seq1 = pF1KB3796.tfa, 2580 bp
seq2 = pF1KB3796/gi568815588r_125917282.tfa (gi568815588r:125917282_126488145), 570864 bp

>pF1KB3796 2580
>gi568815588r:125917282_126488145 (Chr10)

(complement)

87-186  (157635-157734)   99% ==
261-339  (332841-332919)   100% ->
340-416  (352486-352562)   100% ->
417-603  (369922-370108)   100% ->
604-773  (386905-387074)   100% ->
774-858  (389646-389730)   100% ->
859-1007  (394013-394161)   100% ->
1008-1185  (416492-416669)   100% ->
1186-1275  (421340-421429)   100% ->
1276-1471  (423145-423340)   100% ->
1472-1580  (438477-438585)   100% ->
1581-1779  (438695-438893)   100% ->
1780-1857  (442014-442091)   100% ->
1858-1966  (444998-445106)   100% ->
1967-2102  (448717-448852)   100% ->
2103-2211  (449797-449905)   100% ->
2212-2391  (451821-452000)   100% ->
2392-2522  (468321-468451)   100% ->
2523-2580  (470807-470864)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     87 AGGGGTGAGCTTATGGAACCAAGGAAGAGCTGATGAAGTTGTCAGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157635 AGGGGTGAGCTTATGGAACCAAGGAAGAGCTGATGAAGTTGTCAGTGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137 CTGTTCGGAGTGGGGACCTCTGGATCCCAGTGAAGAGCTTCGACTCCAAG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157685 CTGTTGGGAGTGGGGACCTCTGGATCCCAGTGAAGAGCTTCGACTCCAAG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    261 AGGTCTCATTGCCAGCAGTTTCACGGAAACCCACTATCTGCAAGACGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 332841 AGGTCTCATTGCCAGCAGTTTCACGGAAACCCACTATCTGCAAGACGGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    311 CTGATGTCTCCCTCGCTCGAAATTACACG         GGTCACTGTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 332891 CTGATGTCTCCCTCGCTCGAAATTACACGGTA...TAGGGTCACTGTTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    352 TACCATGGACATGTACGGGGATATTCTGATTCAGCAGTCAGTCTCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 352498 TACCATGGACATGTACGGGGATATTCTGATTCAGCAGTCAGTCTCAGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    402 GTGTTCTGGTCTCAG         GGGACTTATTGTGTTTGAAAATGAAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 352548 GTGTTCTGGTCTCAGGTA...CAGGGGACTTATTGTGTTTGAAAATGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    443 GCTATGTCTTAGAACCAATGAAAAGTGCAACCAACAGATACAAACTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 369948 GCTATGTCTTAGAACCAATGAAAAGTGCAACCAACAGATACAAACTCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    493 CCAGCGAAGAAGCTGAAAAGCGTCCGGGGATCATGTGGATCACATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 369998 CCAGCGAAGAAGCTGAAAAGCGTCCGGGGATCATGTGGATCACATCACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    543 CACACCAAACCTCGCTGCAAAGAATGTGTTTCCACCACCCTCTCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 370048 CACACCAAACCTCGCTGCAAAGAATGTGTTTCCACCACCCTCTCAGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    593 GGGCAAGAAGG         TTTTACAGACCACTGAACATTCGGATCGTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 370098 GGGCAAGAAGGGTA...CAGTTTTACAGACCACTGAACATTCGGATCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    634 TTGGTAGGCGTGGAAGTGTGGAATGACATGGACAAATGCTCTGTAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386935 TTGGTAGGCGTGGAAGTGTGGAATGACATGGACAAATGCTCTGTAAGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    684 GGACCCATTCACCAGCCTCCATGAATTTCTGGACTGGAGGAAGATGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386985 GGACCCATTCACCAGCCTCCATGAATTTCTGGACTGGAGGAAGATGAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    734 TTCTACCTCGCAAATCCCATGACAATGCGCAGCTTGTCAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 387035 TTCTACCTCGCAAATCCCATGACAATGCGCAGCTTGTCAGGTA...TAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    775 GGGGTTTATTTCCAAGGGACCACCATCGGCATGGCCCCAATCATGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 389647 GGGGTTTATTTCCAAGGGACCACCATCGGCATGGCCCCAATCATGAGCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    825 GTGCACGGCAGACCAGTCTGGGGGAATTGTCATG         GACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 389697 GTGCACGGCAGACCAGTCTGGGGGAATTGTCATGGTA...GAGGACCATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    866 CAGACAATCCCCTTGGTGCAGCCGTGACCCTGGCACATGAGCTGGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 394020 CAGACAATCCCCTTGGTGCAGCCGTGACCCTGGCACATGAGCTGGGCCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    916 AATTTCGGGATGAATCATGACACACTGGACAGGGGCTGTAGCTGTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 394070 AATTTCGGGATGAATCATGACACACTGGACAGGGGCTGTAGCTGTCAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    966 GGCGGTTGAGAAAGGAGGCTGCATCATGAACGCTTCCACCGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 394120 GGCGGTTGAGAAAGGAGGCTGCATCATGAACGCTTCCACCGGGCA...