Result of SIM4 for
pF1KB3458
seq1 = pF1KB3458.tfa, 3351 bp
seq2 = pF1KB3458/gi568815592r_42128348.tfa (gi568815592r:42128348_42369590), 241243 bp
>pF1KB3458 3351
>gi568815592r:42128348_42369590 (Chr6)
(complement)
1-1437 (100001-101437) 100% ->
1438-1484 (103794-103840) 100% ->
1485-1635 (104737-104887) 100% ->
1636-2020 (109868-110252) 99% ->
2021-2087 (111390-111456) 100% ->
2088-2227 (112489-112628) 100% ->
2228-2331 (112760-112863) 100% ->
2332-2407 (114665-114740) 100% ->
2408-2496 (123047-123135) 100% ->
2497-2610 (126230-126343) 100% ->
2611-2817 (133180-133386) 100% ->
2818-3029 (136699-136910) 100% ->
3030-3351 (140922-141243) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGTGACCAGCAACTGTACAAGACCAACCATGTGGCCCATGGTAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGTGACCAGCAACTGTACAAGACCAACCATGTGGCCCATGGTAGTGA
50 . : . : . : . : . :
51 GAACCTTTTCTACCAACAGCCACCACTTGGCGTCCACAGCGGGCTGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GAACCTTTTCTACCAACAGCCACCACTTGGCGTCCACAGCGGGCTGAACC
100 . : . : . : . : . :
101 ACAACTATGGGAATGCAGTTACAGGGGGCGGAATGGATGCCCCTCAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACAACTATGGGAATGCAGTTACAGGGGGCGGAATGGATGCCCCTCAGGCC
150 . : . : . : . : . :
151 TCGCCAATCTCCCCCCACTTCCCTCAAGATACACGGGATGGTCTGGGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 TCGCCAATCTCCCCCCACTTCCCTCAAGATACACGGGATGGTCTGGGCTT
200 . : . : . : . : . :
201 GCCTGTTGGCTCCAAAAACCTTGGCCAAATGGATACCTCGAGGCAGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GCCTGTTGGCTCCAAAAACCTTGGCCAAATGGATACCTCGAGGCAGGGAG
250 . : . : . : . : . :
251 GGTGGGGAAGTCATGCAGGGCCTGGAAACCATGTCCAGCTACGTGGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GGTGGGGAAGTCATGCAGGGCCTGGAAACCATGTCCAGCTACGTGGAAAC
300 . : . : . : . : . :
301 CTGGCCAACTCAAACATGATGTGGGGGGCACCAGCCCAGGCTGAGCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CTGGCCAACTCAAACATGATGTGGGGGGCACCAGCCCAGGCTGAGCCCAC
350 . : . : . : . : . :
351 TGATGGCTACCAATACACCTACTCCCAGGCCAGCGAGATCCGGACCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 TGATGGCTACCAATACACCTACTCCCAGGCCAGCGAGATCCGGACCCAGA
400 . : . : . : . : . :
401 AGCTTACCAGCGGTGTCTTACACAAGCTGGACTCTTTCACCCAGGTGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 AGCTTACCAGCGGTGTCTTACACAAGCTGGACTCTTTCACCCAGGTGTTT
450 . : . : . : . : . :
451 GCCAACCAAAACCTGCGAATTCAGGTCAACAATATGGCCCAGGTGCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GCCAACCAAAACCTGCGAATTCAGGTCAACAATATGGCCCAGGTGCTGCA
500 . : . : . : . : . :
501 CACTCAGTCAGCAGTGATGGATGGAGCCCCTGACAGTGCTCTCCGCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 CACTCAGTCAGCAGTGATGGATGGAGCCCCTGACAGTGCTCTCCGCCAGC
550 . : . : . : . : . :
