seq1 = pF1KB3630.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB3630/gi568815597r_112601543.tfa (gi568815597r:112601543_112803799), 202257 bp

>pF1KB3630 579
>gi568815597r:112601543_112803799 (Chr1)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-277  (100681-100801)   100% ->
278-408  (101107-101237)   100% ->
409-579  (102087-102257)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAATCCGAAAGAAGCTGGTGATCGTTGGGGATGGTGCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAATCCGAAAGAAGCTGGTGATCGTTGGGGATGGTGCCTGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGACCTGCCTCCTCATCGTCTTCAGCAAGGATCAGTTTCCGGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGACCTGCCTCCTCATCGTCTTCAGCAAGGATCAGTTTCCGGAGGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGTCCCTACTGTCTTTGAGAACTATATTGCGGACATTGAGGTGGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGTCCCTACTGTCTTTGAGAACTATATTGCGGACATTGAGGTGGACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCAG         GTGGAGCTGGCTCTGTGGGACACAGCAGGGCAGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCAGGTG...CAGGTGGAGCTGGCTCTGTGGGACACAGCAGGGCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGACTATGATCGACTGCGGCCTCTCTCCTACCCGGACACTGATGTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100716 AGACTATGATCGACTGCGGCCTCTCTCCTACCCGGACACTGATGTCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCATGTGCTTCTCCATCGACAGCCCTGACAGCCTGG         AAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100766 TCATGTGCTTCTCCATCGACAGCCCTGACAGCCTGGGTG...CAGAAAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTCCTGAGAAGTGGACCCCAGAGGTGAAGCACTTCTGCCCCAACGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101112 ATTCCTGAGAAGTGGACCCCAGAGGTGAAGCACTTCTGCCCCAACGTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCATCCTGGTGGGGAATAAGAAGGACCTGAGGCAAGACGAGCACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101162 CATCATCCTGGTGGGGAATAAGAAGGACCTGAGGCAAGACGAGCACACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGAGAGAGCTGGCCAAGATGAAGCAG         GAGCCCGTTCGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101212 GGAGAGAGCTGGCCAAGATGAAGCAGGTG...CAGGAGCCCGTTCGGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGGAAGGCCGGGACATGGCGAACCGGATCAGTGCCTTTGGCTACCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102102 GAGGAAGGCCGGGACATGGCGAACCGGATCAGTGCCTTTGGCTACCTTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGCTCAGCCAAGACCAAGGAGGGAGTGCGGGAGGTGTTTGAGATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102152 GTGCTCAGCCAAGACCAAGGAGGGAGTGCGGGAGGTGTTTGAGATGGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCGGGCTGGCCTCCAGGTCCGCAAGAACAAGCGTCGGAGGGGCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102202 CTCGGGCTGGCCTCCAGGTCCGCAAGAACAAGCGTCGGAGGGGCTGTCCC

    600     .
    574 ATTCTC
        ||||||
 102252 ATTCTC