seq1 = pF1KB3998.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KB3998/gi568815594r_22627412.tfa (gi568815594r:22627412_22827950), 200539 bp

>pF1KB3998 573
>gi568815594r:22627412_22827950 (Chr4)

(complement)

1-509  (100001-100509)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGACAATTAAGTGTGTTGTTGTGGGCGATGGTGCTGTTGGTAAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100001 ATGCAGACAATTAAGTGTGTTGTTGTGGGCGATGGTGCTGTTAGTAAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGTCTCCTGATATCCTACACAACAAACAAATTTCCATCGGAATATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGTCTCCTGATATCCTACACAACAAACAAATTTCCATCGGAATATGTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGACTGTTTTTGACAACTATGCAGTCACAGTTATGATTGGTGGAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGACTGTTTTTGACAACTATGCAGTCACAGTTATGATTGGTGGAGAACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATACTCTTGGACTTTTTGATACTGCAGGGCAAGAGGATTATGACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATACTCTTGGACTTTTTGATACTGCAGGGCAAGAGGATTATGACAGATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGACCGCTGAGTTATCCACAAACAGATGTATTTCTAGTCTGTTTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGACCGCTGAGTTATCCACAAACAGATGTATTTCTAGTCTGTTTTTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCTCTCCATCTTCATTTGAAAACGTGAAAGAAAAGTGGGTGCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCTCTCCATCTTCATTTGAAAATGTGAAAGAAAAGTGGGTGCCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATAACTCACCACTGTCCAAAGACTCCTTTCTTGCTTGTTGGGACTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100301 ATAACTCACCACTGTCCAAAGACTCCTTTTTTGCTTGTTGGGACTCAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATCTCAGAGATGACCCCTCTACTATTGAGAAACTTGCCAAGAACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100351 TGATCTCAGAGATGACCCCTCTACTATTGAGAAACCTGCCAAGAACAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAAGCCTATCACTCCAGAGACTGCTGAAAAGCTGGCCCGTGACCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAAGCCTATCACTCCAGAGACTGCTGAAAAGCTGGCCCGTGACCTGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGTCAAGTATGTGGAGTGTTCTGCACTTACACAGAGAGGTCTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||
 100451 GCTGTCAAGTATGTGGAGTGTTCTGCACTTACAAAGAAAGGCCTAAAGAA

    500     .
    501 TGTGTTTGA
        ||| |||||
 100501 TGTATTTGA