551 TGCTGTCTCAGAAGCCCATGGAGCCCCCAGCACCGGCTATCCCTTCCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TGCTGTCTCAGAAGCCCATGGAGCCCCCAGCACCGGCTATCCCTTCCCGC
600 . : . : . : . : . :
601 TACCAGCAGGTGCCCCAGCAGCCTCACCCTGGTTTCACTGGTGGGCTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 TACCAGCAGGTGCCCCAGCAGCCTCACCCTGGTTTCACTGGTGGGCTGTC
650 . : . : . : . : . :
651 CAAACCAGCTCTTCAGGTCGGGCAGCACCCTACCCAAGGGCACCTGTATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 CAAACCAGCTCTTCAGGTCGGGCAGCACCCTACCCAAGGGCACCTGTATT
700 . : . : . : . : . :
701 ATGACTACCAGCAGCCTCTGGCTCAGGTGCCAGTGCAGGGAGGACAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 ATGACTACCAGCAGCCTCTGGCTCAGGTGCCAGTGCAGGGAGGACAGCCA
750 . : . : . : . : . :
751 CTGCAGGCCCCACAGATGCTGTCACAGCACATGCAACAGATGCAGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 CTGCAGGCCCCACAGATGCTGTCACAGCACATGCAACAGATGCAGCAGCA
800 . : . : . : . : . :
801 CCAGTATTACCCACCGCAGCAACAGCAGCAAGCCGGGCAACAGCGTATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CCAGTATTACCCACCGCAGCAACAGCAGCAAGCCGGGCAACAGCGTATCT
850 . : . : . : . : . :
851 CCATGCAAGAAATACAGACGCAGCCGCAACAAATTCGCCCATCACAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 CCATGCAAGAAATACAGACGCAGCCGCAACAAATTCGCCCATCACAGCCA
900 . : . : . : . : . :
901 CAGCCGCCGCCACAGCAGCAGCAGCCGCAGCAGCTACAGCTGCAGCAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 CAGCCGCCGCCACAGCAGCAGCAGCCGCAGCAGCTACAGCTGCAGCAGCG
950 . : . : . : . : . :
951 GCAGGGTTCAATGCAGATACCTCAGTATTATCAGCCCCAACCCATGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 GCAGGGTTCAATGCAGATACCTCAGTATTATCAGCCCCAACCCATGATGC
1000 . : . : . : . : . :
1001 AGCACTTGCAAGAGCAGCAGCAGCAACAGATGCACCTGCAGCCTCCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 AGCACTTGCAAGAGCAGCAGCAGCAACAGATGCACCTGCAGCCTCCTTCT
1050 . : . : . : . : . :
1051 TATCACAGGGACCCTCACCAGTATACCCCAGAGCAGGCACACACTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 TATCACAGGGACCCTCACCAGTATACCCCAGAGCAGGCACACACTGTCCA
1100 . : . : . : . : . :
1101 GCTGATTCCCCTGGGCTCCATGTCCCAGTACTACTACCAGGAGCCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 GCTGATTCCCCTGGGCTCCATGTCCCAGTACTACTACCAGGAGCCCCAGC
1150 . : . : . : . : . :
1151 AGCCCTACAGCCACCCCCTCTACCAGCAGAGCCACCTGTCCCAGCACCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 AGCCCTACAGCCACCCCCTCTACCAGCAGAGCCACCTGTCCCAGCACCAG
1200 . : . : . : . : . :
1201 CAGCGTGAGGACAGTCAGCTGAAGACCTACTCTAGTGACAGACAGGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 CAGCGTGAGGACAGTCAGCTGAAGACCTACTCTAGTGACAGACAGGCCCA
1250 . : . : . : . : . :
1251 GGCCATGCTGAGCTCCCATGGGGACCTGGGGCCTCCTGACACAGGAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 GGCCATGCTGAGCTCCCATGGGGACCTGGGGCCTCCTGACACAGGAATGG
1300 . : . : . : . : . :
