seq1 = pF1KB3774.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KB3774/gi568815582r_70281692.tfa (gi568815582r:70281692_70498530), 216839 bp

>pF1KB3774 1050
>gi568815582r:70281692_70498530 (Chr16)

(complement)

1-339  (100001-100339)   100% ->
340-533  (103356-103549)   100% ->
534-713  (109985-110164)   100% ->
714-759  (115296-115341)   100% ->
760-879  (115607-115726)   100% ->
880-1050  (116669-116839)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTGCTCCCTGCGGGTGTGGTTCCTCTCCGTGGCCTTCCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTGCTCCCTGCGGGTGTGGTTCCTCTCCGTGGCCTTCCTGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCATCATGTCCCTGCTCTTCACCTACTCGCACCACAGCATGGCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCATCATGTCCCTGCTCTTCACCTACTCGCACCACAGCATGGCCACGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCCTACCTGGACTCAGGGGCCCTGGATGGGACGCACCGGGTGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCCTACCTGGACTCAGGGGCCCTGGATGGGACGCACCGGGTGAAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCCCGGCTATGCCGGCCTGCAGCGCCTCAGCAAGGAGAGGCTCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCCCGGCTATGCCGGCCTGCAGCGCCTCAGCAAGGAGAGGCTCTCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGAGCTGTGCCTGTCGCCGCTGCATGGGCGATGCCGGTGCCTCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGAGCTGTGCCTGTCGCCGCTGCATGGGCGATGCCGGTGCCTCCGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGTTTGACAGCCACTTTGACGGTAACATTTCCCCCGTCTGGACCCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGTTTGACAGCCACTTTGACGGTAACATTTCCCCCGTCTGGACCCGAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACATGGATCTTCCACCGGACGTCCAGAGGTGGTGGATG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100301 AACATGGATCTTCCACCGGACGTCCAGAGGTGGTGGATGGTA...CAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGCAGCCCCAGTTCAAGTCACACAACACCAATGAGGTGCTGGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103358 GCTGCAGCCCCAGTTCAAGTCACACAACACCAATGAGGTGCTGGAGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGTTCCAGATAGTGCCTGGCGAGAACCCCTACCGCTTCCGGGACCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103408 TGTTCCAGATAGTGCCTGGCGAGAACCCCTACCGCTTCCGGGACCCCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGTGCCGGCGCTGTGCCGTGGTGGGGAACTCGGGCAACCTGCGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103458 CAGTGCCGGCGCTGTGCCGTGGTGGGGAACTCGGGCAACCTGCGGGGCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGCTATGGGCAGGACGTGGACGGGCACAACTTCATCATGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103508 TGGCTATGGGCAGGACGTGGACGGGCACAACTTCATCATGAGGTG...CA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    534  GATGAATCAGGCGCCAACCGTGGGCTTTGAGCAGGATGTTGGCAGCCGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109984 GGATGAATCAGGCGCCAACCGTGGGCTTTGAGCAGGATGTTGGCAGCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACCACCCACCATTTCATGTACCCTGAGAGTGCCAAGAACCTGCCCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110034 ACCACCCACCATTTCATGTACCCTGAGAGTGCCAAGAACCTGCCCGCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CGTCAGCTTCGTGCTGGTGCCCTTCAAGGTCCTGGACCTTCTGTGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110084 CGTCAGCTTCGTGCTGGTGCCCTTCAAGGTCCTGGACCTTCTGTGGATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCAGCGCCTTGTCCACGGGGCAGATCCGATT         CACCTACGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110134 CCAGCGCCTTGTCCACGGGGCAGATCCGATTGTG...CAGCACCTACGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCAGTGAAGTCCTTCCTTCGAGTGGATAAAGAAAAG         GTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115306 CCAGTGAAGTCCTTCCTTCGAGTGGATAAAGAAAAGGTA...CAGGTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GATCTACAACCCAGCCTTCTTCAAGTATATCCACGACAGGTGGACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115612 GATCTACAACCCAGCCTTCTTCAAGTATATCCACGACAGGTGGACAGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATCACGGGCGGTACCCTTCCACGGGGATGCTGGTGCTTTTCTTTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115662 ATCACGGGCGGTACCCTTCCACGGGGATGCTGGTGCTTTTCTTTGCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CATGTGTGTGATGAG         GTGAACGTGTACGGGTTCGGGGCCGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115712 CATGTGTGTGATGAGGTG...CAGGTGAACGTGTACGGGTTCGGGGCCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAGCCGGGGCAACTGGCACCACTACTGGGAGAACAACCGGTACGCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116695 CAGCCGGGGCAACTGGCACCACTACTGGGAGAACAACCGGTACGCGGGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGTTCCGGAAGACTGGCGTGCACGACGCGGACTTCGAGGCCCACATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116745 AGTTCCGGAAGACTGGCGTGCACGACGCGGACTTCGAGGCCCACATCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1006 GACATGCTGGCCAAGGCCAGCAAGATCGAAGTCTACCGGGGCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116795 GACATGCTGGCCAAGGCCAGCAAGATCGAAGTCTACCGGGGCAAC