seq1 = pF1KB3614.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KB3614/gi568815588r_74023813.tfa (gi568815588r:74023813_74238379), 214567 bp

>pF1KB3614 1254
>gi568815588r:74023813_74238379 (Chr10)

(complement)

1-273  (100001-100273)   100% ->
274-445  (101577-101748)   100% ->
446-583  (104216-104353)   100% ->
584-669  (108388-108473)   100% ->
670-803  (109139-109272)   100% ->
804-1011  (112025-112232)   100% ->
1012-1156  (113856-114000)   100% ->
1157-1254  (114470-114567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCACAGTCTATTTCTCATAAACTGTTCCGGTGACATATTTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCACAGTCTATTTCTCATAAACTGTTCCGGTGACATATTTCTAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCACTGGAAGAGCGTTGTGAGCCAGTCTGTCTGTGATTATTTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCACTGGAAGAGCGTTGTGAGCCAGTCTGTCTGTGATTATTTCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCTCAAGAGAAAGCTGCTGATGTTGAAAATGTACCACCTGTCATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGCTCAAGAGAAAGCTGCTGATGTTGAAAATGTACCACCTGTCATTTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACACCTCACCACTACCTCATCAGTATCTACCGGGATAAGCTCTTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACACCTCACCACTACCTCATCAGTATCTACCGGGATAAGCTCTTCTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCTGTCATACAGACCGAAGTGCCACCTCTCTTTGTAATTGAGTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCTGTCATACAGACCGAAGTGCCACCTCTCTTTGTAATTGAGTTCCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCGAGTTGCTGACACTTTTCAG         GACTACTTTGGTGAGTGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100251 ATCGAGTTGCTGACACTTTTCAGGTT...CAGGACTACTTTGGTGAGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCAGAGGCTGCAATTAAGGATAATGTGGTCATAGTATATGAACTCTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101595 TCAGAGGCTGCAATTAAGGATAATGTGGTCATAGTATATGAACTCTTAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGAAATGTTAGACAATGGATTTCCACTGGCTACCGAATCTAACATTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101645 AGAAATGTTAGACAATGGATTTCCACTGGCTACCGAATCTAACATTTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGAATTGATTAAACCACCAACAATTCTACGCTCTGTTGTCAACTCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101695 AAGAATTGATTAAACCACCAACAATTCTACGCTCTGTTGTCAACTCTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACAG         GCAGTAGTAATGTTGGGGACACACTCCCCACCGGGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101745 ACAGGTA...TAGGCAGTAGTAATGTTGGGGACACACTCCCCACCGGGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTGTCCAACATACCATGGCGTCGGGCAGGGGTAAAGTACACAAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104253 GCTGTCCAACATACCATGGCGTCGGGCAGGGGTAAAGTACACAAACAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGCCTATTTTGATGTTGTTGAAGAAATAGACGCAATTATAGATAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104303 AAGCCTATTTTGATGTTGTTGAAGAAATAGACGCAATTATAGATAAATCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 G         GATCTACAGTCTTTGCAGAAATTCAGGGGGTCATTGATGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104353 GGTA...CAGGATCTACAGTCTTTGCAGAAATTCAGGGGGTCATTGATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTGCATTAAACTATCTGGAATGCCTGATCTCTCCCTTTCTTTCATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108428 TTGCATTAAACTATCTGGAATGCCTGATCTCTCCCTTTCTTTCATGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670      AACCCTAGGCTTCTGGATGATGTCAGCTTTCACCCCTGCATCCGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108478 ..CAGAACCCTAGGCTTCTGGATGATGTCAGCTTTCACCCCTGCATCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTCAAGCGTTGGGAATCTGAAAGAGTTTTGTCATTTATTCCTCCAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109184 TTCAAGCGTTGGGAATCTGAAAGAGTTTTGTCATTTATTCCTCCAGATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AAATTTCCGACTCATATCATACCGTGTCAGCTCACAAAA         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 109234 AAATTTCCGACTCATATCATACCGTGTCAGCTCACAAAAGTA...TAGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAGTGGCAATACCAGTGTATGTGAAACATAGTATCAGCTTTAAGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112027 TAGTGGCAATACCAGTGTATGTGAAACATAGTATCAGCTTTAAGGAGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGTTCTTGCGGCAGATTTGATATAACAATTGGACCAAAGCAGAATATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112077 AGTTCTTGCGGCAGATTTGATATAACAATTGGACCAAAGCAGAATATGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAAAACTATTGAAGGAATTACAGTGACAGTTCACATGCCAAAAGTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112127 GAAAACTATTGAAGGAATTACAGTGACAGTTCACATGCCAAAAGTTGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGAACATGAACCTGACACCCACACAAGGCAGCTATACATTTGATCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112177 TGAACATGAACCTGACACCCACACAAGGCAGCTATACATTTGATCCAGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACCAAG         GTACTAACATGGGATGTGGGAAAAATTACTCCACA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112227 ACCAAGGTA...AAGGTACTAACATGGGATGTGGGAAAAATTACTCCACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AAAGCTCCCAAGTCTTAAAGGACTGGTAAATTTACAGTCTGGAGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113891 AAAGCTCCCAAGTCTTAAAGGACTGGTAAATTTACAGTCTGGAGCCCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AACCAGAAGAGAATCCGAGCCTCAACATACAGTTTAAGATCCAGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113941 AACCAGAAGAGAATCCGAGCCTCAACATACAGTTTAAGATCCAGCAGCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GCTATTTCAG         GCTTAAAAGTAAACCGTTTGGACATGTATGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 113991 GCTATTTCAGGTA...CAGGCTTAAAAGTAAACCGTTTGGACATGTATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAGAAATATAAGCCATTTAAAGGAGTCAAATACGTCACGAAAGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114501 GGAGAAATATAAGCCATTTAAAGGAGTCAAATACGTCACGAAAGCTGGAA

   1300     .    :    .
   1238 AGTTCCAAGTGAGGACA
        |||||||||||||||||
 114551 AGTTCCAAGTGAGGACA