seq1 = pF1KB3911.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KB3911/gi568815591f_63793285.tfa (gi568815591f:63793285_63994641), 201357 bp

>pF1KB3911 1362
>gi568815591f:63793285_63994641 (Chr7)

1-1362  (99999-101357)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTAAAAGAGAAGCAGAGGAGCTGATAGAAATTGAGATTGATGGAAC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 ACGACTAAAAGAGAAGCAGAGGAGCTGATAGAAATTGAGATTGATGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGAAAGCAGAGTGCACAGAAGAAAGCATTGTAGAACAAACCTACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 AGAGAAAGCAGAGTGCACAGAAGAAAGCATTGTAGAACAAACCTACGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCTGAATGTGTAAGCCAGGCCATAGACATCAATGAACCAATAGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 CAGCTGAATGTGTAAGCCAGGCCATAGACATCAATGAACCAATAGGCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTAAAGAAACTGCTAGAACCAAGACTACAGTGTTCTTTGGATGCTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 TTAAAGAAACTGCTAGAACCAAGACTACAGTGTTCTTTGGATGCTCATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATTTGTCTGCAAGATATCCAGCTGGATCCAGAACGAAGTTTATTTGACC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100199 AATTTGTCTGCAAGATATCCACCTGGATCCAGAACGAAGTTTATTTGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGGAGTAAAAACAGATGGAACTGTACAGCTTAGTGTACAGGTAATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 AAGGAGTAAAAACAGATGGAACTGTACAGCTTAGTGTACAGGTAATTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACCAAGGAATTGAACCAAAGTTAAACATCCTTGAAATTGTTAAACCTGC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 TATCAAGGAATTGAACCAAAGTTAAACATCCTTGAAATTGTTAAACCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACACTGTTGAGGTTGTTATTGATCCAGATGCCCACCATGCTGAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100349 GGACACTGTTGAGGTTGTTATTGATCCAGATGCCCACCATGCTGAATCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGCACATCTTGTTGAAGAAGCTCAAGTGATAACTCTTGATGGCACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 AAGCACATCTTGTTGAAGAAGCTCAAGTGATAACTCTTGATGGCACAAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACATCACAACCATTTCAGATGAAACTTCAGAACAAGTGACAAGATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 CACATCACAACCATTTCAGATGAAACTTCAGAACAAGTGACAAGATGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTGCACTGGAAGGCTATAGGAAAGAACAAGAACGCCTTGGGATACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 TGCTGCACTGGAAGGCTATAGGAAAGAACAAGAACGCCTTGGGATACCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGATCCCATACAGTGGTCCACAGACCAAGTCCTGCATTGGGTGGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 ATGATCCCATACAGTGGTCCACAGACCAAGTCCTGCATTGGGTGGTTTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTAATGAAGGAATTCAGCATGACCGATATAGACCTCACCACACTCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100599 GTAATGAAGGAATTCAGCATGACCGATATAGACCTCACCACACTCAACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCGGGGAGAGAATTATGTAGTCTCAACCAAGAAGATTTTTTTCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100649 TTCGGGGAGAGAATTATGTAGTCTCAACCAAGAAGATTTTTTTCAGCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCCTCGGGGAGAAATTCTCTGGAGTCATCTGGAACTTCTCCGAAAATAT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100699 TTCCTCAGGGAGAAATTCTCTGGAGTCATCTGGAACTTCTCCGAAAATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTATTGGCAAGTCAAGAACAACAGATGAATGAAATAGTTACAATTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 GTATTGGCAAGTCAAGAACAACAGATGAATGAAATAGTTACAATTGATCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCTGTGCAAATTATTCCAGCATCAGTGCAATCTGCTACACCTACTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 ACCTGTGCAAATTATTCCAGCATCAGTGCAATCTGCTACACCTACTACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTAAAGTTATAAATAGTAGTGCGAAAGCAGCCAAAGTACAAAGAGCGCCG
        ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
 100849 TTAAAGTTATAAATAGTAGTGTGAAGGCAGCCAAAGTACAAAGAGCGCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGGATTTCAGGAGAAGATAGAAGCTCACCTGGGAACAGAACAGGAAACAA
        ||||||||||-|--||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100899 AGGATTTCAG A  AGATAGAAGCTCACCTGGGAACAGAACAGGAAACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGCCAAATCCAACTATGGCAGTTTTTGCTAGAACTTCTTACTGATAAGG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100946 TGGCCAAATCCAACTATGACAGTTTTTGCTAGAACTTCTTACTGATAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACGCTCGAGACTGCATTTCTTGGGTTGGTGATGAAGGTGAATTTAAGCTA
        ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100996 ACGCTCGAGACTGTATTTCTTGGGTTGGTGATAAAGGTGAATTTAAGCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 AATCAGCCTGAACTGGTTGCACAGAAATGGGGACAGCGTAAAAATAAGCC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 101046 AATCAGCCTGAACTGGTTGCACAAAAATGGGGACAGCGTAAAAATAAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TACGATGAACTATGAGAAACTCAGTCGTGCATTAAGATATTATTACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 101096 TACGATGAACTATGAGAAACTCAGTCGTGCATTAAGATATTATTATGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGGACATGATTTGTAAAGTTCAAGGCAAGAGATTTGTGTACAAGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101146 GGGACATGATTTGTAAAGTTCAAGGCAAGAGATTTGTGTACAAGTTTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TGTGACTTGAAGACTCTTATTGGATACAGTGCAGCGGAGTTGAACCGTTT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 101196 TGTGACTTGAAGACTCTTACTGGATACAGTGCAGCGGAGTTGAACCGTTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGTCACAGAATGTGAACAGAAGAAACTTGCAAAGATGCAGCTCCATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101246 GGTCACAGAATGTGAACAGAAGAAACTTGCAAAGATGCAGCTCCATGGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTGCCCAGCCAGTCACAGCAGTAGCTCTGGCTACTGCTTCTCTGCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101296 TTGCCCAGCCAGTCACAGCAGTAGCTCTGGCTACTGCTTCTCTGCAAACG

   1350     .    :
   1351 GAAAAGGATAAT
        ||||||||||||
 101346 GAAAAGGATAAT