seq1 = pF1KB3876.tfa, 495 bp
seq2 = pF1KB3876/gi568815592r_34317509.tfa (gi568815592r:34317509_34525221), 207713 bp

>pF1KB3876 495
>gi568815592r:34317509_34525221 (Chr6)

(complement)

1-150  (100001-100150)   100% ->
151-322  (100382-100553)   98% ->
323-400  (103415-103492)   100% ->
401-456  (106798-106853)   100% ->
457-495  (107675-107713)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGATGCCTAAGAAGAACCGGATTGCCATTTATGAACTCCTTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGATGCCTAAGAAGAACCGGATTGCCATTTATGAACTCCTTTTTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGGAGTCATGGTGGCCAAGAAGGATGTCCACATGCCTAAGCACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGGAGTCATGGTGGCCAAGAAGGATGTCCACATGCCTAAGCACCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGGCAGACAAGAATGTGCCCAACCTTCATGTCATGAAGGCCATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGGCAGACAAGAATGTGCCCAACCTTCATGTCATGAAGGCCATGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151          TCTCTCAAGTCCCGAGGCTACGTGAAGGAACAGTTTGCCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTA...CAGTCTCTCAAGTCCCGAGGCTACGTGAAGGAACAGTTTGCCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGACATTTCTACTGGTACCTTACCAATGAGGGTATCCAGTATCTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100423 GAGACATTTCTACTGGTACCTTACCAATGAGGGTATCCAGTATCTCCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTACCTTCATCTGCCCCCAGAGATTGTGCCTGCCATCCTACGCCGTAGC
        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
 100473 ATTACCTTCATCTGCCCCCGGAGATTGTGCCTGCCACCCTACGCCGTAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGTCCAGAGACTGGCAGGCCTCGGCCTAAAG         GTCTGGAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100523 CGTCCAGAGACTGGCAGGCCTCGGCCTAAAGGTA...TAGGTCTGGAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAGCGACCTGCGAGACTCACAAGAGGGGAAGCTGACAGAGATACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103425 TGAGCGACCTGCGAGACTCACAAGAGGGGAAGCTGACAGAGATACCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GACGGAGTGCTGTGCCAC         CTGGTGCCGACAAGAAAGCCGAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103475 GACGGAGTGCTGTGCCACGTG...TAGCTGGTGCCGACAAGAAAGCCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGGGGCTGGGTCAGCAACCGAATTCCAGTTT         AGAGGCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106821 GCTGGGGCTGGGTCAGCAACCGAATTCCAGTTTGTG...CAGAGAGGCGG

    500     .    :    .    :    .    :
    465 ATTTGGTCGTGGACGTGGTCAGCCACCTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 107683 ATTTGGTCGTGGACGTGGTCAGCCACCTCAG