seq1 = pF1KB4014.tfa, 1407 bp
seq2 = pF1KB4014/gi568815590r_102550135.tfa (gi568815590r:102550135_102752398), 202264 bp

>pF1KB4014 1407
>gi568815590r:102550135_102752398 (Chr8)

(complement)

1-237  (99998-100235)   99% ->
238-1150  (100338-101250)   100% ->
1151-1407  (102008-102264)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GGAGGAAAGAATGGAAATGATTTCTGAAAGGCCAAAAGAGAGTATGT
        ||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 ATAGGAGGAAAGAATGGAAATGATTTCTGAAAGGCCAAAAGAGAGTATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 ATTCCTGGAACAAAACTGCAGAGAAAAGTGATTTTGAAGCTGTAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 ATTCCTGGAACAAAACTGCAGAGAAAAGTGATTTTGAAGCTGTAGAAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 CTTATGTCAATGAGCTGCAGTTGGAAGTCTGATTTTAAGAAATACGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 CTTATGTCAATGAGCTGCAGTTGGAAGTCTGATTTTAAGAAATACGTTGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 AAACAGACCTGTTACACCAGTATCTGATTTGTCAGAGGAAGAGAATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100148 AAACAGACCTGTTACACCAGTATCTGATTTGTCAGAGGAAGAGAATCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200 TTCCGGGAACACCTGATTTTCATACAATCCCAGCATTT         TGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100198 TTCCGGGAACACCTGATTTTCATACAATCCCAGCATTTGTA...TAGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 TTGACTCCACCTTACAGTCCTTCTGACTTTGAACCCTCTCAAGTGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100341 TTGACTCCACCTTACAGTCCTTCTGACTTTGAACCCTCTCAAGTGTCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291 TCTGATGGCACCAGCGCCATCTACTGTACACTTCAAGTCACTCTCAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100391 TCTGATGGCACCAGCGCCATCTACTGTACACTTCAAGTCACTCTCAGATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341 CTGCCAAACCTCACATTGCCGCACCTTTCAAAGAGGAAGAAAAGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100441 CTGCCAAACCTCACATTGCCGCACCTTTCAAAGAGGAAGAAAAGAGCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391 GTATCTGCCCCCAAACTCCCCAAAGCTCAGGCAACAAGTGTGATTCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100491 GTATCTGCCCCCAAACTCCCCAAAGCTCAGGCAACAAGTGTGATTCGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    441 TACAGCTGATGCCCAGCTATGTAACCACCAGACCTGCCCAATGAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100541 TACAGCTGATGCCCAGCTATGTAACCACCAGACCTGCCCAATGAAAGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    491 CCAGCATCCTCAACTATCAGAACAATTCTTTTAGAAGAAGAACCCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100591 CCAGCATCCTCAACTATCAGAACAATTCTTTTAGAAGAAGAACCCACCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    541 AATGTTGAGGCTGCAAGAAAGAACATACCATGTGCCGCTGTGTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100641 AATGTTGAGGCTGCAAGAAAGAACATACCATGTGCCGCTGTGTCACCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    591 CAGATCCAAATGTGAGAGAAACACAGTGGCAGATGTTGATGAGAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100691 CAGATCCAAATGTGAGAGAAACACAGTGGCAGATGTTGATGAGAAAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    641 GTGCTGCACTTTATGACTTTTCTGTGCCTTCCTCAGAGACGGTCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100741 GTGCTGCACTTTATGACTTTTCTGTGCCTTCCTCAGAGACGGTCATCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    691 AGGTCTCAGCCAGCCCCTGTGTCCCCACAACAGAAGTCAGTGTTGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100791 AGGTCTCAGCCAGCCCCTGTGTCCCCACAACAGAAGTCAGTGTTGGTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    741 TCCACCTGCAGTATCTGCAGGGGGAGTGCCACCTATGCCGGTCATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100841 TCCACCTGCAGTATCTGCAGGGGGAGTGCCACCTATGCCGGTCATCTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    791 AGATGGTTCCCCTTCCTGCCAACAACCCTGTTGTGACAACAGTCGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100891 AGATGGTTCCCCTTCCTGCCAACAACCCTGTTGTGACAACAGTCGTTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    841 AGCACTCCTCCCAGCCAGCCACCAGCCGTTTGCCCCCCTGTTGTGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100941 AGCACTCCTCCCAGCCAGCCACCAGCCGTTTGCCCCCCTGTTGTGTTCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    891 GGGCACACAAGTCCCCAAAGGCGCTGTCATGTTTGTGGTACCCCAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100991 GGGCACACAAGTCCCCAAAGGCGCTGTCATGTTTGTGGTACCCCAGCCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    941 TTGTGCAGAGTTCAAAGCCTCCGGTGGTGAGCCCGAATGGCACCAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101041 TTGTGCAGAGTTCAAAGCCTCCGGTGGTGAGCCCGAATGGCACCAGACTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    991 TCTCCCATTGCCCCTGCTCCTGGGTTTTCCCCTTCAGCAGCAAAAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101091 TCTCCCATTGCCCCTGCTCCTGGGTTTTCCCCTTCAGCAGCAAAAGTCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1041 TCCTCAGATTGATTCATCAAGGATAAGGAGTCACATCTGTAGCCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101141 TCCTCAGATTGATTCATCAAGGATAAGGAGTCACATCTGTAGCCACCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1091 GATGTGGCAAGACATACTTTAAAAGTTCCCATCTGAAGGCCCACACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101191 GATGTGGCAAGACATACTTTAAAAGTTCCCATCTGAAGGCCCACACGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141 ACGCACACAG         GAGAAAAGCCTTTCAGCTGTAGCTGGAAAGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101241 ACGCACACAGGTA...TAGGAGAAAAGCCTTTCAGCTGTAGCTGGAAAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1182 TTGTGAAAGGAGGTTTGCCCGTTCTGATGAACTGTCCAGACACAGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102039 TTGTGAAAGGAGGTTTGCCCGTTCTGATGAACTGTCCAGACACAGGCGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1232 CCCACACGGGTGAGAAGAAATTTGCGTGCCCCATGTGTGACCGGCGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102089 CCCACACGGGTGAGAAGAAATTTGCGTGCCCCATGTGTGACCGGCGGTTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282 ATGAGGAGTGACCATTTGACCAAGCATGCCCGGCGCCATCTATCAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102139 ATGAGGAGTGACCATTTGACCAAGCATGCCCGGCGCCATCTATCAGCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1332 GAAGCTACCAAACTGGCAGATGGAAGTGAGCAAGCTAAATGACATTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102189 GAAGCTACCAAACTGGCAGATGGAAGTGAGCAAGCTAAATGACATTGCTC

   1400     .    :    .    :    .
   1382 TACCTCCAACCCCTGCTCCCACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||
 102239 TACCTCCAACCCCTGCTCCCACACAG