seq1 = pF1KB3489.tfa, 996 bp
seq2 = pF1KB3489/gi568815580r_63231785.tfa (gi568815580r:63231785_63467118), 235334 bp

>pF1KB3489 996
>gi568815580r:63231785_63467118 (Chr18)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-198  (104251-104340)   100% ->
199-255  (107327-107383)   100% ->
256-321  (111556-111621)   100% ->
322-417  (111820-111915)   100% ->
418-609  (116040-116231)   100% ->
610-693  (122626-122709)   100% ->
694-777  (128236-128319)   100% ->
778-879  (131761-131862)   100% ->
880-996  (135218-135334)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTGCTGGCTGCCGCCTTCCTCGTGGCCTTCGTGCTGCTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTGCTGGCTGCCGCCTTCCTCGTGGCCTTCGTGCTGCTGCTGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGGTGTCTCCGCTCATCAGCCCCAAGCCCCTCGCCCTGCCCGGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGGTGTCTCCGCTCATCAGCCCCAAGCCCCTCGCCCTGCCCGGGGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGGTG         GTTACAGGAGGTTCCAGTGGCATCGGGAAGTGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTGGTGGTG...TAGGTTACAGGAGGTTCCAGTGGCATCGGGAAGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGCTATCGAGTGCTATAAACAAGGAGCTTTTATAACTCTGGTTGCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104284 ATTGCTATCGAGTGCTATAAACAAGGAGCTTTTATAACTCTGGTTGCACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATGAG         GATAAGCTGCTGCAGGCAAAGAAAGAAATTGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104334 AAATGAGGTA...CAGGATAAGCTGCTGCAGGCAAAGAAAGAAATTGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCACTCTATTAATGACAAACAG         GTGGTGCTTTGCATATCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107361 TGCACTCTATTAATGACAAACAGGTA...CAGGTGGTGCTTTGCATATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTTGATGTATCTCAAGACTATAACCAAGTAGAGAATGTCATAAAACAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111574 GTTGATGTATCTCAAGACTATAACCAAGTAGAGAATGTCATAAAACAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322        GCACAGGAGAAACTGGGTCCAGTGGACATGCTGGTAAATTGTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111624 A...TAGGCACAGGAGAAACTGGGTCCAGTGGACATGCTGGTAAATTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CAGGAATGGCAGTGTCAGGAAAATTTGAAGATCTTGAAGTTAGTACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111863 CAGGAATGGCAGTGTCAGGAAAATTTGAAGATCTTGAAGTTAGTACCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAA         AGGTTAATGAGCATCAATTACCTGGGCAGCGTGTACCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111913 GAAGTA...CAGAGGTTAATGAGCATCAATTACCTGGGCAGCGTGTACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAGCCGGGCCGTGATCACCACCATGAAGGAGCGCCGGGTGGGCAGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116078 CAGCCGGGCCGTGATCACCACCATGAAGGAGCGCCGGGTGGGCAGGATCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGTTTGTGTCCTCCCAGGCAGGACAGTTGGGATTATTCGGTTTCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116128 TGTTTGTGTCCTCCCAGGCAGGACAGTTGGGATTATTCGGTTTCACAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACTCTGCATCCAAGTTTGCCATAAGGGGATTGGCAGAAGCTTTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116178 TACTCTGCATCCAAGTTTGCCATAAGGGGATTGGCAGAAGCTTTGCAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGAG         GTGAAGCCATATAATGTCTACATCACAGTTGCTTACC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116228 GGAGGTA...CAGGTGAAGCCATATAATGTCTACATCACAGTTGCTTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CACCAGACACAGACACACCTGGCTTTGCCGAAGAAAACAGAACAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 122663 CACCAGACACAGACACACCTGGCTTTGCCGAAGAAAACAGAACAAAGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694       CCTTTGGAGACTCGACTTATTTCAGAGACCACATCTGTGTGCAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122713 ...TAGCCTTTGGAGACTCGACTTATTTCAGAGACCACATCTGTGTGCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ACCAGAACAGGTGGCCAAACAAATTGTTAAAGATGCCATA         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 128280 ACCAGAACAGGTGGCCAAACAAATTGTTAAAGATGCCATAGTA...TAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AAGGAAATTTCAACAGTTCCCTTGGCTCAGATGGGTACATGCTCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131762 AAGGAAATTTCAACAGTTCCCTTGGCTCAGATGGGTACATGCTCTCGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CTGACCTGTGGGATGGCTCCAGTAACTTCTATTACTGAGGGGCTCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131812 CTGACCTGTGGGATGGCTCCAGTAACTTCTATTACTGAGGGGCTCCAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 G         GTGGTCACCATGGGCCTTTTCCGCACTATTGCTTTGTTTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131862 GGTA...CAGGTGGTCACCATGGGCCTTTTCCGCACTATTGCTTTGTTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACCTTGGAAGTTTTGACAGCATAGTTCGTCGCTGCATGATGCAGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135258 ACCTTGGAAGTTTTGACAGCATAGTTCGTCGCTGCATGATGCAGAGAGAA

   1050     .    :    .    :    .
    970 AAATCTGAAAATGCAGACAAAACTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 135308 AAATCTGAAAATGCAGACAAAACTGCC