seq1 = pF1KB3650.tfa, 1434 bp
seq2 = pF1KB3650/gi568815581r_28267372.tfa (gi568815581r:28267372_28470203), 202832 bp

>pF1KB3650 1434
>gi568815581r:28267372_28470203 (Chr17)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-184  (100158-100277)   100% ->
185-529  (100353-100697)   100% ->
530-669  (100776-100915)   100% ->
670-826  (101176-101332)   100% ->
827-979  (101531-101683)   100% ->
980-1324  (102145-102489)   100% ->
1325-1434  (102723-102832)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCCCTGAGACCCCTTCTCATACTGGCCCTGCTGGCATGGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACCCCTGAGACCCCTTCTCATACTGGCCCTGCTGGCATGGGTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGGCTGACCAAG         AGTCATGCAAGGGCCGCTGCACTGAGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGGCTGACCAAGGTA...TAGAGTCATGCAAGGGCCGCTGCACTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTTCAACGTGGACAAGAAGTGCCAGTGTGACGAGCTCTGCTCTTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100185 GCTTCAACGTGGACAAGAAGTGCCAGTGTGACGAGCTCTGCTCTTACTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAGCTGCTGCACAGACTATACGGCTGAGTGCAAGCCCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100235 CAGAGCTGCTGCACAGACTATACGGCTGAGTGCAAGCCCCAAGGTG...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   TGACTCGCGGGGATGTGTTCACTATGCCGGAGGATGAGTACACGGTCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTGACTCGCGGGGATGTGTTCACTATGCCGGAGGATGAGTACACGGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGACGATGGCGAGGAGAAAAACAATGCCACTGTCCATGAACAGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGACGATGGCGAGGAGAAAAACAATGCCACTGTCCATGAACAGGTGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCCCCTCCCTGACCTCTGACCTCCAGGCCCAGTCCAAAGGGAATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCCCCTCCCTGACCTCTGACCTCCAGGCCCAGTCCAAAGGGAATCCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGACACCTGTTCTGAAACCTGAGGAAGAGGCCCCTGCGCCTGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAGACACCTGTTCTGAAACCTGAGGAAGAGGCCCCTGCGCCTGAGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCGCCTCTAAGCCTGAGGGGATAGACTCAAGGCCTGAGACCCTTCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGCCTCTAAGCCTGAGGGGATAGACTCAAGGCCTGAGACCCTTCATCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGGAGACCTCAGCCCCCAGCAGAGGAGGAGCTGTGCAGTGGGAAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGAGACCTCAGCCCCCAGCAGAGGAGGAGCTGTGCAGTGGGAAGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGACGCCTTCACCGACCTCAAGAACGGTTCCCTCTTTGCCTTCCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100651 CGACGCCTTCACCGACCTCAAGAACGGTTCCCTCTTTGCCTTCCGAGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    530       GGCAGTACTGCTATGAACTGGACGAAAAGGCAGTGAGGCCTGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ...TAGGGCAGTACTGCTATGAACTGGACGAAAAGGCAGTGAGGCCTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACCCCAAGCTCATCCGAGATGTCTGGGGCATCGAGGGCCCCATCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100820 TACCCCAAGCTCATCCGAGATGTCTGGGGCATCGAGGGCCCCATCGATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCCTTCACCCGCATCAACTGTCAGGGGAAGACCTACCTCTTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100870 CGCCTTCACCCGCATCAACTGTCAGGGGAAGACCTACCTCTTCAAGGTG.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670      GGTAGTCAGTACTGGCGCTTTGAGGATGGTGTCCTGGACCCTGAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100920 ..TAGGGTAGTCAGTACTGGCGCTTTGAGGATGGTGTCCTGGACCCTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TACCCCCGAAATATCTCTGACGGCTTCGATGGCATCCCGGACAACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101221 TACCCCCGAAATATCTCTGACGGCTTCGATGGCATCCCGGACAACGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGCAGCCTTGGCCCTCCCTGCCCATAGCTACAGTGGCCGGGAGCGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101271 TGCAGCCTTGGCCCTCCCTGCCCATAGCTACAGTGGCCGGGAGCGGGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACTTCTTCAAGG         GGAAACAGTACTGGGAGTACCAGTTCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101321 ACTTCTTCAAGGGTA...CAGGGAAACAGTACTGGGAGTACCAGTTCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CACCAGCCCAGTCAGGAGGAGTGTGAAGGCAGCTCCCTGTCGGCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101560 CACCAGCCCAGTCAGGAGGAGTGTGAAGGCAGCTCCCTGTCGGCTGTGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGAACACTTTGCCATGATGCAGCGGGACAGCTGGGAGGACATCTTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101610 TGAACACTTTGCCATGATGCAGCGGGACAGCTGGGAGGACATCTTCGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TTCTCTTCTGGGGCAGAACCTCTG         CTGGTACCAGACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101660 TTCTCTTCTGGGGCAGAACCTCTGGTA...CAGCTGGTACCAGACAGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGTTCATTAGCCGGGACTGGCACGGTGTGCCAGGGCAAGTGGACGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102162 CAGTTCATTAGCCGGGACTGGCACGGTGTGCCAGGGCAAGTGGACGCAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CATGGCTGGCCGCATCTACATCTCAGGCATGGCACCCCGCCCCTCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102212 CATGGCTGGCCGCATCTACATCTCAGGCATGGCACCCCGCCCCTCCTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCAAGAAACAAAGGTTTAGGCATCGCAACCGCAAAGGCTACCGTTCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102262 CCAAGAAACAAAGGTTTAGGCATCGCAACCGCAAAGGCTACCGTTCACAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CGAGGCCACAGCCGTGGCCGCAACCAGAACTCCCGCCGGCCATCCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102312 CGAGGCCACAGCCGTGGCCGCAACCAGAACTCCCGCCGGCCATCCCGCGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CACGTGGCTGTCCTTGTTCTCCAGTGAGGAGAGCAACTTGGGAGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102362 CACGTGGCTGTCCTTGTTCTCCAGTGAGGAGAGCAACTTGGGAGCCAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 ACTATGATGACTACAGGATGGACTGGCTTGTGCCTGCCACCTGTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102412 ACTATGATGACTACAGGATGGACTGGCTTGTGCCTGCCACCTGTGAACCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ATCCAGAGTGTCTTCTTCTTCTCTGGAG         ACAAGTACTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102462 ATCCAGAGTGTCTTCTTCTTCTCTGGAGGTA...CAGACAAGTACTACCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AGTCAATCTTCGCACACGGCGAGTGGACACTGTGGACCCTCCCTACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102736 AGTCAATCTTCGCACACGGCGAGTGGACACTGTGGACCCTCCCTACCCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1388 GCTCCATCGCTCAGTACTGGCTGGGCTGCCCAGCTCCTGGCCATCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102786 GCTCCATCGCTCAGTACTGGCTGGGCTGCCCAGCTCCTGGCCATCTG