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1008  GTACCCATTTCCCATGGTGTTCAGCAGTTGCAGCAGGAAGGACTTGGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 416491 GGTACCCATTTCCCATGGTGTTCAGCAGTTGCAGCAGGAAGGACTTGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1057 ACCAGCCTGGAGAAAGGAATGGGGGTGTGCCTGTTTAACCTGCCGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 416541 ACCAGCCTGGAGAAAGGAATGGGGGTGTGCCTGTTTAACCTGCCGGAAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1107 CAGGGAGTCTTTCGGGGGCCAGAAGTGTGGGAACAGATTTGTGGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 416591 CAGGGAGTCTTTCGGGGGCCAGAAGTGTGGGAACAGATTTGTGGAAGAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1157 GAGAGGAGTGTGACTGTGGGGAGCCAGAG         GAATGTATGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 416641 GAGAGGAGTGTGACTGTGGGGAGCCAGAGGTA...CAGGAATGTATGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1198 CGCTGCTGCAATGCCACCACCTGTACCCTGAAGCCGGACGCTGTGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 421352 CGCTGCTGCAATGCCACCACCTGTACCCTGAAGCCGGACGCTGTGTGCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1248 ACATGGGCTGTGCTGTGAAGACTGCCAG         CTGAAGCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 421402 ACATGGGCTGTGCTGTGAAGACTGCCAGGTG...CAGCTGAAGCCTGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1289 GAACAGCGTGCAGGGACTCCAGCAACTCCTGTGACCTCCCAGAGTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 423158 GAACAGCGTGCAGGGACTCCAGCAACTCCTGTGACCTCCCAGAGTTCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1339 ACAGGGGCCAGCCCTCACTGCCCAGCCAACGTGTACCTGCACGATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 423208 ACAGGGGCCAGCCCTCACTGCCCAGCCAACGTGTACCTGCACGATGGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1389 CTCATGTCAGGATGTGGACGGCTACTGCTACAATGGCATCTGCCAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 423258 CTCATGTCAGGATGTGGACGGCTACTGCTACAATGGCATCTGCCAGACTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1439 ACGAGCAGCAGTGTGTCACGCTCTGGGGACCAG         GTGCTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 423308 ACGAGCAGCAGTGTGTCACGCTCTGGGGACCAGGTA...CAGGTGCTAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1480 CCTGCCCCTGGGATCTGCTTTGAGAGAGTCAATTCTGCAGGTGATCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438485 CCTGCCCCTGGGATCTGCTTTGAGAGAGTCAATTCTGCAGGTGATCCTTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1530 TGGCAACTGTGGCAAAGTCTCGAAGAGTTCCTTTGCCAAATGCGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438535 TGGCAACTGTGGCAAAGTCTCGAAGAGTTCCTTTGCCAAATGCGAGATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1580 G         AGATGCTAAATGTGGAAAAATCCAGTGTCAAGGAGGTGCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438585 GGTA...CAGAGATGCTAAATGTGGAAAAATCCAGTGTCAAGGAGGTGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1621 AGCCGGCCAGTCATTGGTACCAATGCCGTTTCCATAGAAACAAACATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438735 AGCCGGCCAGTCATTGGTACCAATGCCGTTTCCATAGAAACAAACATCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1671 CCTGCAGCAAGGAGGCCGGATTCTGTGCCGGGGGACCCACGTGTACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438785 CCTGCAGCAAGGAGGCCGGATTCTGTGCCGGGGGACCCACGTGTACTTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1721 GCGATGACATGCCGGACCCAGGGCTTGTGCTTGCAGGCACAAAGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 438835 GCGATGACATGCCGGACCCAGGGCTTGTGCTTGCAGGCACAAAGTGTGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1771 GATGGAAAA         ATCTGCCTGAATCGTCAATGTCAAAATATTAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 438885 GATGGAAAAGTA...CAGATCTGCCTGAATCGTCAATGTCAAAATATTAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1812 TGTCTTTGGGGTTCACGAGTGTGCAATGCAGTGCCACGGCAGAGGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 442046 TGTCTTTGGGGTTCACGAGTGTGCAATGCAGTGCCACGGCAGAGGGGTG.

