seq1 = pF1KB3929.tfa, 774 bp
seq2 = pF1KB3929/gi568815576f_20759111.tfa (gi568815576f:20759111_20987833), 228723 bp

>pF1KB3929 774
>gi568815576f:20759111_20987833 (Chr22)

1-237  (100001-100237)   100% ->
238-434  (111227-111423)   100% ->
435-520  (121939-122024)   100% ->
521-619  (124361-124459)   100% ->
620-774  (128569-128723)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGCTTACCCTAAAAGCTACAATCCGTTCGACGACGACGGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGCTTACCCTAAAAGCTACAATCCGTTCGACGACGACGGGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAGGCGCCCGGCCGGCCCCTTGGAGGGACGCCCGAGACCTCCCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAAGGCGCCCGGCCGGCCCCTTGGAGGGACGCCCGAGACCTCCCCGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCCGACGCGCCCGCGGACAGGCAGCAGTACTTGCGGCAGGAGGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCCGACGCGCCCGCGGACAGGCAGCAGTACTTGCGGCAGGAGGTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCAGGGCTGAGGCCACGGCCGCCAGCACCAGCAGGTCCCTGGCCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCAGGGCTGAGGCCACGGCCGCCAGCACCAGCAGGTCCCTGGCCCTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTACGAGTCCGAGAAGGTTGGGGTCGCCTCTTCCGAG         GAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100201 GTACGAGTCCGAGAAGGTTGGGGTCGCCTCTTCCGAGGTG...CAGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGCCCGTCAGCGAGGAGTCCTGGAGCGCACAGAGAAGATGGTGGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111231 TCGCCCGTCAGCGAGGAGTCCTGGAGCGCACAGAGAAGATGGTGGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGGACCAAGATTTGAAGATCAGCCAGAAACACATCAATAGCATTAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111281 ATGGACCAAGATTTGAAGATCAGCCAGAAACACATCAATAGCATTAAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGTGTTTGGGGGGCTGGTCAATTACTTCAAATCCAAACCAGTAGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111331 CGTGTTTGGGGGGCTGGTCAATTACTTCAAATCCAAACCAGTAGAGACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CACCTGAACAGAATGGCACCCTCACCTCCCAGCCCAACAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111381 CACCTGAACAGAATGGCACCCTCACCTCCCAGCCCAACAACAGGTG...A

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    435   ATTGAAAGAAGCTATAAGTACAAGTAAAGAACAGGAAGCAAAGTACCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121937 AGATTGAAAGAAGCTATAAGTACAAGTAAAGAACAGGAAGCAAAGTACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCCAGCCACCCAAACCTTAGAAAGCTGGATGATACAG         ACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 121987 GGCCAGCCACCCAAACCTTAGAAAGCTGGATGATACAGGTA...TAGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGTCCCCAGAGGGGCTGGTTCTGCCATGAGTACTGATGCTTACCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124364 CTGTCCCCAGAGGGGCTGGTTCTGCCATGAGTACTGATGCTTACCCAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACCCACACCTTCGAGCCTATCACCAGAAGATCGACAGCAACCTAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124414 AACCCACACCTTCGAGCCTATCACCAGAAGATCGACAGCAACCTAGGTA.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    620      ATGAGCTGTCCATGGGACTGGGTCGTCTGAAGGACATAGCCCTGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124464 ..CAGATGAGCTGTCCATGGGACTGGGTCGTCTGAAGGACATAGCCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGATGCAGACAGAAATTGAGGAGCAAGATGACATTCTTGACCGGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128614 GGATGCAGACAGAAATTGAGGAGCAAGATGACATTCTTGACCGGCTGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACCAAAGTGGACAAGTTAGATGTCAACATAAAAAGCACAGAAAGAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128664 ACCAAAGTGGACAAGTTAGATGTCAACATAAAAAGCACAGAAAGAAAAGT

    800     .    :
    765 TCGACAACTC
        ||||||||||
 128714 TCGACAACTC