seq1 = pF1KB3483.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KB3483/gi568815578f_4599221.tfa (gi568815578f:4599221_4799979), 200759 bp

>pF1KB3483 759
>gi568815578f:4599221_4799979 (Chr20)

1-759  (100001-100759)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTG

    750     .
    751 ATAGTGGGA
        |||||||||
 100751 ATAGTGGGA