Result of SIM4 for
pF1KB4084
seq1 = pF1KB4084.tfa, 2907 bp
seq2 = pF1KB4084/gi568815588f_5806102.tfa (gi568815588f:5806102_6037277), 231176 bp
>pF1KB4084 2907
>gi568815588f:5806102_6037277 (Chr10)
1-531 (100001-100531) 100% ->
532-662 (102824-102954) 100% ->
663-798 (103058-103193) 100% ->
799-989 (104837-105027) 100% ->
990-1082 (107646-107738) 100% ->
1083-1174 (108077-108168) 100% ->
1175-1343 (109302-109470) 100% ->
1344-1566 (110133-110355) 100% ->
1567-1654 (111319-111406) 100% ->
1655-1741 (111489-111575) 100% ->
1742-1878 (112241-112377) 100% ->
1879-1978 (115157-115256) 100% ->
1979-2100 (115347-115468) 100% ->
2101-2176 (117520-117595) 100% ->
2177-2374 (118210-118407) 100% ->
2375-2500 (119266-119391) 100% ->
2501-2607 (121334-121440) 100% ->
2608-2739 (130355-130486) 100% ->
2740-2907 (131009-131176) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCAAAAGCAATTCTGTTGGCCAGGACAGCTGTCAGGACTCTGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCCAAAAGCAATTCTGTTGGCCAGGACAGCTGTCAGGACTCTGAGGG
50 . : . : . : . : . :
51 TGACATGATCTTTCCTGCAGAGAGCAGCTGTGCACTGCCTCAGGAAGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGACATGATCTTTCCTGCAGAGAGCAGCTGTGCACTGCCTCAGGAAGGCA
100 . : . : . : . : . :
101 GTGCAGGGCCGGGCTCACCAGGGTCTGCCCCGCCCTCCAGGAAGCGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GTGCAGGGCCGGGCTCACCAGGGTCTGCCCCGCCCTCCAGGAAGCGGTCT
150 . : . : . : . : . :
151 TGGTCCTCTGAGGAAGAGAGTAACCAGGCTACCGGGACCAGCCGGTGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 TGGTCCTCTGAGGAAGAGAGTAACCAGGCTACCGGGACCAGCCGGTGGGA
200 . : . : . : . : . :
201 TGGAGTTTCTAAGAAAGCTCCACGGCACCATTTGTCTGTGCCATGCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TGGAGTTTCTAAGAAAGCTCCACGGCACCATTTGTCTGTGCCATGCACAA
250 . : . : . : . : . :
251 GGCCTAGGGAGGCCAGGCAAGAAGCAGAGGACAGTACGTCTCGGCTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GGCCTAGGGAGGCCAGGCAAGAAGCAGAGGACAGTACGTCTCGGCTCTCT
300 . : . : . : . : . :
301 GCGGAGTCTGGTGAAACCGACCAAGATGCTGGGGACGTGGGTCCTGATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GCGGAGTCTGGTGAAACCGACCAAGATGCTGGGGACGTGGGTCCTGATCC
350 . : . : . : . : . :
351 CATTCCTGACTCATACTATGGGCTTCTTGGGACCTTGCCCTGCCAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CATTCCTGACTCATACTATGGGCTTCTTGGGACCTTGCCCTGCCAGGAAG
400 . : . : . : . : . :
401 CACTGAGCCACATTTGCAGCCTGCCTAGTGAGGTCCTGAGGCACGTGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CACTGAGCCACATTTGCAGCCTGCCTAGTGAGGTCCTGAGGCACGTGTTT
450 . : . : . : . : . :
451 GCCTTCCTCCCGGTGGAAGACCTCTATTGGAACCTGAGCTTGGTGTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GCCTTCCTCCCGGTGGAAGACCTCTATTGGAACCTGAGCTTGGTGTGCCA
500 . : . : . : . : . :
501 CTTGTGGAGGGAGATCATCAGTGACCCGCTG TTCATTCCTT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
100501 CTTGTGGAGGGAGATCATCAGTGACCCGCTGGTG...TAGTTCATTCCTT
550 . : . : . : . : . :
542 GGAAGAAGCTGTACCATCGATACCTGATGAATGAAGAGCAAGCTGTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102834 GGAAGAAGCTGTACCATCGATACCTGATGAATGAAGAGCAAGCTGTCAGC
600 . : . : . : . : . :
