seq1 = pF1KB3711.tfa, 225 bp
seq2 = pF1KB3711/gi568815597r_235452112.tfa (gi568815597r:235452112_235683838), 231727 bp

>pF1KB3711 225
>gi568815597r:235452112_235683838 (Chr1)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-225  (131602-131727)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGAGGGCATGTCTAATAACAGCACCACTAGCATCTCCCAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGAGGGCATGTCTAATAACAGCACCACTAGCATCTCCCAAGCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAGCTGTGGAGCAGCTAAAGATGGAAGCCTGTATGGACAGGGTCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 GAAAGCTGTGGAGCAGCTAAAGATGGAAGCCTGTATGGACAGGGTCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GTCTCCCAGGCAGCCGCGGACCTCCTGGCCTACTGTGAAGCT
        >>...>>>|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100101 TA...CAGGTCTCCCAGGCAGCTGCGGACCTCCTGGCCTACTGTGAAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACGTGCGGGAAGATCCTCTCATCATTCCAGTGCCTGCATCAGAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131644 CACGTGCGGGAAGATCCTCTCATCATTCCAGTGCCTGCATCAGAAAACCC

    200     .    :    .    :    .    :
    192 CTTTCGCGAGAAGAAGTTCTTTTGTACCATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131694 CTTTCGCGAGAAGAAGTTCTTTTGTACCATTCTC