seq1 = pF1KB3671.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KB3671/gi568815592r_2790166.tfa (gi568815592r:2790166_3000611), 210446 bp

>pF1KB3671 1128
>gi568815592r:2790166_3000611 (Chr6)

(complement)

1-168  (100001-100168)   100% ->
169-306  (104422-104559)   100% ->
307-424  (105104-105221)   100% ->
425-567  (107059-107201)   100% ->
568-723  (108624-108779)   100% ->
724-1128  (110042-110446)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACTCTTTCTAATGCAAGTGGTACTTTTGCCATACGCCTTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACTCTTTCTAATGCAAGTGGTACTTTTGCCATACGCCTTTTAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATACTGTGTCAAGATAACCCTTCGCACAACGTGTTCTGTTCTCCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATACTGTGTCAAGATAACCCTTCGCACAACGTGTTCTGTTCTCCTGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCATCTCCTCTGCCCTGGCCATGGTTCTCCTAGGGGCAAAGGGAAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCATCTCCTCTGCCCTGGCCATGGTTCTCCTAGGGGCAAAGGGAAACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAACCCAGATGGCCCAG         GCACTGTCTTTAAACACAGAGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100151 GCAACCCAGATGGCCCAGGTA...CAGGCACTGTCTTTAAACACAGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGACATTCATCGGGCTTTCCAGTCGCTTCTCACTGAAGTGAACAAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104445 AGACATTCATCGGGCTTTCCAGTCGCTTCTCACTGAAGTGAACAAGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACACAGTACCTGCTGAGAACGGCCAACAGGCTCTTTGGAGAGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104495 GCACACAGTACCTGCTGAGAACGGCCAACAGGCTCTTTGGAGAGAAAACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGTCAGTTCCTCTCA         ACGTTTAAGGAATCCTGTCTTCAATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104545 TGTCAGTTCCTCTCAGTA...AAGACGTTTAAGGAATCCTGTCTTCAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTACCATGCTGAGCTGAAGGAGCTTTCCTTTATCAGAGCTGCAGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105130 CTACCATGCTGAGCTGAAGGAGCTTTCCTTTATCAGAGCTGCAGAAGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGGAAACACATCAACACCTGGGTCTCAAAAAAGACCGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105180 CCAGGAAACACATCAACACCTGGGTCTCAAAAAAGACCGAAGGTC...AA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  GTAAAATTGAAGAGTTGTTGCCGGGTAGCTCAATTGATGCAGAAACCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107058 GGTAAAATTGAAGAGTTGTTGCCGGGTAGCTCAATTGATGCAGAAACCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTGGTTCTTGTCAATGCCATCTACTTCAAAGGAAAGTGGAATGAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107108 GCTGGTTCTTGTCAATGCCATCTACTTCAAAGGAAAGTGGAATGAACCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGACGAAACATACACAAGGGAAATGCCCTTTAAAATAAACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 107158 TTGACGAAACATACACAAGGGAAATGCCCTTTAAAATAAACCAGGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    568    GAGGAGCAAAGGCCAGTGCAGATGATGTATCAGGAGGCCACGTTTAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108621 CAGGAGGAGCAAAGGCCAGTGCAGATGATGTATCAGGAGGCCACGTTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTCGCCCACGTGGGCGAGGTGCGCGCGCAGCTGCTGGAGCTGCCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108671 GCTCGCCCACGTGGGCGAGGTGCGCGCGCAGCTGCTGGAGCTGCCCTACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCAGGAAGGAGCTGAGCCTGCTGGTGCTGCTGCCTGACGACGGCGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108721 CCAGGAAGGAGCTGAGCCTGCTGGTGCTGCTGCCTGACGACGGCGTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCAGCACG         GTGGAAAAAAGTCTCACTTTTGAGAAACTCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108771 CTCAGCACGGTA...CAGGTGGAAAAAAGTCTCACTTTTGAGAAACTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCCTGGACCAAGCCAGACTGTATGAAGAGTACTGAGGTTGAAGTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110074 AGCCTGGACCAAGCCAGACTGTATGAAGAGTACTGAGGTTGAAGTTCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTCCAAAATTTAAACTACAAGAGGATTATGACATGGAATCTGTGCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110124 TTCCAAAATTTAAACTACAAGAGGATTATGACATGGAATCTGTGCTTCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CATTTGGGAATTGTTGATGCCTTCCAACAGGGCAAGGCTGACTTGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110174 CATTTGGGAATTGTTGATGCCTTCCAACAGGGCAAGGCTGACTTGTCGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AATGTCAGCGGAGAGAGACCTGTGTCTGTCCAAGTTCGTGCACAAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110224 AATGTCAGCGGAGAGAGACCTGTGTCTGTCCAAGTTCGTGCACAAGAGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTGTGGAGGTGAATGAAGAAGGCACCGAGGCAGCGGCAGCGTCGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110274 TTGTGGAGGTGAATGAAGAAGGCACCGAGGCAGCGGCAGCGTCGAGCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTTGTAGTTGCAGAGTGCTGCATGGAATCTGGCCCCAGGTTCTGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110324 TTTGTAGTTGCAGAGTGCTGCATGGAATCTGGCCCCAGGTTCTGTGCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCACCCTTTCCTTTTCTTCATCAGGCACAACAGAGCCAACAGCATTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110374 CCACCCTTTCCTTTTCTTCATCAGGCACAACAGAGCCAACAGCATTCTGT

   1150     .    :    .    :
   1106 TCTGTGGCAGGTTCTCATCGCCA
        |||||||||||||||||||||||
 110424 TCTGTGGCAGGTTCTCATCGCCA