Result of SIM4 for
pF1KB4032
seq1 = pF1KB4032.tfa, 3402 bp
seq2 = pF1KB4032/gi568815597r_223680856.tfa (gi568815597r:223680856_223921368), 240513 bp
>pF1KB4032 3402
>gi568815597r:223680856_223921368 (Chr1)
(complement)
1-27 (75689-75715) 100% ->
28-175 (100002-100149) 100% ->
176-289 (107016-107129) 100% ->
290-372 (110856-110938) 100% ->
373-474 (114422-114523) 100% ->
475-649 (117021-117195) 100% ->
650-831 (117917-118098) 100% ->
832-996 (118474-118638) 100% ->
997-1225 (119025-119253) 100% ->
1226-1336 (120559-120669) 100% ->
1337-1485 (121322-121470) 100% ->
1486-1948 (122692-123154) 100% ->
1949-2724 (124779-125554) 100% ->
2725-2862 (127929-128066) 100% ->
2863-2996 (128847-128980) 100% ->
2997-3163 (132195-132361) 100% ->
3164-3363 (137055-137254) 100% ->
3364-3402 (140475-140513) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCGGTTCGGGTCCAAGATGATGCCG ATGTTTCTTACCGT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
75689 ATGCGGTTCGGGTCCAAGATGATGCCGGTA...TAGATGTTTCTTACCGT
50 . : . : . : . : . :
42 GTATCTCAGTAACAATGAGCAGCACTTCACAGAAGTTCCAGTTACTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100016 GTATCTCAGTAACAATGAGCAGCACTTCACAGAAGTTCCAGTTACTCCAG
100 . : . : . : . : . :
92 AAACAATATGCAGAGACGTGGTGGATCTGTGCAAAGAACCCGGCGAGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100066 AAACAATATGCAGAGACGTGGTGGATCTGTGCAAAGAACCCGGCGAGAGT
150 . : . : . : . : . :
142 GATTGCCATTTGGCTGAAGTGTGGTGTGGCTCTG AACGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
100116 GATTGCCATTTGGCTGAAGTGTGGTGTGGCTCTGGTG...TAGAACGTCC
200 . : . : . : . : . :
183 AGTTGCGGATAATGAGCGAATGTTTGATGTTCTTCAACGATTTGGAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107023 AGTTGCGGATAATGAGCGAATGTTTGATGTTCTTCAACGATTTGGAAGTC
250 . : . : . : . : . :
233 AGAGGAACGAAGTTCGCTTCTTCCTTCGTCATGAACGCCCCCCTGGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107073 AGAGGAACGAAGTTCGCTTCTTCCTTCGTCATGAACGCCCCCCTGGCAGG
300 . : . : . : . : . :
283 GACATTG TGAGTGGACCAAGATCTCAGGATCCAAGTTTAAA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
107123 GACATTGGTA...TAGTGAGTGGACCAAGATCTCAGGATCCAAGTTTAAA
350 . : . : . : . : . :
324 AAGAAATGGTGTAAAAGTTCCTGGTGAATATCGAAGAAAGGAGAACGGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
110890 AAGAAATGGTGTAAAAGTTCCTGGTGAATATCGAAGAAAGGAGAACGGTG
400 . : . : . : . : . :
373 GTTAATAGTCCTAGGATGGATCTGACTCTTGCTGAACTTCAG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110940 TA...TAGGTTAATAGTCCTAGGATGGATCTGACTCTTGCTGAACTTCAG
450 . : . : . : . : . :
415 GAAATGGCATCTCGCCAGCAGCAACAGATTGAAGCCCAGCAACAATTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114464 GAAATGGCATCTCGCCAGCAGCAACAGATTGAAGCCCAGCAACAATTGCT
500 . : . : . : . : . :
465 GGCAACTAAG GAACAGCGCTTAAAGTTTTTGAAACAACAAG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
114514 GGCAACTAAGGTA...TAGGAACAGCGCTTAAAGTTTTTGAAACAACAAG
550 . : . : . : . : . :
506 ATCAGCGACAACAGCAACAAGTTGCTGAGCAGGAGAAACTTAAAAGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117052 ATCAGCGACAACAGCAACAAGTTGCTGAGCAGGAGAAACTTAAAAGGCTA
600 . : . : . : . : . :
556 AAAGAAATAGCTGAGAATCAGGAAGCTAAGCTAAAAAAAGTGAGAGCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117102 AAAGAAATAGCTGAGAATCAGGAAGCTAAGCTAAAAAAAGTGAGAGCACT
650 . : . : . : . : . :
