seq1 = pF1KB4092.tfa, 1245 bp
seq2 = pF1KB4092/gi568815588r_43286640.tfa (gi568815588r:43286640_43487884), 201245 bp

>pF1KB4092 1245
>gi568815588r:43286640_43487884 (Chr10)

(complement)

1-1245  (100001-101245)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCTGGGCCCTGAGGGAGGTGAAGGCTTTGTGGTCAAGCTCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCTGGGCCCTGAGGGAGGTGAAGGCTTTGTGGTCAAGCTCCGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCCCTGGTCCTGCTCTGTTGAGGACGTGCAGAACTTCCTCTCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCCCTGGTCCTGCTCTGTTGAGGACGTGCAGAACTTCCTCTCTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCACGATTCATGATGGGGCCGCAGGTGTCCATTTCATCTACACTAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCACGATTCATGATGGGGCCGCAGGTGTCCATTTCATCTACACTAGAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAGGCAGAGTGGTGAGGCTTTTGTTGAACTTGGATCAGAAGATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAGGCAGAGTGGTGAGGCTTTTGTTGAACTTGGATCAGAAGATGATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAAATGGCCCTGAAAAAAGACAGGGAAAGCATGGGACACCGGTACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAAATGGCCCTGAAAAAAGACAGGGAAAGCATGGGACACCGGTACATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTGTTCAAGTCCCACAGAACCGAGATGGATTGGGTGTTGAAGCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGTGTTCAAGTCCCACAGAACCGAGATGGATTGGGTGTTGAAGCACAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTCCCAACAGTGCCGACAGCGCCAACGATGGCTTCGTGCGGCTTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTCCCAACAGTGCCGACAGCGCCAACGATGGCTTCGTGCGGCTTCGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTCCCATTTGGATGCACAAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTCCCATTTGGATGCACAAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAAATTGTGCCAAACGGGATCACATTGCCTGTGGACCCCGAAGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAAATTGTGCCAAACGGGATCACATTGCCTGTGGACCCCGAAGGCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTACAGGGGAAGCGTTCGTGCAGTTTGCCTCGCAGGAGTTAGCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTACAGGGGAAGCGTTCGTGCAGTTTGCCTCGCAGGAGTTAGCTGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCTCTAGGGAAACACAAGGAGAGGATAGGGCACAGGTACATTGAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCTCTAGGGAAACACAAGGAGAGGATAGGGCACAGGTACATTGAGGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTAAGAGCAGCCAGGAGGAAGTTAGGTCATACTCAGATCCCCCTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTAAGAGCAGCCAGGAGGAAGTTAGGTCATACTCAGATCCCCCTCTGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCATGTCCGTGCAGCGGCCAGGGCCCTATGACCGGCCCGGGACTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCATGTCCGTGCAGCGGCCAGGGCCCTATGACCGGCCCGGGACTGCCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGGTACATTGGCATCGTGAAGCAGGCAGGCCTGGAAAGGATGAGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAGGTACATTGGCATCGTGAAGCAGGCAGGCCTGGAAAGGATGAGGCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGCCTACAGCACAGGCTACGGGGGCTACGAGGAGTACAGTGGCCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGCCTACAGCACAGGCTACGGGGGCTACGAGGAGTACAGTGGCCTCAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATGGCTACGGCTTCACCACCGACCTGTTCGGGAGAGACCTCAGCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATGGCTACGGCTTCACCACCGACCTGTTCGGGAGAGACCTCAGCTACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTCTCCGGAATGTATGACCACAGATACGGCGACAGTGAGTTCACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTCTCCGGAATGTATGACCACAGATACGGCGACAGTGAGTTCACAGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAGCACCACAGGCCACTGTGTCCACATGAGGGGCCTGCCGTACAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAGCACCACAGGCCACTGTGTCCACATGAGGGGCCTGCCGTACAAAGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCGAGAACGACATTTACAACTTCTTCTCTCCTCTCAACCCTGTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCGAGAACGACATTTACAACTTCTTCTCTCCTCTCAACCCTGTGAGAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCATATTGAGATTGGCCCAGATGGAAGAGTGACGGGTGAAGCAGATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCATATTGAGATTGGCCCAGATGGAAGAGTGACGGGTGAAGCAGATGTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTTTGCTACTCATGAAGAAGCTGTGGCAGCTATGTCCAAAGACAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTTTGCTACTCATGAAGAAGCTGTGGCAGCTATGTCCAAAGACAGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AATATGCAGCACAGATATATAGAACTCTTCTTGAATTCAACAACAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AATATGCAGCACAGATATATAGAACTCTTCTTGAATTCAACAACAGGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAGCAATGGGGCGTATAGCAGCCAGGTGATGCAAGGCATGGGGGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAGCAATGGGGCGTATAGCAGCCAGGTGATGCAAGGCATGGGGGTGTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTGCCCAGGCCACTTACAGTGGCCTGGAGAGCCAGTCAGTGAGTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTGCCCAGGCCACTTACAGTGGCCTGGAGAGCCAGTCAGTGAGTGGCTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1201 TACGGGGCCGGCTACAGTGGGCAGAACAGCATGGGTGGCTATGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TACGGGGCCGGCTACAGTGGGCAGAACAGCATGGGTGGCTATGAC