seq1 = pF1KB3726.tfa, 2577 bp
seq2 = pF1KB3726/gi568815581r_906083.tfa (gi568815581r:906083_1279727), 373645 bp

>pF1KB3726 2577
>gi568815581r:906083_1279727 (Chr17)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-246  (154361-154545)   100% ->
247-345  (178993-179091)   100% ->
346-531  (187878-188063)   100% ->
532-639  (196101-196208)   100% ->
640-700  (200338-200398)   100% ->
701-753  (206051-206103)   100% ->
754-894  (206974-207114)   100% ->
895-1016  (209638-209759)   100% ->
1017-1182  (212486-212651)   99% ->
1183-1305  (220861-220983)   100% ->
1306-1381  (221683-221758)   100% ->
1382-1486  (222626-222730)   100% ->
1487-1561  (223619-223693)   100% ->
1562-1659  (229094-229191)   100% ->
1660-1791  (229547-229678)   100% ->
1792-1851  (266564-266623)   100% ->
1852-1961  (266931-267040)   100% ->
1962-2101  (267743-267882)   100% ->
2102-2236  (268865-268999)   100% ->
2237-2342  (269944-270049)   100% ->
2343-2490  (272416-272563)   100% ->
2491-2577  (273559-273645)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCGCTCAGCCACCGGGGCCTGCCGCGCCTGTCCTGGATCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCGCTCAGCCACCGGGGCCTGCCGCGCCTGTCCTGGATCGACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTACAGCA         ACTTCAGCTACGGGACGGACGAGTACGACG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTACAGCAGTA...CAGACTTCAGCTACGGGACGGACGAGTACGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGAGGGGAATGAGGAGCAGAAGGGGCCCCCGGAGGGCTCAGAGACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154391 GAGAGGGGAATGAGGAGCAGAAGGGGCCCCCGGAGGGCTCAGAGACCATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCGTACATCGATGAGTCGCCCACCATGTCCCCGCAGCTCAGCGCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154441 CCGTACATCGATGAGTCGCCCACCATGTCCCCGCAGCTCAGCGCCCGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGGGCGGGGGGGATGGCGTCTCCCCGACTCCACCTGAGGGACTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154491 CCAGGGCGGGGGGGATGGCGTCTCCCCGACTCCACCTGAGGGACTGGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGG         GTGGAAGCAGGGAAAGGCCTGGAGATGAGGAAGCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154541 CTGGGGTA...CAGGTGGAAGCAGGGAAAGGCCTGGAGATGAGGAAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTCTCTCGGGGTTCTTGGCCAGCGAAGAGATCTACATTAACCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179029 GTTCTCTCGGGGTTCTTGGCCAGCGAAGAGATCTACATTAACCAGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCCCTGTTGCTG         CCCATGAAACCCCTGAAGGCCACCGCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 179079 AGCCCTGTTGCTGGTG...CAGCCCATGAAACCCCTGAAGGCCACCGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCACCTCCCAGCCCGTGCTCACCATCCAGCAGATCGAGACCATCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187906 CCACCTCCCAGCCCGTGCTCACCATCCAGCAGATCGAGACCATCTTCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGATCCAGGACATCTATGAGATCCACAAGGAGTTCTATGACAACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187956 AAGATCCAGGACATCTATGAGATCCACAAGGAGTTCTATGACAACCTGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCCCAAGGTGCAACAGTGGGACAGCCAGGTCACCATGGGCCACCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188006 CCCCAAGGTGCAACAGTGGGACAGCCAGGTCACCATGGGCCACCTCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAGCTG         GCCAGCCAGCTCGGTGTGTACAAAGCGTTTGTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 188056 AGAAGCTGGTG...CAGGCCAGCCAGCTCGGTGTGTACAAAGCGTTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATAACTATAAAGTCGCTCTGGAGACAGCTGAGAAGTGCAGCCAGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196134 GATAACTATAAAGTCGCTCTGGAGACAGCTGAGAAGTGCAGCCAGTCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAACCAGTTCCAGAAGATCTCAGAG         GAACTCAAAGTGAAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 196184 CAACCAGTTCCAGAAGATCTCAGAGGTA...CAGGAACTCAAAGTGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTCCCAAGGACTCCAAGGACAGCCACACGTCTGTCACCATGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 200354 GTCCCAAGGACTCCAAGGACAGCCACACGTCTGTCACCATGGAAGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701     CTCTGCTCTACAAGCCCATTGACCGGGTCACTCGGAGCACCCTAGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200404 .CAGCTCTGCTCTACAAGCCCATTGACCGGGTCACTCGGAGCACCCTAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTACAC         GACCTGCTGAAGCACACACCTGTGGACCACCCCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206097 CCTACACGTG...CAGGACCTGCTGAAGCACACACCTGTGGACCACCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACTACCCGCTGCTGCAGGATGCCCTCCGCATCTCCCAGAACTTCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207008 