606 TAAAGGCCACGTGGAACAGAAGAGACTAAGCAATGGGAAACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
117152 TAAAGGCCACGTGGAACAGAAGAGACTAAGCAATGGGAAACTTGGTG...
700 . : . : . : . : . :
650 TGGAGGAAATTGAACAGATGAATAATTTGTTCCAGCAAAAACAGAGG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117914 TAGTGGAGGAAATTGAACAGATGAATAATTTGTTCCAGCAAAAACAGAGG
750 . : . : . : . : . :
697 GAGCTCGTCCTGGCTGTGTCAAAAGTAGAAGAACTGACCAGGCAGCTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117964 GAGCTCGTCCTGGCTGTGTCAAAAGTAGAAGAACTGACCAGGCAGCTAGA
800 . : . : . : . : . :
747 GATGCTCAAGAACGGCAGGATCGACAGCCACCATGACAATCAGTCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118014 GATGCTCAAGAACGGCAGGATCGACAGCCACCATGACAATCAGTCTGCAG
850 . : . : . : . : . :
797 TGGCTGAGCTTGATCGCCTCTATAAGGAGCTGCAG CTAAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
118064 TGGCTGAGCTTGATCGCCTCTATAAGGAGCTGCAGGTA...CAGCTAAGA
900 . : . : . : . : . :
838 AACAAATTGAATCAAGAGCAGAATGCCAAGCTACAACAACAGAGGGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118480 AACAAATTGAATCAAGAGCAGAATGCCAAGCTACAACAACAGAGGGAGTG
950 . : . : . : . : . :
888 TTTGAATAAGCGTAATTCAGAAGTGGCAGTCATGGATAAGCGTGTTAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118530 TTTGAATAAGCGTAATTCAGAAGTGGCAGTCATGGATAAGCGTGTTAATG
1000 . : . : . : . : . :
938 AGCTGAGGGACCGGCTGTGGAAGAAGAAGGCAGCTCTACAGCAAAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118580 AGCTGAGGGACCGGCTGTGGAAGAAGAAGGCAGCTCTACAGCAAAAAGAA
1050 . : . : . : . : . :
988 AATCTACCA GTTTCATCTGATGGAAATCTTCCCCAGCAAGC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
118630 AATCTACCAGTA...AAGGTTTCATCTGATGGAAATCTTCCCCAGCAAGC
1100 . : . : . : . : . :
1029 CGCGTCAGCCCCAAGCCGTGTGGCTGCAGTAGGTCCCTATATCCAGTCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119057 CGCGTCAGCCCCAAGCCGTGTGGCTGCAGTAGGTCCCTATATCCAGTCGT
1150 . : . : . : . : . :
1079 CTACTATGCCTCGGATGCCCTCAAGGCCTGAATTGCTGGTGAAGCCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119107 CTACTATGCCTCGGATGCCCTCAAGGCCTGAATTGCTGGTGAAGCCAGCC
1200 . : . : . : . : . :
1129 CTGCCGGATGGTTCCTTGGTCATTCAGGCTTCAGAGGGGCCGATGAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119157 CTGCCGGATGGTTCCTTGGTCATTCAGGCTTCAGAGGGGCCGATGAAAAT
1250 . : . : . : . : . :
1179 ACAGACACTGCCCAACATGAGATCTGGGGCTGCTTCACAAACTAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
119207 ACAGACACTGCCCAACATGAGATCTGGGGCTGCTTCACAAACTAAAGGTA
1300 . : . : . : . : . :
1226 GCTCTAAAATCCATCCAGTTGGCCCTGATTGGAGTCCTTCAAAT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119257 ...TAGGCTCTAAAATCCATCCAGTTGGCCCTGATTGGAGTCCTTCAAAT
1350 . : . : . : . : . :
1270 GCAGATCTTTTCCCAAGCCAAGGCTCTGCTTCTGTACCTCAAAGCACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120603 GCAGATCTTTTCCCAAGCCAAGGCTCTGCTTCTGTACCTCAAAGCACTGG