1301 GAGACCCAGCGAGCTCAGATCTGACCCGGGTCAGCAGCACCCTCCCCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 GAGACCCAGCGAGCTCAGATCTGACCCGGGTCAGCAGCACCCTCCCCCAT
1350 . : . : . : . : . :
1351 CGCCCCCTCCTATCCCCCAGTGGGATCCACCTCAACAACATGGGGCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 CGCCCCCTCCTATCCCCCAGTGGGATCCACCTCAACAACATGGGGCCTCA
1400 . : . : . : . : . :
1401 GCATCAGCAGCTGTCTCCCAGTGCCATGTGGCCCCAG ATGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
101401 GCATCAGCAGCTGTCTCCCAGTGCCATGTGGCCCCAGGTA...TAGATGC
1450 . : . : . : . : . :
1442 ACCTACCTGATGGGAGAGCCCAGCCAGGGTCCCCTGAGTCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
103798 ACCTACCTGATGGGAGAGCCCAGCCAGGGTCCCCTGAGTCAAGGTA...C
1500 . : . : . : . : . :
1485 TGGCCAACCCAAAGGAGCGTTTGGGGAGCAGTTTGATGCCAAGAACAA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104735 AGTGGCCAACCCAAAGGAGCGTTTGGGGAGCAGTTTGATGCCAAGAACAA
1550 . : . : . : . : . :
1533 GCTGACATGCTCCATCTGCCTGAAGGAGTTCAAGAACCTGCCTGCCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104785 GCTGACATGCTCCATCTGCCTGAAGGAGTTCAAGAACCTGCCTGCCCTGA
1600 . : . : . : . : . :
1583 ATGGCCACATGCGGTCCCACGGGGGAATGAGGGCCTCCCCCAACCTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104835 ATGGCCACATGCGGTCCCACGGGGGAATGAGGGCCTCCCCCAACCTCAAA
1650 . : . : . : . : . :
1633 CAG GAAATCCCCAGGAAGCATCAGCCGAGTGTGCCCAAAGC
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104885 CAGGTT...TAGGAAATCCCCAGGAAGCATCAGCCGAGTGTGCCCAAAGC
1700 . : . : . : . : . :
1674 CGAGGAGCCCCTCAAGACCGTGCAGGAGAAGAAAAAGTTCCGGCACCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109906 CGAGGAGCCCCTCAAGACCGTGCAGGAGAAGAAAAAGTTCCGGCACCGGC
1750 . : . : . : . : . :
1724 CGGAACCTCTCTTCATCCCGCCGCCGCCCTCCTACAACCCGAACCCCGCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109956 CGGAACCTCTCTTCATCCCGCCGCCGCCCTCCTACAACCCGAACCCCGCT
1800 . : . : . : . : . :
1774 GCCTCCTACTCGGGCGCCACCCTGTACCAGAGCCAGCTGCGCTCCCCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110006 GCCTCCTACTCGGGCGCCACCCTGTACCAGAGCCAGCTGCGCTCCCCGCG
1850 . : . : . : . : . :
1824 CGTCCTCGGGGACCACCTGCTCCTGGACCCCACCCACGAGCTGCCCCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110056 CGTCCTCGGGGACCACCTGCTCCTGGACCCCACCCACGAGCTGCCCCCTT
1900 . : . : . : . : . :
1874 ACACGCCCCCACCCATGCTGAGCCCGGTGCGCCAGGGCTCGGGGCTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110106 ACACGCCCCCACCCATGCTGAGCCCGGTGCGCCAGGGCTCGGGGCTCTTC
1950 . : . : . : . : . :
1924 AGCAATGTCCTCATCTCCGGCCACGGCCCTGGCGCCCACCCGCAGCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110156 AGCAATGTCCTCATCTCCGGCCACGGCCCTGGCGCCCACCCGCAGCTGCC
2000 . : . : . : . : . :
1974 CCTGACGCCCCTGACGCCCACACCACGGGTGCTGCTGTGTCGCTCCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