592 AAAGTGGACGGCATCCTGTCTAACTGTGGCATAGAAAAGGAGTCAGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102884 AAAGTGGACGGCATCCTGTCTAACTGTGGCATAGAAAAGGAGTCAGACCT
650 . : . : . : . : . :
642 GTGTGTGCTGAACCTCATACG ATACACAGCCACCACTAAGT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
102934 GTGTGTGCTGAACCTCATACGGTG...CAGATACACAGCCACCACTAAGT
700 . : . : . : . : . :
683 GCTCTCCGAGTGTGGATCCCGAGAGGGTGCTGTGGAGTCTGAGGGACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103078 GCTCTCCGAGTGTGGATCCCGAGAGGGTGCTGTGGAGTCTGAGGGACCAC
750 . : . : . : . : . :
733 CCCCTCCTCCCCGAGGCTGAGGCGTGTGTGCGGCAACACCTCCCCGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103128 CCCCTCCTCCCCGAGGCTGAGGCGTGTGTGCGGCAACACCTCCCCGACCT
800 . : . : . : . : . :
783 CTACGCTGCTGCCGGG GGTGTCAACATCTGGGCCCTGGTGG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
103178 CTACGCTGCTGCCGGGGTA...CAGGGTGTCAACATCTGGGCCCTGGTGG
850 . : . : . : . : . :
824 CGGCTGTGGTGCTCCTCTCCAGCAGTGTGAATGACATCCAGCGACTGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104862 CGGCTGTGGTGCTCCTCTCCAGCAGTGTGAATGACATCCAGCGACTGCTC
900 . : . : . : . : . :
874 TTCTGCCTCCGGAGACCCAGCTCCACGGTGACCATGCCAGATGTCACCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104912 TTCTGCCTCCGGAGACCCAGCTCCACGGTGACCATGCCAGATGTCACCGA
950 . : . : . : . : . :
924 GACCCTGTACTGCATAGCCGTGCTTCTCTACGCCATGAGGGAGAAGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104962 GACCCTGTACTGCATAGCCGTGCTTCTCTACGCCATGAGGGAGAAGGGGA
1000 . : . : . : . : . :
974 TTAACATCAGCAATAG GATTCACTACAACATTTTCTATTGC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
105012 TTAACATCAGCAATAGGTA...TAGGATTCACTACAACATTTTCTATTGC
1050 . : . : . : . : . :
1015 CTATATCTTCAGGAGAATTCCTGCACTCAGGCCACAAAAGTTAAAGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107671 CTATATCTTCAGGAGAATTCCTGCACTCAGGCCACAAAAGTTAAAGAGGA
1100 . : . : . : . : . :
1065 GCCATCTGTCTGGCCAGG CAAGAAAACCATCCAACTTACAC
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
107721 GCCATCTGTCTGGCCAGGGTA...TAGCAAGAAAACCATCCAACTTACAC
1150 . : . : . : . : . :
1106 ATGAACAACAGCTGATTCTGAATCACAAGATGGAACCTCTCCAGGTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108100 ATGAACAACAGCTGATTCTGAATCACAAGATGGAACCTCTCCAGGTGGTG
1200 . : . : . : . : . :
1156 AAAATTATGGCCTTTGCCG GCACTGGGAAGACCTCAACGCT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
108150 AAAATTATGGCCTTTGCCGGTA...CAGGCACTGGGAAGACCTCAACGCT
1250 . : . : . : . : . :
1197 GGTCAAGTATGCAGAGAAGTGGTCTCAGAGCAGGTTTCTGTATGTGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109324 GGTCAAGTATGCAGAGAAGTGGTCTCAGAGCAGGTTTCTGTATGTGACAT
1300 . : . : . : . : . :
1247 TCAACAAGAGCATCGCAAAGCAGGCCGAACGCGTCTTCCCCAGCAACGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109374 TCAACAAGAGCATCGCAAAGCAGGCCGAACGCGTCTTCCCCAGCAACGTC
1350 . : . : . : . : . :
1297 ATCTGCAAAACCTTCCACTCCATGGCCTACGGGCACATAGGGCGGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
109424 ATCTGCAAAACCTTCCACTCCATGGCCTACGGGCACATAGGGCGGAAGTG
1400 . : . : . : . : . :
1344 GTACCAGTCAAAGAAGAAGTTGAATCTCTTCAAGTTAACACCCT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109474 ...CAGGTACCAGTCAAAGAAGAAGTTGAATCTCTTCAAGTTAACACCCT
