seq1 = pF1KB3606.tfa, 594 bp
seq2 = pF1KB3606/gi568815579r_12697084.tfa (gi568815579r:12697084_12901261), 204178 bp

>pF1KB3606 594
>gi568815579r:12697084_12901261 (Chr19)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-257  (100193-100346)   100% ->
258-380  (100963-101085)   100% ->
381-511  (101273-101403)   100% ->
512-594  (104096-104178)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCGGTAACGCGCGCATCGGAAAGCCAGCCCCTGACTTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCGGTAACGCGCGCATCGGAAAGCCAGCCCCTGACTTCAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAGCGGTGGTTGATGGCGCCTTCAAAGAGGTGAAGCTGTCGGACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAGCGGTGGTTGATGGCGCCTTCAAAGAGGTGAAGCTGTCGGACTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAG         GGAAGTACGTGGTCCTCTTTTTCTACCCTCTGGACTTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGTG...CAGGGAAGTACGTGGTCCTCTTTTTCTACCCTCTGGACTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTTTTGTGTGCCCCACCGAGATCATCGCGTTCAGCAACCGTGCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100231 ACTTTTGTGTGCCCCACCGAGATCATCGCGTTCAGCAACCGTGCAGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCCGCAAGCTGGGCTGTGAAGTGCTGGGCGTCTCGGTGGACTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100281 CTTCCGCAAGCTGGGCTGTGAAGTGCTGGGCGTCTCGGTGGACTCTCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACCCACCTGGCTTG         GATCAACACCCCCCGGAAAGAGGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100331 TCACCCACCTGGCTTGGTA...CAGGATCAACACCCCCCGGAAAGAGGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCTTGGGCCCCCTGAACATCCCCCTGCTTGCTGACGTGACCAGACGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100988 GGCTTGGGCCCCCTGAACATCCCCCTGCTTGCTGACGTGACCAGACGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCTGAGGATTACGGCGTGCTGAAAACAGATGAGGGCATTGCCTACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101038 GTCTGAGGATTACGGCGTGCTGAAAACAGATGAGGGCATTGCCTACAGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381        GGGCCTCTTTATCATCGATGGCAAGGGTGTCCTTCGCCAGATC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101088 A...CAGGGGCCTCTTTATCATCGATGGCAAGGGTGTCCTTCGCCAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACTGTTAATGATTTGCCTGTGGGACGCTCCGTGGATGAGGCTCTGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101316 ACTGTTAATGATTTGCCTGTGGGACGCTCCGTGGATGAGGCTCTGCGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTCCAGGCCTTCCAGTACACAGACGAGCATGGGGAAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101366 GGTCCAGGCCTTCCAGTACACAGACGAGCATGGGGAAGGTG...CAGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTCCCGCTGGCTGGAAGCCTGGCAGTGACACGATTAAGCCCAACGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104099 GTCCCGCTGGCTGGAAGCCTGGCAGTGACACGATTAAGCCCAACGTGGAT

    600     .    :    .    :    .    :
    565 GACAGCAAGGAATATTTCTCCAAACACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 104149 GACAGCAAGGAATATTTCTCCAAACACAAT