110206 CCTGACGCCCCTGACGCCCACACCACGGGTGCTGCTGTGTCGCTCCAGTG
2050 . : . : . : . : . :
2021 ACAGCATCGATGGCAGCAACGTGACGGTCACCCCAGGGCCTGGA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110256 ...TAGACAGCATCGATGGCAGCAACGTGACGGTCACCCCAGGGCCTGGA
2100 . : . : . : . : . :
2065 GAGCAGACTGTAGATGTTGAACC ACGCATCAACATTGGCTT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
111434 GAGCAGACTGTAGATGTTGAACCGTA...AAGACGCATCAACATTGGCTT
2150 . : . : . : . : . :
2106 GAGATTCCAAGCAGAAATCCCTGAACTCCAAGATATCTCTGCCCTGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112507 GAGATTCCAAGCAGAAATCCCTGAACTCCAAGATATCTCTGCCCTGGCCC
2200 . : . : . : . : . :
2156 AGGACACACACAAGGCCACACTGGTATGGAAGCCCTGGCCAGAACTAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112557 AGGACACACACAAGGCCACACTGGTATGGAAGCCCTGGCCAGAACTAGAA
2250 . : . : . : . : . :
2206 AACCATGACCTCCAGCAAAGAG TGGAGAATCTTCTGAATTT
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
112607 AACCATGACCTCCAGCAAAGAGGTA...CAGTGGAGAATCTTCTGAATTT
2300 . : . : . : . : . :
2247 GTGCTGTTCCAGTGCATTGCCAGGTGGAGGGACCAATTCTGAATTTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112779 GTGCTGTTCCAGTGCATTGCCAGGTGGAGGGACCAATTCTGAATTTGCTT
2350 . : . : . : . : . :
2297 TGCACTCTCTGTTTGAGGCCAAAGGTGATGTGATG GTTGCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
112829 TGCACTCTCTGTTTGAGGCCAAAGGTGATGTGATGGTA...CAGGTTGCT
2400 . : . : . : . : . :
2338 CTGGAAATGCTGCTACTGCGGAAGCCTGTCAGGTTAAAATGTCATCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114671 CTGGAAATGCTGCTACTGCGGAAGCCTGTCAGGTTAAAATGTCATCCTTT
2450 . : . : . : . : . :
2388 AGCAAATTACCACTATGCCG GTTCGGACAAGTGGACCTCCC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
114721 AGCAAATTACCACTATGCCGGTA...TAGGTTCGGACAAGTGGACCTCCC
2500 . : . : . : . : . :
2429 TAGAAAGAAAACTGTTTAACAAAGCACTAGCCACTTACAGCAAAGACTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123068 TAGAAAGAAAACTGTTTAACAAAGCACTAGCCACTTACAGCAAAGACTTT
2550 . : . : . : . : . :
2479 ATTTTTGTACAGAAGATG GTGAAGTCCAAGACGGTGGCTCA
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
123118 ATTTTTGTACAGAAGATGGTA...CAGGTGAAGTCCAAGACGGTGGCTCA
2600 . : . : . : . : . :
2520 GTGCGTGGAGTACTACTACACGTGGAAAAAGATCATGCGGCTGGGGCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126253 GTGCGTGGAGTACTACTACACGTGGAAAAAGATCATGCGGCTGGGGCGGA
2650 . : . : . : . : . :
2570 AACACCGGACACGCCTGGCAGAAATCATCGACGATTGTGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
126303 AACACCGGACACGCCTGGCAGAAATCATCGACGATTGTGTGGTG...TAG
2700 . : . : . : . : . :
2611 ACAAGTGAAGAAGAAGAAGAGTTAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACCCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133180 ACAAGTGAAGAAGAAGAAGAGTTAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACCCGGA
