seq1 = pF1KB3940.tfa, 513 bp
seq2 = pF1KB3940/gi568815586r_92044083.tfa (gi568815586r:92044083_92245535), 201453 bp

>pF1KB3940 513
>gi568815586r:92044083_92245535 (Chr12)

(complement)

1-148  (100001-100148)   100% ->
149-513  (101089-101453)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATCCCTTCTACACCCGGGCCGCCACCATGATAGGCGAGATCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATCCCTTCTACACCCGGGCCGCCACCATGATAGGCGAGATCGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGTGTCCTTCATCTCCAAGTTTCTCCGCACCAAGGGGCTCACGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCGTGTCCTTCATCTCCAAGTTTCTCCGCACCAAGGGGCTCACGAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCGACAGCTGCAGACCTTCAGCCAGAGCCTGCAGGAGCTGCTGGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100101 AGCGACAGCTGCAGACCTTCAGCCAGAGCCTGCAGGAGCTGCTGGCAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149        AACATTATAAACATCACTGGTTCCCAGAAAAGCCATGCAAGGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 G...TAGAACATTATAAACATCACTGGTTCCCAGAAAAGCCATGCAAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATCGGGTTACCGTTGTATTCGCATCAACCATAAAATGGATCCTCTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101132 ATCGGGTTACCGTTGTATTCGCATCAACCATAAAATGGATCCTCTGATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACAGGCAGCACAGCGGATTGGACTGAGCAGTCAGGAGCTGTTCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101182 GACAGGCAGCACAGCGGATTGGACTGAGCAGTCAGGAGCTGTTCAGGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCCCAAGTGAACTCACACTCTGGGTTGACCCCTATGAAGTGTCCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101232 CTCCCAAGTGAACTCACACTCTGGGTTGACCCCTATGAAGTGTCCTACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AATTGGAGAGGATGGCTCCATCTGTGTGCTGTATGAAGCCTCACCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101282 AATTGGAGAGGATGGCTCCATCTGTGTGCTGTATGAAGCCTCACCAGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAGGTAGCACTCAAAACAGCACCAACGTGCAAATGGTAGACAGCCGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101332 GAGGTAGCACTCAAAACAGCACCAACGTGCAAATGGTAGACAGCCGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGCTGTAAGGAGGAACTTCTCTTGGGCAGAACGAGCCCTTCCAAAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101382 AGCTGTAAGGAGGAACTTCTCTTGGGCAGAACGAGCCCTTCCAAAAACTA

    500     .    :    .    :
    492 CAATATGATGACTGTATCAGGT
        ||||||||||||||||||||||
 101432 CAATATGATGACTGTATCAGGT