ACTACCCGCTGCTGCAGGATGCCCTCCGCATCTCCCAGAACTTCCTGTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGCATCAACGAGGACATCGACCCCCGCCGGACTGCAGTGACAACGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207058 AGCATCAACGAGGACATCGACCCCCGCCGGACTGCAGTGACAACGCCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGGGGAG         ACGCGACAGCTGGTGAAGGACGGCTTCCTGGTGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207108 GGGGGAGGTG...CAGACGCGACAGCTGGTGAAGGACGGCTTCCTGGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AAGTGTCAGAGAGCTCCCGGAAGCTGCGGCACGTCTTCCTCTTTACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209672 AAGTGTCAGAGAGCTCCCGGAAGCTGCGGCACGTCTTCCTCTTTACAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTCCTACTGTGTGCCAAGCTGAAGAAGACCTCTGCAGG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 209722 GTCCTACTGTGTGCCAAGCTGAAGAAGACCTCTGCAGGGTG...CAGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCACCAGCAGTATGACTGTAAGTGGTACATCCCCCTGGCCGACCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212489 GCACCAGCAGTATGACTGTAAGTGGTACATCCCCCTGGCCGACCTGGTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTCCATCCCCCGAGGAATCTGAGGCCAGCCCCCAGGTGCACCCCTTCCCA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 212539 TTCCATCCCCCGAGGAGTCTGAGGCCAGCCCCCAGGTGCACCCCTTCCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GACCATGAGCTGGAGGACATGAAGATGAAGATCTCTGCCCTCAAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212589 GACCATGAGCTGGAGGACATGAAGATGAAGATCTCTGCCCTCAAGAGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AATCCAGAAGGAG         AAAGCCAACAAAGGCCAGAGCCGGGCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 212639 AATCCAGAAGGAGGTG...CAGAAAGCCAACAAAGGCCAGAGCCGGGCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCGAGCGCCTGAAGAAGAAGATGTTTGAGAATGAGTTCCTGCTGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220889 TCGAGCGCCTGAAGAAGAAGATGTTTGAGAATGAGTTCCTGCTGCTGCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AACTCCCCCACAATCCCGTTCAGGATCCACAATCGGAATGGAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 220939 AACTCCCCCACAATCCCGTTCAGGATCCACAATCGGAATGGAAAGGTC..

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306     AGTTACCTGTTCCTACTGTCCTCGGACTACGAGAGGTCAGAGTGGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220989 .CAGAGTTACCTGTTCCTACTGTCCTCGGACTACGAGAGGTCAGAGTGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GAGAAGCAATTCAGAAACTACAGAAGAAGG         ATCTCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 221729 GAGAAGCAATTCAGAAACTACAGAAGAAGGGTA...CAGATCTCCAGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TTTGTCCTGAGCTCAGTGGAGCTCCAGGTGCTCACAGGATCCTGTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222637 TTTGTCCTGAGCTCAGTGGAGCTCCAGGTGCTCACAGGATCCTGTTTCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GCTTAGGACTGTACACAACATTCCTGTCACCAGCAATAAAGACG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 222687 GCTTAGGACTGTACACAACATTCCTGTCACCAGCAATAAAGACGGTA...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1487    ACGATGAGTCTCCAGGACTCTATGGCTTCCTTCATGTCATCGTCCAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223616 CAGACGATGAGTCTCCAGGACTCTATGGCTTCCTTCATGTCATCGTCCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TCTGCCAAGGGATTTAAGCAATCAGCCA         ACCTGTACTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 223666 TCTGCCAAGGGATTTAAGCAATCAGCCAGTA...CAGACCTGTACTGTAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CCTGGAGGTGGATTCCTTCGGCTATTTTGTCAGCAAAGCCAAAACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229107 CCTGGAGGTGGATTCCTTCGGCTATTTTGTCAGCAAAGCCAAAACCAGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGTTCCGGGACACAGCGGAGCCCAAGTGGGATGAG         GAGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 229157 TGTTCCGGGACACAGCGGAGCCCAAGTGGGATGAGGTG...CAGGAGTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GAGATCGAGCTGGAGGGCTCCCAGTCCCTGAGGATCCTGTGCTATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229553 GAGATCGAGCTGGAGGGCTCCCAGTCCCTGAGGATCCTGTGCTATGAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 GTGCTATGACAAGACCAAGGTCAACAAGGACAACAATGAGATCGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229603 GTGCTATGACAAGACCAAGGTCAACAAGGACAACAATGAGATCGTGGACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 AGATCATGGGCAAAGGACAGATCCAG         CTGGACCCACAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 229653 AGATCATGGGCAAAGGACAGATCCAGGTG...CAGCTGGACCCACAAACC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 GTGGAGACCAAGAACTGGCACACGGACGTGATTGAGATGAACGGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 266579 GTGGAGACCAAGAACTGGCACACGGACGTGATTGAGATGAACGGGGTG..

