seq1 = pF1KB3864.tfa, 3426 bp
seq2 = pF1KB3864/gi568815596f_219527993.tfa (gi568815596f:219527993_219741725), 213733 bp

>pF1KB3864 3426
>gi568815596f:219527993_219741725 (Chr2)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-217  (100413-100578)   100% ->
218-495  (101152-101429)   99% ->
496-611  (101588-101703)   100% ->
612-892  (102080-102360)   100% ->
893-970  (103976-104053)   100% ->
971-1007  (104982-105017)   94% ->
1008-1191  (105282-105465)   100% ->
1192-1291  (105888-105987)   100% ->
1292-1476  (106428-106612)   100% ->
1477-1702  (107279-107504)   100% ->
1703-1921  (107681-107899)   99% ->
1922-2070  (108310-108458)   100% ->
2071-2265  (108688-108882)   100% ->
2266-2496  (109589-109819)   99% ->
2497-2586  (110172-110261)   100% ->
2587-2753  (110711-110877)   100% ->
2754-3007  (111490-111743)   100% ->
3008-3177  (112438-112607)   99% ->
3178-3351  (112797-112970)   100% ->
3352-3426  (113659-113733)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAACGGAGTGATCCCGCCGCCCGGGGGCGCCTCCCCCCTACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAACGGAGTGATCCCGCCGCCCGGGGGCGCCTCCCCCCTACCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GTCCGGGTGCCCTTGGAGGAGCCCCCTCTAAGTCCAGACG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTG...CAGGTCCGGGTGCCCTTGGAGGAGCCCCCTCTAAGTCCAGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAGGAGGAGGACGATGACTTGGGCAAGACCTTGGCTGTGAGCAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100453 TGGAGGAGGAGGACGATGACTTGGGCAAGACCTTGGCTGTGAGCAGGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGGACCTCATCAGCAAGCCCCCGGCCTGGGACCCCGAGAAGCCCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100503 GGGGACCTCATCAGCAAGCCCCCGGCCTGGGACCCCGAGAAGCCCAGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCTACAGCGAGCGGGACTTTGAGT         TTCACCGGCACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100553 CAGCTACAGCGAGCGGGACTTTGAGTGTG...CAGTTCACCGGCACACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCACCACACCCACCACCCGCTCTCAGCGCGCCTGCCTCCACCCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101167 CCCACCACACCCACCACCCGCTCTCAGCGCGCCTGCCTCCACCCCACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCGGCGGCTGCCCCCCACCTCTGCCCGGCACACCAGGAGAAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101217 CTGCGGCGGCTGCCCCCCACCTCTGCCCGGCACACCAGGAGAAAGAGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGGAGAAAACCTCTGCTCCTCCCTCCGAGGGGACCCCTCCCATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101267 GAAGGAGAAAACCTCTGCTCCTCCCTCCGAGGGGACCCCTCCCATCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGAGGGGGGAGCTGGAGTGGATGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101317 AGGAGGGGGGAGCTGGAGTGGATGAGGAAGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGGAGAATCTGAGGCAGAACCTGTGGAGCCCCCCCCCTCAGGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101367 GAAGGAGAATCTGAGGCAGAACCTGTGGAGCCCCCCCACTCAGGGACCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACAGAAGGCAAAG         TTCTCCATTGGAAGTGACGAGGATGACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101417 ACAGAAGGCAAAGGTA...CAGTTCTCCATTGGAAGTGACGAGGATGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTCCAGGCCTCCCTGGGAGGGCTGCTGTCACCAAGCCCCTGCCCTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101616 GTCCAGGCCTCCCTGGGAGGGCTGCTGTCACCAAGCCCCTGCCCTCGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGCCCACACACTGACAAGAGCCCCCAGCACTCCAGCAG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101666 GGCCCACACACTGACAAGAGCCCCCAGCACTCCAGCAGGTA...CAGGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTGCTCTGAGCTGAGGGACGGTGATGGAACCACCGACCTGGCCCTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102083 GTGCTCTGAGCTGAGGGACGGTGATGGAACCACCGACCTGGCCCTGTCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTCCAAGGCTGCTGTGTTGCCTCCCCAGCTCCCCCAGCCCCCGGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102133 