seq1 = pF1KB3608.tfa, 630 bp
seq2 = pF1KB3608/gi568815576r_39125726.tfa (gi568815576r:39125726_39335844), 210119 bp

>pF1KB3608 630
>gi568815576r:39125726_39335844 (Chr22)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-157  (102321-102410)   100% ->
158-363  (104018-104223)   100% ->
364-508  (105617-105761)   100% ->
509-630  (109998-110119)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAGTGACCACTCGATCCGCTCCTTTGATGATCTCCAACGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGAGTGACCACTCGATCCGCTCCTTTGATGATCTCCAACGCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACGGAGACCCCGGAG         AGGAAGATGGGGCCGAGTTGGACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACGGAGACCCCGGAGGTA...CAGAGGAAGATGGGGCCGAGTTGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAACATGACCCGCTCCCACTCTGGAGGCGAGCTGGAGAGCTTGGCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102345 TGAACATGACCCGCTCCCACTCTGGAGGCGAGCTGGAGAGCTTGGCTCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAAGAAGGAGCCTGG         GTTCCCTGACCATTGCTGAGCCGGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102395 GGAAGAAGGAGCCTGGGTA...CAGGTTCCCTGACCATTGCTGAGCCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATGATCGCCGAGTGCAAGACGCGCACCGAGGTGTTCGAGATCTCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104043 CATGATCGCCGAGTGCAAGACGCGCACCGAGGTGTTCGAGATCTCCCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCTCATAGACCGCACCAACGCCAACTTCCTGGTGTGGCCGCCCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104093 GCCTCATAGACCGCACCAACGCCAACTTCCTGGTGTGGCCGCCCTGTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGTGCAGCGCTGCTCCGGCTGCTGCAACAACCGCAACGTGCAGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104143 GAGGTGCAGCGCTGCTCCGGCTGCTGCAACAACCGCAACGTGCAGTGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCACCCAGGTGCAGCTGCGACCTGTCCAG         GTGAGAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104193 CCCCACCCAGGTGCAGCTGCGACCTGTCCAGGTG...CAGGTGAGAAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCGAGATTGTGCGGAAGAAGCCAATCTTTAAGAAGGCCACGGTGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105627 TCGAGATTGTGCGGAAGAAGCCAATCTTTAAGAAGGCCACGGTGACGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGACCACCTGGCATGCAAGTGTGAGACAGTGGCAGCTGCACGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105677 GAAGACCACCTGGCATGCAAGTGTGAGACAGTGGCAGCTGCACGGCCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GACCCGAAGCCCGGGGGGTTCCCAGGAGCAGCGAG         CCAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105727 GACCCGAAGCCCGGGGGGTTCCCAGGAGCAGCGAGGTA...CAGCCAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGCCCCAAACTCGGGTGACCATTCGGACGGTGCGAGTCCGCCGGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110004 CGCCCCAAACTCGGGTGACCATTCGGACGGTGCGAGTCCGCCGGCCCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGGGCAAGCACCGGAAATTCAAGCACACGCATGACAAGACGGCACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110054 AAGGGCAAGCACCGGAAATTCAAGCACACGCATGACAAGACGGCACTGAA

    650     .    :    .
    615 GGAGACCCTTGGAGCC
        ||||||||||||||||
 110104 GGAGACCCTTGGAGCC