1450 . : . : . : . : . :
1388 TCATGGTCAACTCCGTCCTTGCTGAAGGGAAGGGTGGATTCATAAGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110177 TCATGGTCAACTCCGTCCTTGCTGAAGGGAAGGGTGGATTCATAAGAGCC
1500 . : . : . : . : . :
1438 AAGCTTGTGTGTAAGACTCTAGAAAACTTCTTTGCCTCGGCTGACGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110227 AAGCTTGTGTGTAAGACTCTAGAAAACTTCTTTGCCTCGGCTGACGAAGA
1550 . : . : . : . : . :
1488 GCTGACCATTGATCACGTGCCTATTTGGTGTAAGAACAGCCAAGGACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110277 GCTGACCATTGATCACGTGCCTATTTGGTGTAAGAACAGCCAAGGACAGA
1600 . : . : . : . : . :
1538 GAGTCATGGTTGAGCAGAGTGAAAAACTG AATGGTGTCCTT
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
110327 GAGTCATGGTTGAGCAGAGTGAAAAACTGGTG...TAGAATGGTGTCCTT
1650 . : . : . : . : . :
1579 GAAGCGAGCCGCCTCTGGGATAACATGCGGAAGCTGGGGGAGTGCACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111331 GAAGCGAGCCGCCTCTGGGATAACATGCGGAAGCTGGGGGAGTGCACAGA
1700 . : . : . : . : . :
1629 AGAGGCGCACCAGATGACTCATGACG GCTACTTGAAACTCT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
111381 AGAGGCGCACCAGATGACTCATGACGGTA...TAGGCTACTTGAAACTCT
1750 . : . : . : . : . :
1670 GGCAGCTGAGCAAGCCTTCGCTGGCCTCTTTTGACGCCATCTTTGTGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111504 GGCAGCTGAGCAAGCCTTCGCTGGCCTCTTTTGACGCCATCTTTGTGGAT
1800 . : . : . : . : . :
1720 GAGGCCCAGGACTGCACACCAG CTATCATGAACATAGTTCT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
111554 GAGGCCCAGGACTGCACACCAGGTG...CAGCTATCATGAACATAGTTCT
1850 . : . : . : . : . :
1761 GTCTCAGCCATGTGGGAAAATCTTTGTAGGGGACCCGCACCAGCAGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112260 GTCTCAGCCATGTGGGAAAATCTTTGTAGGGGACCCGCACCAGCAGATCT
1900 . : . : . : . : . :
1811 ATACCTTCCGGGGTGCGGTCAACGCCCTGTTCACAGTGCCCCACACCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112310 ATACCTTCCGGGGTGCGGTCAACGCCCTGTTCACAGTGCCCCACACCCAC
1950 . : . : . : . : . :
1861 GTCTTCTATCTCACGCAG AGTTTTCGGTTTGGTGTGGAAAT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
112360 GTCTTCTATCTCACGCAGGTA...CAGAGTTTTCGGTTTGGTGTGGAAAT
2000 . : . : . : . : . :
1902 AGCTTATGTGGGAGCTACTATCTTGGATGTTTGCAAGAGAGTCAGGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115180 AGCTTATGTGGGAGCTACTATCTTGGATGTTTGCAAGAGAGTCAGGAAAA
2050 . : . : . : . : . :
1952 AGACTTTGGTTGGAGGAAACCATCAGA GTGGCATTAGAGGT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
115230 AGACTTTGGTTGGAGGAAACCATCAGAGTA...AAGGTGGCATTAGAGGT
2100 . : . : . : . : . :
1993 GACGCAAAGGGGCAAGTGGCCTTGTTGTCCCGGACCAACGCCAACGTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115361 GACGCAAAGGGGCAAGTGGCCTTGTTGTCCCGGACCAACGCCAACGTGTT
2150 . : . : . : . : . :
2043 TGATGAGGCCGTACGGGTGACGGAAGGGGAATTCCCTTCAAGGATACATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115411 TGATGAGGCCGTACGGGTGACGGAAGGGGAATTCCCTTCAAGGATACATT
2200 . : . : . : . : . :
2093 TGATTGGG GGGATTAAATCATTTGGATTGGACAGAATCATT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
115461 TGATTGGGGTA...CAGGGGATTAAATCATTTGGATTGGACAGAATCATT