1400 . : . : . : . : . :
1320 GAATGCTCTGGATCAAG TTGATGATGGAGAGGTTCCGCTGA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
120653 GAATGCTCTGGATCAAGGTG...TAGTTGATGATGGAGAGGTTCCGCTGA
1450 . : . : . : . : . :
1361 GGGAGAAAGAGAAGAAAGTGCGTCCGTTCTCAATGTTTGATGCAGTAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121346 GGGAGAAAGAGAAGAAAGTGCGTCCGTTCTCAATGTTTGATGCAGTAGAC
1500 . : . : . : . : . :
1411 CAGTCCAATGCCCCACCTTCCTTTGGTACTCTGAGGAAGAACCAGAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121396 CAGTCCAATGCCCCACCTTCCTTTGGTACTCTGAGGAAGAACCAGAGCAG
1550 . : . : . : . : . :
1461 TGAAGATATCTTGCGGGATGCTCAG GTTGCAAATAAAAATG
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
121446 TGAAGATATCTTGCGGGATGCTCAGGTA...TAGGTTGCAAATAAAAATG
1600 . : . : . : . : . :
1502 TGGCTAAAGTACCACCTCCTGTTCCTACAAAACCAAAACAGATTAATTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122708 TGGCTAAAGTACCACCTCCTGTTCCTACAAAACCAAAACAGATTAATTTG
1650 . : . : . : . : . :
1552 CCTTATTTTGGACAAACTAATCAGCCACCTTCAGACATTAAGCCAGACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122758 CCTTATTTTGGACAAACTAATCAGCCACCTTCAGACATTAAGCCAGACGG
1700 . : . : . : . : . :
1602 AAGTTCTCAGCAGTTGTCAACAGTTGTTCCGTCCATGGGAACTAAACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122808 AAGTTCTCAGCAGTTGTCAACAGTTGTTCCGTCCATGGGAACTAAACCAA
1750 . : . : . : . : . :
1652 AACCAGCAGGGCAGCAGCCGAGAGTGCTGCTATCTCCCAGCATACCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122858 AACCAGCAGGGCAGCAGCCGAGAGTGCTGCTATCTCCCAGCATACCTTCG
1800 . : . : . : . : . :
1702 GTTGGCCAAGACCAGACCCTTTCTCCAGGTTCTAAGCAAGAAAGTCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122908 GTTGGCCAAGACCAGACCCTTTCTCCAGGTTCTAAGCAAGAAAGTCCACC
1850 . : . : . : . : . :
1752 TGCTGCTGCCGTCCGGCCCTTTACTCCCCAGCCTTCCAAAGACACCTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122958 TGCTGCTGCCGTCCGGCCCTTTACTCCCCAGCCTTCCAAAGACACCTTAC
1900 . : . : . : . : . :
1802 TTCCACCCTTCAGAAAACCCCAGACCGTGGCAGCAAGTTCAATATATTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123008 TTCCACCCTTCAGAAAACCCCAGACCGTGGCAGCAAGTTCAATATATTCC
1950 . : . : . : . : . :
1852 ATGTATACGCAACAGCAGGCGCCAGGAAAAAACTTCCAGCAGGCTGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123058 ATGTATACGCAACAGCAGGCGCCAGGAAAAAACTTCCAGCAGGCTGTGCA
2000 . : . : . : . : . :
1902 GAGCGCGTTGACCAAGACTCATACCAGAGGGCCACACTTTTCAAGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
123108 GAGCGCGTTGACCAAGACTCATACCAGAGGGCCACACTTTTCAAGTGGTA
2050 . : . : . : . : . :
1949 TATATGGTAAGCCTGTAATTGCTGCTGCCCAGAATCAACAGCAG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123158 ...TAGTATATGGTAAGCCTGTAATTGCTGCTGCCCAGAATCAACAGCAG
2100 . : . : . : . : . :
