seq1 = pF1KB3747.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KB3747/gi568815579r_7863486.tfa (gi568815579r:7863486_8091815), 228330 bp

>pF1KB3747 978
>gi568815579r:7863486_8091815 (Chr19)

(complement)

1-172  (100001-100172)   100% ->
173-276  (110630-110733)   100% ->
277-430  (117938-118091)   100% ->
431-656  (124026-124251)   100% ->
657-978  (128009-128330)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTAATGGTTATGAAGACCACATGGCCGAAGACTGCAGGGGTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTAATGGTTATGAAGACCACATGGCCGAAGACTGCAGGGGTGACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGAGAACGAATTTGATCGTCAACTACCTCCCTCAGAACATGACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGAGAACGAATTTGATCGTCAACTACCTCCCTCAGAACATGACCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAGTTACGAAGCCTGTTCAGCAGCATTGGTGAAGTTGAATCTGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGAGTTACGAAGCCTGTTCAGCAGCATTGGTGAAGTTGAATCTGCAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTATTCGGGATAAAGTAGCAG         GACACAGCTTGGGCTATGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100151 CTTATTCGGGATAAAGTAGCAGGTA...CAGGACACAGCTTGGGCTATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTTGTGAACTACGTGACCGCGAAGGATGCAGAGAGAGCGATCAACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110649 CTTTGTGAACTACGTGACCGCGAAGGATGCAGAGAGAGCGATCAACACGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAACGGCTTGAGGCTCCAGTCAAAAACCATTAAG         GTGTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110699 TGAACGGCTTGAGGCTCCAGTCAAAAACCATTAAGGTA...AAGGTGTCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGCTCGCCCGAGCTCAGAGGTGATCAAAGACGCCAACTTGTACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117944 TATGCTCGCCCGAGCTCAGAGGTGATCAAAGACGCCAACTTGTACATCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGGGCTCCCGCGGACCATGACCCAGAAGGACGTAGAAGACATGTTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117994 CGGGCTCCCGCGGACCATGACCCAGAAGGACGTAGAAGACATGTTCTCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGTTTGGGCGGATCATCAACTCGCGGGTCCTCGTGGATCAGACTACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118044 GGTTTGGGCGGATCATCAACTCGCGGGTCCTCGTGGATCAGACTACAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431        GTTTGTCCAGAGGGGTTGCGTTTATCCGGTTTGACAAACGGTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118094 A...AAGGTTTGTCCAGAGGGGTTGCGTTTATCCGGTTTGACAAACGGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGGCAGAAGAGGCAATTACCAGTTTCAATGGTCATAAACCCCCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124069 GGAGGCAGAAGAGGCAATTACCAGTTTCAATGGTCATAAACCCCCAGGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCTCTGAGCCCATCACAGTGAAGTTTGCAGCCAACCCCAACCAGAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124119 CCTCTGAGCCCATCACAGTGAAGTTTGCAGCCAACCCCAACCAGAACAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACGTGGCACTCCTCTCGCAGCTGTACCACTCGCCAGCGCGACGGTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124169 AACGTGGCACTCCTCTCGCAGCTGTACCACTCGCCAGCGCGACGGTTCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGGCCCCGTTCACCACCAGGCGCAGAGATTCAG         GTTCTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124219 AGGCCCCGTTCACCACCAGGCGCAGAGATTCAGGTG...CAGGTTCTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCATGGGCGTCGATCACATGAGCGGGCTCTCTGGCGTCAACGTGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128017 CCATGGGCGTCGATCACATGAGCGGGCTCTCTGGCGTCAACGTGCCAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AACGCCTCCTCCGGCTGGTGCATTTTCATCTACAACCTGGGGCAGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128067 AACGCCTCCTCCGGCTGGTGCATTTTCATCTACAACCTGGGGCAGGATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGACGAGGGGATCCTCTGGCAGATGTTTGGGCCGTTTGGTGCCGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128117 CGACGAGGGGATCCTCTGGCAGATGTTTGGGCCGTTTGGTGCCGTCACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGTGAAAGTGATCCGCGACTTCAACACCAACAAGTGCAAAGGGTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128167 ATGTGAAAGTGATCCGCGACTTCAACACCAACAAGTGCAAAGGGTTTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTTGTGACCATGACAAACTATGAAGAAGCCGCGATGGCCATAGCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128217 TTTGTGACCATGACAAACTATGAAGAAGCCGCGATGGCCATAGCCAGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GAACGGCTACCGCCTGGGGGACAAAATCTTACAGGTTTCCTTCAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128267 GAACGGCTACCGCCTGGGGGACAAAATCTTACAGGTTTCCTTCAAAACCA

   1000     .    :
    965 ACAAGTCCCACAAA
        ||||||||||||||
 128317 ACAAGTCCCACAAA