seq1 = pF1KB3484.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KB3484/gi568815583f_42411847.tfa (gi568815583f:42411847_42631475), 219629 bp

>pF1KB3484 633
>gi568815583f:42411847_42631475 (Chr15)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-99  (101109-101150)   100% ->
100-148  (101553-101601)   100% ->
149-266  (103391-103508)   100% ->
267-425  (116416-116574)   99% ->
426-570  (117829-117973)   100% ->
571-633  (119567-119629)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAATCTGTCATCAGAAGAAATTCAACAGAGAGCTCACCAGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAATCTGTCATCAGAAGAAATTCAACAGAGAGCTCACCAGATTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATGAG         TCTCTGGAAAGTACGAGGAGAATCCTGGGTTTAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATGAGGTA...TAGTCTCTGGAAAGTACGAGGAGAATCCTGGGTTTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATTGAG         TCTCAGGATGCAGGAATCAAGACCATCACTATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101143 CCATTGAGGTA...TAGTCTCAGGATGCAGGAATCAAGACCATCACTATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTGGATGAACAAAAGG         AACAACTAAACCGCATAGAAGAAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101586 CTGGATGAACAAAAGGGTA...TAGAACAACTAAACCGCATAGAAGAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CTTGGACCAAATAAATAAGGACATGAGAGAGACAGAGAAGACTTTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103416 CTTGGACCAAATAAATAAGGACATGAGAGAGACAGAGAAGACTTTAACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AACTCAACAAATGCTGTGGCCTTTGTGTCTGCCCATGTAATAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103466 AACTCAACAAATGCTGTGGCCTTTGTGTCTGCCCATGTAATAGGTG...T

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    267   AACAAAGAACTTTGAGTCTGGCAAGGCTTATAAGACAACATGGGGAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116414 AGAACAAAGAACTTTGAGTCTGGCAAGGCTTATAAGACAACATGGGGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGGTGGAGAAAACTCACCTTGCAATGTAGTATCTAAACAGCCAGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116464 TGGTGGAGAAAACTCACCTTGCAATGTAGTATCTAAACAGCCAGGCCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGACAAATGGTCAGCTTCAGCAACCAACAACAGGAGCAGCCAGTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 116514 TGACAAATGGTCAGCTTCAGCAACCAACAACGGGAGCAGCCAGTGGTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACATTAAACG         CATAACTAATGATGCCAGAGAAGATGAAAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 116564 TACATTAAACGGTA...TAGCATAACTAATGATGCCAGAGAAGATGAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGAAGAGAACCTGACTCAAGTGGGCAGTATCCTGGGAAATCTAAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117859 GGAAGAGAACCTGACTCAAGTGGGCAGTATCCTGGGAAATCTAAAAGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGCCCTGAACATAGGCAATGAGATTGATGCTCAAAATCCACAAATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117909 TGGCCCTGAACATAGGCAATGAGATTGATGCTCAAAATCCACAAATAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CGAATCACAGACAAG         GCTGACACCAACAGAGATCGTATTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 117959 CGAATCACAGACAAGGTA...CAGGCTGACACCAACAGAGATCGTATTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .
    597 TATTGCCAATGCCAGAGCAAAGAAACTCATTGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119593 TATTGCCAATGCCAGAGCAAAGAAACTCATTGACAGC