1993 CACCCAGAGAACATTTATTCCAATAGCCAGGGCAAGCCTGGCAGTCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124823 CACCCAGAGAACATTTATTCCAATAGCCAGGGCAAGCCTGGCAGTCCAGA
2150 . : . : . : . : . :
2043 ACCTGAAACAGAGCCTGTTTCTTCAGTTCAGGAGAACCATGAAAACGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124873 ACCTGAAACAGAGCCTGTTTCTTCAGTTCAGGAGAACCATGAAAACGAAA
2200 . : . : . : . : . :
2093 GAATTCCTCGGCCACTCAGCCCAACTAAATTACTGCCTTTCTTATCTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124923 GAATTCCTCGGCCACTCAGCCCAACTAAATTACTGCCTTTCTTATCTAAT
2250 . : . : . : . : . :
2143 CCTTACCGAAACCAGAGTGATGCTGACCTAGAAGCCTTACGAAAGAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124973 CCTTACCGAAACCAGAGTGATGCTGACCTAGAAGCCTTACGAAAGAAACT
2300 . : . : . : . : . :
2193 GTCTAACGCACCAAGGCCTCTAAAGAAACGTAGTTCTATTACAGAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125023 GTCTAACGCACCAAGGCCTCTAAAGAAACGTAGTTCTATTACAGAGCCAG
2350 . : . : . : . : . :
2243 AGGGTCCTAATGGGCCAAATATTCAGAAGCTTTTATATCAGAGGACCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125073 AGGGTCCTAATGGGCCAAATATTCAGAAGCTTTTATATCAGAGGACCACC
2400 . : . : . : . : . :
2293 ATAGCGGCCATGGAGACCATCTCTGTCCCATCATACCCATCCAAGTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125123 ATAGCGGCCATGGAGACCATCTCTGTCCCATCATACCCATCCAAGTCAGC
2450 . : . : . : . : . :
2343 TTCTGTGACTGCCAGCTCAGAAAGCCCAGTAGAAATCCAGAATCCATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125173 TTCTGTGACTGCCAGCTCAGAAAGCCCAGTAGAAATCCAGAATCCATATT
2500 . : . : . : . : . :
2393 TACATGTGGAGCCCGAAAAGGAGGTGGTCTCTCTGGTTCCTGAATCATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125223 TACATGTGGAGCCCGAAAAGGAGGTGGTCTCTCTGGTTCCTGAATCATTG
2550 . : . : . : . : . :
2443 TCCCCAGAGGATGTGGGGAATGCCAGTACAGAGAACAGTGACATGCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125273 TCCCCAGAGGATGTGGGGAATGCCAGTACAGAGAACAGTGACATGCCAGC
2600 . : . : . : . : . :
2493 TCCTTCTCCAGGCCTTGATTATGAGCCTGAGGGAGTCCCAGACAACAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125323 TCCTTCTCCAGGCCTTGATTATGAGCCTGAGGGAGTCCCAGACAACAGCC
2650 . : . : . : . : . :
2543 CAAATCTCCAGAATAACCCAGAAGAACCAAATCCAGAGGCTCCACATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125373 CAAATCTCCAGAATAACCCAGAAGAACCAAATCCAGAGGCTCCACATGTG
2700 . : . : . : . : . :
2593 CTTGATGTGTACCTGGAGGAGTACCCTCCATACCCACCCCCACCATACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125423 CTTGATGTGTACCTGGAGGAGTACCCTCCATACCCACCCCCACCATACCC
2750 . : . : . : . : . :
2643 ATCTGGGGAGCCTGAAGGGCCCGGAGAAGACTCGGTGAGCATGCGCCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125473 ATCTGGGGAGCCTGAAGGGCCCGGAGAAGACTCGGTGAGCATGCGCCCGC
2800 . : . : . : . : . :
2693 CTGAAATCACCGGGCAGGTCTCTCTGCCTCCT GGTAAAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