GTCCAAGGCTGCTGTGTTGCCTCCCCAGCTCCCCCAGCCCCCGGGCCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCTCCCGACTCGCTGGGGAGAAAAGCCGGCCCTGGAGCCCATCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102183 GCCTCCCGACTCGCTGGGGAGAAAAGCCGGCCCTGGAGCCCATCGGCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTATGACCTGCGGGAGCGACTGTGCCCAGGCAGTGCCCTGGGCAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102233 TTATGACCTGCGGGAGCGACTGTGCCCAGGCAGTGCCCTGGGCAACCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GTGGTCCAGAGCAGCAGGTGCCCACAGATGAGGCGGAGGCCCAGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102283 GTGGTCCAGAGCAGCAGGTGCCCACAGATGAGGCGGAGGCCCAGATGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGTTCTGCAGACCTGGACGACATGAAGA         GTCACCGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102333 GGTTCTGCAGACCTGGACGACATGAAGAGTG...CAGGTCACCGACTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGACAACCCTGGTGTGCGGCGACACTTAGTGAAAAAGCCCTCCCGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103989 GGACAACCCTGGTGTGCGGCGACACTTAGTGAAAAAGCCCTCCCGGACGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGGCGGGAGGGGCA         GTCCCAGCGTCCTACGTACCCTGCTA
        |||||||||||||||>>>...>>>| ||-|||||||||||||||||||||
 104039 AGGGCGGGAGGGGCAGTC...CAGGGCC AGCGTCCTACGTACCCTGCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGAAGCACAG         CCATCCCAACGATGACAAGGACAGTGGCTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105007 CTGAAGCACAGGTG...CAGCCATCCCAACGATGACAAGGACAGTGGCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTTTCCCCGAAACCCATCGAGCTCCAGCATGAACTCGGTTCTGGGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105312 CTTTCCCCGAAACCCATCGAGCTCCAGCATGAACTCGGTTCTGGGGAATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATCACCCAACTCCCAGCCATGGCCCTGATGGGGCGGTGCCTACCATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105362 ATCACCCAACTCCCAGCCATGGCCCTGATGGGGCGGTGCCTACCATGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATGACCTGGGGGAGCCAGCCCCACTCTGGCCACATGACCCTGACGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105412 GATGACCTGGGGGAGCCAGCCCCACTCTGGCCACATGACCCTGACGCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAG         AAGCCCCTCCACATGCCTGGGGGAGATGGTCACCGGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105462 GGAGGTC...CAGAAGCCCCTCCACATGCCTGGGGGAGATGGTCACCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GGAAAAGCCTGAAGCTGCTGGAGAAGATCCCTGAAGATGCTGAGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105925 GGAAAAGCCTGAAGCTGCTGGAGAAGATCCCTGAAGATGCTGAGGCCACG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTTGTGCTTGTGG         GTTGTGTGCCTTTCTTGGAGCAGCCTGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105975 GTTGTGCTTGTGGGTG...TAGGTTGTGTGCCTTTCTTGGAGCAGCCTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGCAGCCTTCGTGCGTCTGAATGAGGCTGTACTCCTGGAGTCTGTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106456 AGCAGCCTTCGTGCGTCTGAATGAGGCTGTACTCCTGGAGTCTGTGCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGGTCCCTGTCCCGGTCCGCTTCCTCTTCGTGATGCTGGGGCCCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106506 AGGTCCCTGTCCCGGTCCGCTTCCTCTTCGTGATGCTGGGGCCCAGCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ACCAGCACTGACTATCACGAGCTTGGGCGCTCCATTGCCACCCTTATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106556 ACCAGCACTGACTATCACGAGCTTGGGCGCTCCATTGCCACCCTTATGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGACAAG         CTGTTTCATGAGGCTGCCTACCAGGCAGATGACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106606 TGACAAGGTT...CAGCTGTTTCATGAGGCTGCCTACCAGGCAGATGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GGCAAGACCTCCTAAGTGCCATCAGCGAGTTCCTGGATGGCAGCATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107313 GGCAAGACCTCCTAAGTGCCATCAGCGAGTTCCTGGATGGCAGCATTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATCCCCCCGTCCGAGGTGGAGGGCCGTGACCTGCTGCGCTCCGTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107363 ATCCCCCCGTCCGAGGTGGAGGGCCGTGACCTGCTGCGCTCCGTGGCTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTTCCAGCGAGAGCTGCTTAGGAAGCGGCGAGAGCGTGAACAGACCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107413 TTTCCAGCGAGAGCTGCTTAGGAAGCGGCGAGAGCGTGAACAGACCAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TCGAGATGACCACACGGGGTGGCTACACGGCCCCTGGGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107463 TCGAGATGACCACACGGGGTGGCTACACGGCCCCTGGGAAAGGTC...CA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1703  AACTGTCTTTGGAGTTGGGGGGCTCTGAGGCGACCCCTGAAGATGACCC
