGATGGAGGTGGCGTTCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GTGTGTGCCATCAACCCTTCCATTGACCTGCACACCGACTCGCTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102493 GTGTGTGCCATCAACCCTTCCATTGACCTGCACACCGACTCGCTGGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCTGCAGCTGCAGCAG         AAGCTGCTCTGGCTGCTCTATGACC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102543 TCTGCAGCTGCAGCAGGTG...TAGAAGCTGCTCTGGCTGCTCTATGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGGGACATCTGGAAAG         GTACCCCATGGCCTTAGGGAACCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102916 TGGGACATCTGGAAAGGTC...TAGGTACCCCATGGCCTTAGGGAACCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCAGATCTAGAGGAGCTGGAGCCCACCCCTGGCCGGCCAGACCCACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103037 GCAGATCTAGAGGAGCTGGAGCCCACCCCTGGCCGGCCAGACCCACTCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCTCTACCACAAG         GGCATTGCCTCAGCCAAGACCTACTATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103087 CCTCTACCACAAGGTG...CAGGGCATTGCCTCAGCCAAGACCTACTATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGGATGAACACATCTACCCCTACATGTACCTGGCTGGCTACCACTGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103770 GGGATGAACACATCTACCCCTACATGTACCTGGCTGGCTACCACTGTCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AACCGCAATGTGCGGGAAGCCCTGCAGGCCTGGGCGGACACGGCCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103820 AACCGCAATGTGCGGGAAGCCCTGCAGGCCTGGGCGGACACGGCCACTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CATCCAGGA         CTACAACTACTGCCGGGAAGACGAGGAGATCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103870 CATCCAGGAGTG...CAGCTACAACTACTGCCGGGAAGACGAGGAGATCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ACAAGGAGTTCTTTGAAGTAGCCAATGATGTCATCCCCAACCTGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104372 ACAAGGAGTTCTTTGAAGTAGCCAATGATGTCATCCCCAACCTGCTGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGGCAGCCAGCTTGCTGGAGGCGGGCGAGGAGCGGCCGGGGGAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104422 GAGGCAGCCAGCTTGCTGGAGGCGGGCGAGGAGCGGCCGGGGGAGCAAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCAG         GGCACCCAGAGCCAAGGTTCCGCCCTCCAGGACCCTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104472 CCAGGTG...CAGGGCACCCAGAGCCAAGGTTCCGCCCTCCAGGACCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGTGCTTCGCCCACCTGCTGCGATTCTACGACGGCATCTGCAAATGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104949 AGTGCTTCGCCCACCTGCTGCGATTCTACGACGGCATCTGCAAATGGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GAGGGCAGTCCCACGCCTGTGCTGCACGTGGGCTGGGCCACCTTTCTTGT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 104999 GAGGGCAGTCCCACGCCTGTGCTGCATGTGGGCTGGGCCACCTTTCTTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GCAGTCCCTAGGCCGTTTTGAGGGACAG         GTGCGGCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105049 GCAGTCCCTAGGCCGTTTTGAGGGACAGGTG...CAGGTGCGGCAGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGCGCATAGTGAGCCGAGAGGCCGAGGCGGCCGAGGCCGAGGAGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105307 TGCGCATAGTGAGCCGAGAGGCCGAGGCGGCCGAGGCCGAGGAGCCGTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GGCGAGGAAGCCCGGGAAGGCCGGCGGCGGGGCCCACGGCGGGAGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105357 GGCGAGGAAGCCCGGGAAGGCCGGCGGCGGGGCCCACGGCGGGAGTCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GCCAGAGGAGCCCCCGCCGCCCAAGAAGCCAGCACTGGACAAGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105407 GCCAGAGGAGCCCCCGCCGCCCAAGAAGCCAGCACTGGACAAGGGCCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GCACCGGCCAGGGTGCAGTGTCAGGACCCCCCCGGAAGCCTCCTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105457 GCACCGGCCAGGGTGCAGTGTCAGGACCCCCCCGGAAGCCTCCTGGGACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GTCGCTGGCACAGCCCGAGGCCCTGAAGGTGGCAGCACGGCTCAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105507 GTCGCTGGCACAGCCCGAGGCCCTGAAGGTGGCAGCACGGCTCAGGTGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 AGCACCCGCAGCATCACCACCGCCGGAGGGTCCAGTGCTCACTTTCCAGA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105557 AGCACCCACAGCATCACCACCGCCGGAGGGTCCAGTGCTCACTTTCCAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 GTGAGAAGATGAAGGGCATGAAGGAGCTGCTGGTGGCCACCAAGATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105607 GTGAGAAGATGAAGGGCATGAAGGAGCTGCTGGTGGCCACCAAGATCAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TCGAGCGCCATCAAGCTGCAACTCACGGCACAGTCGCAAGTGCAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105657 TCGAGCGCCATCAAGCTGCAACTCACGGCACAGTCGCAAGTGCAGATGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 GAAGCAGAAAGTGTCCACCCCTAGTGACTACACTCTGTCTTTCCTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105707 GAAGCAGAAAGTGTCCACCCCTAGTGACTACACTCTGTCTTTCCTCAAGC

   1900     .    :    .
   1829 GGCAGCGCAAAGGCCTC
        |||||||||||||||||
 105757 GGCAGCGCAAAGGCCTC