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1858      GTGTGCAACAACAGGAAGAACTGCCACTGCGAGGCCCACTGGGCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 442096 ..AAGGTGTGCAACAACAGGAAGAACTGCCACTGCGAGGCCCACTGGGCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1903 CCTCCCTTCTGTGACAAGTTTGGCTTTGGAGGAAGCACAGACAGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 445043 CCTCCCTTCTGTGACAAGTTTGGCTTTGGAGGAAGCACAGACAGCGGCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1953 CATCCGGCAAGCAG         ATAACCAAGGTTTAACCATAGGAATTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 445093 CATCCGGCAAGCAGGTC...CAGATAACCAAGGTTTAACCATAGGAATTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1994 TGGTGACCATCCTGTGTCTTCTTGCTGCCGGATTTGTGGTTTATCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448744 TGGTGACCATCCTGTGTCTTCTTGCTGCCGGATTTGTGGTTTATCTCAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2044 AGGAAGACCTTGATACGACTGCTGTTTACAAATAAGAAGACCACCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448794 AGGAAGACCTTGATACGACTGCTGTTTACAAATAAGAAGACCACCATTGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2094 AAAACTAAG         GTGTGTGCGCCCTTCCCGGCCACCCCGTGGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 448844 AAAACTAAGGTA...CAGGTGTGTGCGCCCTTCCCGGCCACCCCGTGGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2135 TCCAACCCTGTCAGGCTCACCTCGGCCACCTTGGAAAAGGCCTGATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 449829 TCCAACCCTGTCAGGCTCACCTCGGCCACCTTGGAAAAGGCCTGATGAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2185 AAGCCGCCAGATTCCTACCCACCGAAG         GACAATCCCAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 449879 AAGCCGCCAGATTCCTACCCACCGAAGGTG...CAGGACAATCCCAGGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2226 ATTGCTGCAGTGTCAGAATGTTGACATCAGCAGACCCCTCAACGGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451835 ATTGCTGCAGTGTCAGAATGTTGACATCAGCAGACCCCTCAACGGCCTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2276 ATGTCCCTCAGCCCCAGTCAACTCAGCGAGTGCTTCCTCCCCTCCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451885 ATGTCCCTCAGCCCCAGTCAACTCAGCGAGTGCTTCCTCCCCTCCACCGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2326 GCTCCACGTGCACCTAGCGTCCCTGCCAGACCCCTGCCAGCCAAGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451935 GCTCCACGTGCACCTAGCGTCCCTGCCAGACCCCTGCCAGCCAAGCCTGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2376 ACTTAGGCAGGCCCAG         GGGACCTGTAAGCCAAACCCCCCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 451985 ACTTAGGCAGGCCCAGGTA...CAGGGGACCTGTAAGCCAAACCCCCCTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2417 AGAAGCCTCTGCCTGCAGATCCTCTGGCCAGAACAACTCGGCTCACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 468346 AGAAGCCTCTGCCTGCAGATCCTCTGGCCAGAACAACTCGGCTCACTCAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2467 GCCTTGGCCAGGACCCCAGGACAATGGGAGACTGGGCTCCGCCTGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 468396 GCCTTGGCCAGGACCCCAGGACAATGGGAGACTGGGCTCCGCCTGGCACC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2517 CCTCAG         ACCTGCTCCACAATATCCACACCAAGTGCCCAGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 468446 CCTCAGGTT...CAGACCTGCTCCACAATATCCACACCAAGTGCCCAGAT

   2450     .    :    .    :
   2558 CCACCCACACCGCCTATATTAAG
        |||||||||||||||||||||||
 470842 CCACCCACACCGCCTATATTAAG