seq1 = pF1KB3982.tfa, 357 bp
seq2 = pF1KB3982/gi568815590r_55973093.tfa (gi568815590r:55973093_56174160), 201068 bp

>pF1KB3982 357
>gi568815590r:55973093_56174160 (Chr8)

(complement)

1-103  (99998-100101)   99% ->
104-177  (100393-100466)   100% ->
178-357  (100889-101068)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GGCTTTTAAGGATACCGGAAAAACACCCGTGGAGCCGGAGGTGGCAA
        ||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 ATAGGCTTTTAAGGATACCGGAAAAACACCCGTGGAGCCGGAGGTGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 TTCACCGAATTCGAATCACCCTAACAAGCCGCAACGTAAAATCCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 TTCACCGAATTCGAATCACCCTAACAAGCCGCAACGTAAAATCCTTGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 AAGG         TGTGTGCTGACTTGATAAGAGGCGCAAAAGAAAAGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 AAGGGTC...TAGTGTGTGCTGACTTGATAAGAGGCGCAAAAGAAAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 TCTCAAAGTGAAAGGACCAGTTCGAATGCCTACCAAG         ACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100430 TCTCAAAGTGAAAGGACCAGTTCGAATGCCTACCAAGGTA...CAGACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    182 TGAGAATCACTACAAGAAAAACTCCTTGTGGTGAAGGTTCTAAGACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100893 TGAGAATCACTACAAGAAAAACTCCTTGTGGTGAAGGTTCTAAGACGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 GATCGTTTCCAGATGAGAATTCACAAGCGACTCATTGACTTGCACAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100943 GATCGTTTCCAGATGAGAATTCACAAGCGACTCATTGACTTGCACAGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 TTCTGAGATTGTTAAGCAGATTACTTCCATCAGTATTGAGCCAGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100993 TTCTGAGATTGTTAAGCAGATTACTTCCATCAGTATTGAGCCAGGAGTTG

    350     .    :    .    :    .
    332 AGGTGGAAGTCACCATTGCAGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||
 101043 AGGTGGAAGTCACCATTGCAGATGCT