        >||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 107680 GAACTGTCTTTGGAGTTGGGGGGCTCTGAGGCAACCCCTGAAGATGACCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CTTGCTGCGGACGGGCTCGGTATTTGGGGGGCTTGTGCGGGATGTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107730 CTTGCTGCGGACGGGCTCGGTATTTGGGGGGCTTGTGCGGGATGTGAGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GCCGGTACCCGCACTACCCCAGTGACCTGCGAGATGCGCTGCACTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107780 GCCGGTACCCGCACTACCCCAGTGACCTGCGAGATGCGCTGCACTCCCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TGTGTGGCCGCTGTGCTCTTCATCTACTTCGCAGCCCTCAGCCCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107830 TGTGTGGCCGCTGTGCTCTTCATCTACTTCGCAGCCCTCAGCCCTGCCAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CACCTTCGGGGGGCTGCTGG         GAGAGAAGACCGAGGGGCTGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 107880 CACCTTCGGGGGGCTGCTGGGTA...CAGGAGAGAAGACCGAGGGGCTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TGGGCGTGTCCGAGCTGATCGTGTCCACCGCTGTGCTCGGCGTCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108331 TGGGCGTGTCCGAGCTGATCGTGTCCACCGCTGTGCTCGGCGTCCTCTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TCTCTGCTGGGAGCTCAGCCGCTGCTTGTGGTTGGCTTCTCTGGGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108381 TCTCTGCTGGGAGCTCAGCCGCTGCTTGTGGTTGGCTTCTCTGGGCCGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GCTTGTGTTTGAGGAAGCCTTCTTCAAG         TTCTGCCGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 108431 GCTTGTGTTTGAGGAAGCCTTCTTCAAGGTG...TAGTTCTGCCGAGCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 AGGACCTGGAGTACCTCACTGGCCGGGTGTGGGTTGGTCTCTGGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108701 AGGACCTGGAGTACCTCACTGGCCGGGTGTGGGTTGGTCTCTGGCTGGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GTCTTCGTCCTTGCCCTGGTGGCCGCCGAAGGCAGCTTCCTGGTCCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108751 GTCTTCGTCCTTGCCCTGGTGGCCGCCGAAGGCAGCTTCCTGGTCCGCTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CATCTCGCCTTTCACCCAGGAGATCTTTGCCTTTCTCATCTCACTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108801 CATCTCGCCTTTCACCCAGGAGATCTTTGCCTTTCTCATCTCACTCATTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TCATCTACGAGACCTTCTACAAGCTCTACAAG         GTGTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 108851 TCATCTACGAGACCTTCTACAAGCTCTACAAGGTG...CAGGTGTTCACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GAGCACCCACTGCTGCCGTTCTACCCCCCTGAGGGGGCCCTGGAGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109598 GAGCACCCACTGCTGCCGTTCTACCCCCCTGAGGGGGCCCTGGAGGGGTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CCTGGCTGCTGGTCTGGAGCCAAATGGCAGTGCCCTGCCCCCCACCGAGG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109648 CCTGGATGCTGGTCTGGAGCCAAATGGCAGTGCCCTGCCCCCCACCGAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 GCCCCCCCAGCCCGAGGAACCAGCCCAATACGGCACTGCTCTCACTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109698 GCCCCCCCAGCCCGAGGAACCAGCCCAATACGGCACTGCTCTCACTCATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 CTCATGCTCGGGACCTTCTTCATAGCCTTCTTCCTGCGCAAGTTCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109748 CTCATGCTCGGGACCTTCTTCATAGCCTTCTTCCTGCGCAAGTTCAGGAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 CAGCCGCTTCCTGGGGGGCAAG         GCTCGTCGCATCATCGGGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109798 CAGCCGCTTCCTGGGGGGCAAGGTG...AAGGCTCGTCGCATCATCGGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 