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852     ATCAAAGTGGAATTTTCCATGAAATTCACCAGCCGAGATATGAGCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266629 .CAGATCAAAGTGGAATTTTCCATGAAATTCACCAGCCGAGATATGAGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898 TGAAGAGGACCCCGTCCAAAAAGCAGACCGGCGTCTTCGGTGTGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266977 TGAAGAGGACCCCGTCCAAAAAGCAGACCGGCGTCTTCGGTGTGAAGATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 AGCGTGGTGACGAA         GCGGGAGCGCTCCAAGGTGCCCTACAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 267027 AGCGTGGTGACGAAGTA...CAGGCGGGAGCGCTCCAAGGTGCCCTACAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 CGTCCGGCAGTGTGTGGAGGAGGTGGAGAAGAGGGGTATCGAGGAGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267770 CGTCCGGCAGTGTGTGGAGGAGGTGGAGAAGAGGGGTATCGAGGAGGTTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 GCATCTACAGGATATCGGGCGTGGCCACGGACATCCAGGCGCTCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267820 GCATCTACAGGATATCGGGCGTGGCCACGGACATCCAGGCGCTCAAGGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GTCTTCGATGCCA         ATAACAAGGACATCCTGCTGATGCTGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 267870 GTCTTCGATGCCAGTG...CAGATAACAAGGACATCCTGCTGATGCTGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 TGACATGGACATCAACGCCATCGCCGGGACGCTCAAGCTGTACTTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268893 TGACATGGACATCAACGCCATCGCCGGGACGCTCAAGCTGTACTTCCGGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 AACTGCCCGAGCCGCTCCTCACGGACCGACTCTACCCAGCCTTCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268943 AACTGCCCGAGCCGCTCCTCACGGACCGACTCTACCCAGCCTTCATGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 GGCATCG         CCCTGTCAGACCCTGCTGCCAAGGAAAACTGCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268993 GGCATCGGTG...CAGCCCTGTCAGACCCTGCTGCCAAGGAAAACTGCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 GATGCACCTGCTCCGCTCCCTGCCCGACCCCAACCTCATCACCTTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 269978 GATGCACCTGCTCCGCTCCCTGCCCGACCCCAACCTCATCACCTTCCTCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 TCCTGCTGGAACACTTGAAAAG         GGTTGCCGAGAAGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 270028 TCCTGCTGGAACACTTGAAAAGGTA...TAGGGTTGCCGAGAAGGAGCCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 ATCAACAAAATGTCACTTCACAACCTGGCTACCGTGTTTGGACCCACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272435 ATCAACAAAATGTCACTTCACAACCTGGCTACCGTGTTTGGACCCACGTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 ACTGAGACCCTCAGAAGTGGAGAGCAAAGCACACCTCACCTCGGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272485 ACTGAGACCCTCAGAAGTGGAGAGCAAAGCACACCTCACCTCGGCTGCGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 ACATCTGGTCCCATGACGTCATGGCGCAG         GTCCAGGTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 272535 ACATCTGGTCCCATGACGTCATGGCGCAGGTA...CAGGTCCAGGTCCTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 CTCTACTACCTGCAGCACCCCCCCATTTCCTTCGCAGAACTCAAGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 273571 CTCTACTACCTGCAGCACCCCCCCATTTCCTTCGCAGAACTCAAGCGGAA

   2750     .    :    .    :    .
   2553 CACACTGTACTTCTCCACCGACGTG
        |||||||||||||||||||||||||
 273621 CACACTGTACTTCTCCACCGACGTG