seq1 = pF1KB3507.tfa, 1119 bp
seq2 = pF1KB3507/gi568815597r_182284408.tfa (gi568815597r:182284408_182488737), 204330 bp

>pF1KB3507 1119
>gi568815597r:182284408_182488737 (Chr1)

(complement)

1-166  (100001-100166)   100% ->
167-328  (101446-101607)   99% ->
329-475  (102336-102482)   100% ->
476-603  (102851-102978)   100% ->
604-803  (103182-103381)   100% ->
804-1119  (104015-104330)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCACCTCAGCAAGTTCCCACTTAAATAAAGGCATCAAGCAGGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCACCTCAGCAAGTTCCCACTTAAATAAAGGCATCAAGCAGGTGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGTCCCTGCCTCAGGGTGAGAAAGTCCAGGCCATGTATATCTGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGTCCCTGCCTCAGGGTGAGAAAGTCCAGGCCATGTATATCTGGATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGGTACTGGAGAAGGACTGCGCTGCAAGACCCGGACCCTGGACAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGGTACTGGAGAAGGACTGCGCTGCAAGACCCGGACCCTGGACAGTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAAGTGTGTGGAAG         AGTTGCCTGAGTGGAATTTCGATGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAAGTGTGTGGAAGGTG...CAGAGTTGCCTGAGTGGAATTTCGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCAGTACTTTACAGTCTGAGGGTTCCAACAGTGACATGTATCTCGTGC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101471 CTCTAGTACTTTACAGTCTGAGGGTTCCAACAGTGACATGTATCTCGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGCTGCCATGTTTCGGGACCCCTTCCGTAAGGACCCTAACAAGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101521 CTGCTGCCATGTTTCGGGACCCCTTCCGTAAGGACCCTAACAAGCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTATGTGAAGTTTTCAAGTACAATCGAAGGCCTGCAG         AGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101571 TTATGTGAAGTTTTCAAGTACAATCGAAGGCCTGCAGGTG...TAGAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAATTTGAGGCACACCTGTAAACGGATAATGGACATGGTGAGCAACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102340 CAATTTGAGGCACACCTGTAAACGGATAATGGACATGGTGAGCAACCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCCCTGGTTTGGCATGGAGCAGGAGTATACCCTCATGGGGACAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102390 ACCCCTGGTTTGGCATGGAGCAGGAGTATACCCTCATGGGGACAGATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACCCCTTTGGTTGGCCTTCCAACGGCTTCCCAGGGCCCCAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102440 CACCCCTTTGGTTGGCCTTCCAACGGCTTCCCAGGGCCCCAGGGTA...T

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   GTCCATATTACTGTGGTGTGGGAGCAGACAGAGCCTATGGCAGGGACA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102849 AGGTCCATATTACTGTGGTGTGGGAGCAGACAGAGCCTATGGCAGGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCGTGGAGGCCCATTACCGGGCCTGCTTGTATGCTGGAGTCAAGATTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102899 TCGTGGAGGCCCATTACCGGGCCTGCTTGTATGCTGGAGTCAAGATTGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGACTAATGCCGAGGTCATGCCTGCCCAG         TGGGAATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102949 GGGACTAATGCCGAGGTCATGCCTGCCCAGGTA...TAGTGGGAATTTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATTGGACCTTGTGAAGGAATCAGCATGGGAGATCATCTCTGGGTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103193 GATTGGACCTTGTGAAGGAATCAGCATGGGAGATCATCTCTGGGTGGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTTCATCTTGCATCGTGTGTGTGAAGACTTTGGAGTGATAGCAACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103243 GTTTCATCTTGCATCGTGTGTGTGAAGACTTTGGAGTGATAGCAACCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GATCCTAAGCCCATTCCTGGGAACTGGAATGGTGCAGGCTGCCATACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103293 GATCCTAAGCCCATTCCTGGGAACTGGAATGGTGCAGGCTGCCATACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTTCAGCACCAAGGCCATGCGGGAGGAGAATGGTCTGAA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103343 CTTCAGCACCAAGGCCATGCGGGAGGAGAATGGTCTGAAGTG...TAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACATCGAGGAGGCCATTGAGAAACTAAGCAAGCGGCACCAGTACCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104017 ACATCGAGGAGGCCATTGAGAAACTAAGCAAGCGGCACCAGTACCACATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CGTGCCTATGATCCCAAGGGAGGCCTGGACAATGCCCGACGTCTAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104067 CGTGCCTATGATCCCAAGGGAGGCCTGGACAATGCCCGACGTCTAACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ATTCCATGAAACCTCCAACATCAACGACTTTTCTGCTGGTGTAGCCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104117 ATTCCATGAAACCTCCAACATCAACGACTTTTCTGCTGGTGTAGCCAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GTAGCGCCAGCATACGCATTCCCCGGACTGTTGGCCAGGAGAAGAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104167 GTAGCGCCAGCATACGCATTCCCCGGACTGTTGGCCAGGAGAAGAAGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TACTTTGAAGATCGTCGCCCCTCTGCCAACTGCGACCCCTTTTCGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104217 TACTTTGAAGATCGTCGCCCCTCTGCCAACTGCGACCCCTTTTCGGTGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGAAGCCCTCATCCGCACGTGTCTTCTCAATGAAACCGGCGATGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104267 AGAAGCCCTCATCCGCACGTGTCTTCTCAATGAAACCGGCGATGAGCCCT

   1150     .    :
   1106 TCCAGTACAAAAAT
        ||||||||||||||
 104317 TCCAGTACAAAAAT