seq1 = pF1KB3692.tfa, 384 bp
seq2 = pF1KB3692/gi568815587r_33610129.tfa (gi568815587r:33610129_33822445), 212317 bp

>pF1KB3692 384
>gi568815587r:33610129_33822445 (Chr11)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-169  (104975-105076)   100% ->
170-384  (112103-112317)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAATCCAAGGAGGGTCTGTCCTGTTCGGGCTGCTGCTCGTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAATCCAAGGAGGGTCTGTCCTGTTCGGGCTGCTGCTCGTCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCTTCTGCCATTCAG         GTCATAGCCTGCAGTGCTACAACT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCTTCTGCCATTCAGGTG...TAGGTCATAGCCTGCAGTGCTACAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCCTAACCCAACTGCTGACTGCAAAACAGCCGTCAATTGTTCATCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104999 GTCCTAACCCAACTGCTGACTGCAAAACAGCCGTCAATTGTTCATCTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGATGCGTGTCTCATTACCAAAGCTG         GGTTACAAGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105049 TTTGATGCGTGTCTCATTACCAAAGCTGGTA...CAGGGTTACAAGTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAACAAGTGTTGGAAGTTTGAGCATTGCAATTTCAACGACGTCACAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112116 TAACAAGTGTTGGAAGTTTGAGCATTGCAATTTCAACGACGTCACAACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTTGAGGGAAAATGAGCTAACGTACTACTGCTGCAAGAAGGACCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112166 GCTTGAGGGAAAATGAGCTAACGTACTACTGCTGCAAGAAGGACCTGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACTTTAACGAACAGCTTGAAAATGGTGGGACATCCTTATCAGAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112216 AACTTTAACGAACAGCTTGAAAATGGTGGGACATCCTTATCAGAGAAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTTCTTCTGCTGGTGACTCCATTTCTGGCAGCAGCCTGGAGCCTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112266 AGTTCTTCTGCTGGTGACTCCATTTCTGGCAGCAGCCTGGAGCCTTCATC

    400 
    383 CC
        ||
 112316 CC