ACTTTGGCATCCCCATCTCCATCCTGGTGATGGTCCTGGTGGATTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110191 ACTTTGGCATCCCCATCTCCATCCTGGTGATGGTCCTGGTGGATTACTCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 ATCACAGACACCTACACGCAG         AAGCTGACAGTGCCTACAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 110241 ATCACAGACACCTACACGCAGGTG...CAGAAGCTGACAGTGCCTACAGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 GCTCTCAGTGACCTCTCCCGATAAGCGCTCGTGGTTCATCCCACCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110731 GCTCTCAGTGACCTCTCCCGATAAGCGCTCGTGGTTCATCCCACCCCTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 GCAGTGCCCGTCCTTTCCCGCCGTGGATGATGGTGGCAGCCGCTGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110781 GCAGTGCCCGTCCTTTCCCGCCGTGGATGATGGTGGCAGCCGCTGTTCCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 GCCCTCCTCGTCCTCATCCTGATCTTCATGGAGACACAGATCACGGC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110831 GCCCTCCTCGTCCTCATCCTGATCTTCATGGAGACACAGATCACGGCGTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2754       GCTTATCGTCAGCCAGAAGGCGCGGAGGCTGCTCAAGGGCTCCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110881 ...CAGGCTTATCGTCAGCCAGAAGGCGCGGAGGCTGCTCAAGGGCTCCG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 GTTTCCACCTGGACCTGCTCCTCATTGGCTCCCTGGGGGGGCTCTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111534 GTTTCCACCTGGACCTGCTCCTCATTGGCTCCCTGGGGGGGCTCTGTGGG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 CTGTTTGGGTTGCCCTGGCTCACGGCTGCCACGGTCCGCTCCGTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111584 CTGTTTGGGTTGCCCTGGCTCACGGCTGCCACGGTCCGCTCCGTCACCCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 TGTCAATGCGTTGACAGTGATGCGTACTGCCATCGCGCCTGGTGACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111634 TGTCAATGCGTTGACAGTGATGCGTACTGCCATCGCGCCTGGTGACAAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 CCCAGATCCAGGAGGTGCGGGAGCAGCGGGTCACTGGTGTGCTCATCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111684 CCCAGATCCAGGAGGTGCGGGAGCAGCGGGTCACTGGTGTGCTCATCGCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 AGCCTCGTGG         GCCTGTCCATCGTCATGGGGGCTGTGCTGCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111734 AGCCTCGTGGGTG...CAGGCCTGTCCATCGTCATGGGGGCTGTGCTGCG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3039 TCGGATCCCATTGGCTGTGCTCTTTGGGATCTTCCTGTACATGGGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112469 TCGGATCCCATTGGCTGTGCTCTTTGGGATCTTCCTGTACATGGGGGTCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 CGTCCCTGTCTGGTATCCAGCTGTCCCAGCGTCTGTTGCTCATCCTCATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 112519 CGTCCCTGTCTGGTATCCAGCTGTCCCAGCGTTTGTTGCTCATCCTCATG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 CCGGCAAAACACCATCCTGAGCAGCCCTATGTGACCAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112569 CCGGCAAAACACCATCCTGAGCAGCCCTATGTGACCAAGGTA...TAGGT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3180 GAAGACGTGGCGGATGCATCTGTTCACCTGCATCCAGCTGGGCTGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112799 GAAGACGTGGCGGATGCATCTGTTCACCTGCATCCAGCTGGGCTGCATCG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3230 CACTGCTCTGGGTGGTCAAGTCCACGGCGGCCTCACTCGCCTTTCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112849 CACTGCTCTGGGTGGTCAAGTCCACGGCGGCCTCACTCGCCTTTCCCTTC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3280 CTGCTGCTGCTCACGGTGCCTCTGAGGCATTGCCTTCTGCCCCGGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112899 CTGCTGCTGCTCACGGTGCCTCTGAGGCATTGCCTTCTGCCCCGGCTCTT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 CCAGGACAGGGAGCTGCAGGCG         CTGGACTCGGAAGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 112949 CCAGGACAGGGAGCTGCAGGCGGTA...CAGCTGGACTCGGAAGATGCTG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3371 AACCAAACTTCGATGAGGATGGCCAGGATGAGTACAATGAGCTGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113678 AACCAAACTTCGATGAGGATGGCCAGGATGAGTACAATGAGCTGCACATG

   3600     .
   3421 CCAGTG
        ||||||
 113728 CCAGTG