seq1 = pF1KB3469.tfa, 573 bp
seq2 = pF1KB3469/gi568815586r_54141758.tfa (gi568815586r:54141758_54357650), 215893 bp

>pF1KB3469 573
>gi568815586r:54141758_54357650 (Chr12)

(complement)

1-137  (100001-100137)   100% ->
138-324  (105424-105610)   100% ->
325-425  (111436-111536)   100% ->
426-573  (115746-115893)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAAGAAAACCAAGCGGACAGCTGACAGTTCTTCTTCAGAGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAAGAAAACCAAGCGGACAGCTGACAGTTCTTCTTCAGAGGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGTATGTTGTGGAGAAGGTGCTAGACAGGCGCGTGGTTAAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGTATGTTGTGGAGAAGGTGCTAGACAGGCGCGTGGTTAAGGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTGGAATATCTACTGAAGTGGAAAGGCTTTTCTGA         GGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100101 AAGTGGAATATCTACTGAAGTGGAAAGGCTTTTCTGAGTA...CAGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACAATACTTGGGAACCTGAGAAAAACTTGGATTGCCCTGAGCTAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105428 CACAATACTTGGGAACCTGAGAAAAACTTGGATTGCCCTGAGCTAATTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAATTTATGAAAAAGTATAAGAAGATGAAGGAGGGTGAAAATAATAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105478 TGAATTTATGAAAAAGTATAAGAAGATGAAGGAGGGTGAAAATAATAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGGGAGAAGTCAGAAAGTAACAAGAGGAAATCCAATTTCTCAAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105528 CCAGGGAGAAGTCAGAAAGTAACAAGAGGAAATCCAATTTCTCAAACAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCGATGACATCAAATCTAAAAAAAAGAGAGAG         CAGAGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105578 GCCGATGACATCAAATCTAAAAAAAAGAGAGAGGTA...TAGCAGAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATATCGCTCGGGGCTTTGAGAGAGGACTGGAACCAGAAAAGATCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111444 TGATATCGCTCGGGGCTTTGAGAGAGGACTGGAACCAGAAAAGATCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCAACAGATTCCTGTGGTGATTTAATGTTCCTAATGAAATG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111494 GGGCAACAGATTCCTGTGGTGATTTAATGTTCCTAATGAAATGGTG...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    426   GAAAGACACAGATGAAGCTGACCTGGTTCTTGCAAAAGAAGCTAATGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115744 AGGAAAGACACAGATGAAGCTGACCTGGTTCTTGCAAAAGAAGCTAATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAAATGTCCACAAATTGTGATAGCATTTTATGAAGAGAGACTGACATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115794 GAAATGTCCACAAATTGTGATAGCATTTTATGAAGAGAGACTGACATGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGCATATCCTGAGGATGCGGAAAACAAAGAGAAAGAAACAGCAAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115844 ATGCATATCCTGAGGATGCGGAAAACAAAGAGAAAGAAACAGCAAAGAGC