2750 . : . : . : . : . :
2661 AGAAGATAGGAAATCCACAAAAGAAGAAGAGAGTGAGGTGCCGAAGTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133230 AGAAGATAGGAAATCCACAAAAGAAGAAGAGAGTGAGGTGCCGAAGTCCC
2800 . : . : . : . : . :
2711 CGGAGCCACCACCCGTCCCCGTCCTGGCTCCCACGGAGGGGCCGCCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133280 CGGAGCCACCACCCGTCCCCGTCCTGGCTCCCACGGAGGGGCCGCCCCTG
2850 . : . : . : . : . :
2761 CAGGCCCTGGGCCAGCCCTCAGGCTCCTTCATCTGTGAAATGCCCAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133330 CAGGCCCTGGGCCAGCCCTCAGGCTCCTTCATCTGTGAAATGCCCAACTG
2900 . : . : . : . : . :
2811 TGGGGCT GTGTTCAGCTCCCGACAGGCACTGAATGGCCATG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
133380 TGGGGCTGTA...CAGGTGTTCAGCTCCCGACAGGCACTGAATGGCCATG
2950 . : . : . : . : . :
2852 CCCGCATCCACGGGGGCACCAACCAGGTGACCAAGGCCCGAGGTGCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136733 CCCGCATCCACGGGGGCACCAACCAGGTGACCAAGGCCCGAGGTGCCATC
3000 . : . : . : . : . :
2902 CCCTCTGGGAAGCAGAAGCCTGGTGGCACCCAGAGTGGGTACTGTTCGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136783 CCCTCTGGGAAGCAGAAGCCTGGTGGCACCCAGAGTGGGTACTGTTCGGT
3050 . : . : . : . : . :
2952 AAAGAGCTCACCCTCTCACAGCACCACCAGCGGCGAGACAGACCCCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136833 AAAGAGCTCACCCTCTCACAGCACCACCAGCGGCGAGACAGACCCCACCA
3100 . : . : . : . : . :
3002 CCATCTTCCCCTGCAAGGAGTGTGGCAA AGTCTTCTTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
136883 CCATCTTCCCCTGCAAGGAGTGTGGCAAGTA...TAGAGTCTTCTTCAAG
3150 . : . : . : . : . :
3043 ATCAAAAGCCGAAATGCACACATGAAAACTCACAGGCAGCAGGAGGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140935 ATCAAAAGCCGAAATGCACACATGAAAACTCACAGGCAGCAGGAGGAACA
3200 . : . : . : . : . :
3093 ACAGAGGCAAAAGGCTCAGAAGGCGGCTTTTGCAGCTGAGATGGCAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140985 ACAGAGGCAAAAGGCTCAGAAGGCGGCTTTTGCAGCTGAGATGGCAGCCA
3250 . : . : . : . : . :
3143 CGATTGAGAGGACTACGGGGCCCGTGGGGGCGCCGGGGCTGCTGCCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141035 CGATTGAGAGGACTACGGGGCCCGTGGGGGCGCCGGGGCTGCTGCCCCTG
3300 . : . : . : . : . :
3193 GACCAGCTGAGTCTGATCAAACCCATCAAGGATGTGGACATCCTCGACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141085 GACCAGCTGAGTCTGATCAAACCCATCAAGGATGTGGACATCCTCGACGA
3350 . : . : . : . : . :
3243 CGACGTCGTCCAGCAGTTGGGAGGTGTCATGGAAGAGGCTGAAGTTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141135 CGACGTCGTCCAGCAGTTGGGAGGTGTCATGGAAGAGGCTGAAGTTGTGG
3400 . : . : . : . : . :
3293 ACACCGATCTTCTCTTGGATGATCAAGATTCAGTCTTGCTTCAGGGTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141185 ACACCGATCTTCTCTTGGATGATCAAGATTCAGTCTTGCTTCAGGGTGAC
3450 .
3343 GCAGAACTA
|||||||||
141235 GCAGAACTA