125523 CTGAAATCACCGGGCAGGTCTCTCTGCCTCCTGTA...CAGGGTAAAAGG
2850 . : . : . : . : . :
2734 ACAAACTTGCGTAAAACTGGCTCAGAGCGTATCGCTCATGGAATGAGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127938 ACAAACTTGCGTAAAACTGGCTCAGAGCGTATCGCTCATGGAATGAGGGT
2900 . : . : . : . : . :
2784 GAAATTCAACCCCCTTGCTTTACTGCTAGATTCGTCTTTGGAGGGAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127988 GAAATTCAACCCCCTTGCTTTACTGCTAGATTCGTCTTTGGAGGGAGAAT
2950 . : . : . : . : . :
2834 TTGACCTTGTACAGAGAATTATTTATGAG GTTGATGACCCA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
128038 TTGACCTTGTACAGAGAATTATTTATGAGGTA...TAGGTTGATGACCCA
3000 . : . : . : . : . :
2875 AGCCTCCCCAATGATGAAGGCATCACGGCTCTTCACAATGCTGTGTGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128859 AGCCTCCCCAATGATGAAGGCATCACGGCTCTTCACAATGCTGTGTGTGC
3050 . : . : . : . : . :
2925 AGGCCACACAGAAATCGTTAAGTTCCTGGTACAGTTTGGTGTAAATGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128909 AGGCCACACAGAAATCGTTAAGTTCCTGGTACAGTTTGGTGTAAATGTAA
3100 . : . : . : . : . :
2975 ATGCTGCTGATAGTGATGGATG GACTCCATTACATTGTGCT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
128959 ATGCTGCTGATAGTGATGGATGGTA...CAGGACTCCATTACATTGTGCT
3150 . : . : . : . : . :
3016 GCCTCATGTAACAACGTCCAAGTGTGTAAGTTTTTGGTGGAGTCAGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132214 GCCTCATGTAACAACGTCCAAGTGTGTAAGTTTTTGGTGGAGTCAGGAGC
3200 . : . : . : . : . :
3066 CGCTGTGTTTGCCATGACCTACAGTGACATGCAGACTGCTGCAGATAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132264 CGCTGTGTTTGCCATGACCTACAGTGACATGCAGACTGCTGCAGATAAGT
3250 . : . : . : . : . :
3116 GCGAGGAAATGGAGGAAGGCTACACTCAGTGCTCCCAATTTCTTTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
132314 GCGAGGAAATGGAGGAAGGCTACACTCAGTGCTCCCAATTTCTTTATGGT
3300 . : . : . : . : . :
3164 GAGTTCAGGAGAAGATGGGCATAATGAATAAAGGAGTCATTTA
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132364 A...TAGGAGTTCAGGAGAAGATGGGCATAATGAATAAAGGAGTCATTTA
3350 . : . : . : . : . :
3207 TGCGCTTTGGGATTATGAACCTCAGAATGATGATGAGCTGCCCATGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137098 TGCGCTTTGGGATTATGAACCTCAGAATGATGATGAGCTGCCCATGAAAG
3400 . : . : . : . : . :
3257 AAGGAGACTGCATGACAATCATCCACAGGGAAGACGAAGATGAAATCGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137148 AAGGAGACTGCATGACAATCATCCACAGGGAAGACGAAGATGAAATCGAA
3450 . : . : . : . : . :
3307 TGGTGGTGGGCGCGCCTTAATGATAAGGAGGGATATGTTCCACGTAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137198 TGGTGGTGGGCGCGCCTTAATGATAAGGAGGGATATGTTCCACGTAACTT
3500 . : . : . : . : . :
3357 GCTGGGA CTGTACCCAAGAATTAAACCAAGACAAAGGAGCT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
137248 GCTGGGAGTA...CAGCTGTACCCAAGAATTAAACCAAGACAAAGGAGCT
3550 .
3398 TGGCC
|||||
140509 TGGCC