2250 . : . : . : . : . :
2134 GATATTTGGATCCTTCTTCAGCCAGAGGAAGAACGGAGGAAAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
117553 GATATTTGGATCCTTCTTCAGCCAGAGGAAGAACGGAGGAAACGTG...T
2300 . : . : . : . : . :
2177 AAAACCTCGTCATTAAAGACAAATTTATCAGAAGATGGGTGCACAAAG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118208 AGAAAACCTCGTCATTAAAGACAAATTTATCAGAAGATGGGTGCACAAAG
2350 . : . : . : . : . :
2225 AAGGCTTTAGTGGCTTCAAGAGGTATGTGACCGCTGCCGAGGACAAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118258 AAGGCTTTAGTGGCTTCAAGAGGTATGTGACCGCTGCCGAGGACAAGGAG
2400 . : . : . : . : . :
2275 CTTGAAGCCAAGATCGCAGTTGTTGAAAAGTATAACATCAGGATTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118308 CTTGAAGCCAAGATCGCAGTTGTTGAAAAGTATAACATCAGGATTCCAGA
2450 . : . : . : . : . :
2325 GCTGGTGCAAAGGATAGAAAAATGCCATATAGAAGATTTGGACTTTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118358 GCTGGTGCAAAGGATAGAAAAATGCCATATAGAAGATTTGGACTTTGCAG
2500 . : . : . : . : . :
2375 AGTACATTCTGGGCACTGTGCACAAAGCCAAAGGCCTGGAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118408 GTA...TAGAGTACATTCTGGGCACTGTGCACAAAGCCAAAGGCCTGGAG
2550 . : . : . : . : . :
2416 TTTGACACTGTGCATGTTTTGGATGATTTTGTGAAAGTGCCTTGTGCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119307 TTTGACACTGTGCATGTTTTGGATGATTTTGTGAAAGTGCCTTGTGCCCG
2600 . : . : . : . : . :
2466 GCATAACCTGCCCCAGCTTCCGCACTTCAGAGTTG AGTCAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
119357 GCATAACCTGCCCCAGCTTCCGCACTTCAGAGTTGGTA...TAGAGTCAT
2650 . : . : . : . : . :
2507 TTTCTGAGGATGAATGGAATTTACTGTATGTTGCAGTAACTCGAGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121340 TTTCTGAGGATGAATGGAATTTACTGTATGTTGCAGTAACTCGAGCCAAG
2700 . : . : . : . : . :
2557 AAGCGTCTCATCATGACCAAATCATTGGAAAACATTTTGACTTTGGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121390 AAGCGTCTCATCATGACCAAATCATTGGAAAACATTTTGACTTTGGCTGG
2750 . : . : . : . : . :
2607 G GAGTACTTCTTGCAAGCAGAGCTGACAAGCAACGTCTTAA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121440 GGTA...CAGGAGTACTTCTTGCAAGCAGAGCTGACAAGCAACGTCTTAA
2800 . : . : . : . : . :
2648 AAACAGGCGTGGTGCGCTGCTGCGTGGGACAGTGCAACAATGCCATCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130395 AAACAGGCGTGGTGCGCTGCTGCGTGGGACAGTGCAACAATGCCATCCCT
2850 . : . : . : . : . :
2698 GTTGACACCGTCCTTACCATGAAGAAGCTGCCCATCACCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
130445 GTTGACACCGTCCTTACCATGAAGAAGCTGCCCATCACCTATGTA...CA
2900 . : . : . : . : . :
2740 AGCAACAGGAAGGAAAACAAGGGGGGCTACCTCTGCCACTCCTGTGCGG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131008 GAGCAACAGGAAGGAAAACAAGGGGGGCTACCTCTGCCACTCCTGTGCGG
2950 . : . : . : . : . :
2789 AGCAGCGCATCGGGCCCCTGGCGTTCCTGACAGCCTCCCCGGAGCAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131058 AGCAGCGCATCGGGCCCCTGGCGTTCCTGACAGCCTCCCCGGAGCAGGTG
3000 . : . : . : . : . :
2839 CGCGCCATGGAGCGCACTGTGGAGAACATCGTACTGCCCCGGCATGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131108 CGCGCCATGGAGCGCACTGTGGAGAACATCGTACTGCCCCGGCATGAGGC
3050 . : .
2889 CCTGCTCTTCCTCGTCTTC
|||||||||||||||||||
131158 CCTGCTCTTCCTCGTCTTC