seq1 = pF1KB3452.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KB3452/gi568815592f_35368797.tfa (gi568815592f:35368797_35570747), 201951 bp

>pF1KB3452 651
>gi568815592f:35368797_35570747 (Chr6)

1-80  (99997-100077)   96% ->
81-161  (100151-100231)   100% ->
162-310  (100585-100733)   100% ->
311-483  (101383-101555)   100% ->
484-651  (101784-101951)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATG AGCAGCAAAGTCTCTCGCGACACCCTGTACGAGGCGGTGCGGGAAG
          |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 CCGCAGCAGCAAAGTCTCTCGCGACACCCTGTACGAGGCGGTGCGGGAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 TCCTGCACGGGAACCAGCGCAAGCGCCGCAA         GTTCCTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100047 TCCTGCACGGGAACCAGCGCAAGCGCCGCAAGTG...AAGGTTCCTGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     91 ACGGTGGAGTTGCAGATCAGCTTGAAGAACTATGATCCCCAGAAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100161 ACGGTGGAGTTGCAGATCAGCTTGAAGAACTATGATCCCCAGAAGGACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 GCGCTTCTCGGGCACCGTCAG         GCTTAAGTCCACTCCCCGCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100211 GCGCTTCTCGGGCACCGTCAGGTT...CAGGCTTAAGTCCACTCCCCGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    182 CTAAGTTCTCTGTGTGTGTCCTGGGGGACCAGCAGCACTGTGACGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100605 CTAAGTTCTCTGTGTGTGTCCTGGGGGACCAGCAGCACTGTGACGAGGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 AAGGCCGTGGATATCCCCCACATGGACATCGAGGCGCTGAAAAAACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100655 AAGGCCGTGGATATCCCCCACATGGACATCGAGGCGCTGAAAAAACTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 CAAGAATAAAAAACTGGTCAAGAAGCTGG         CCAAGAAGTATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100705 CAAGAATAAAAAACTGGTCAAGAAGCTGGGTG...CAGCCAAGAAGTATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 ATGCGTTTTTGGCCTCAGAGTCTCTGATCAAGCAGATTCCACGAATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101395 ATGCGTTTTTGGCCTCAGAGTCTCTGATCAAGCAGATTCCACGAATCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373 GGCCCAGGTTTAAATAAGGCAGGAAAGTTCCCTTCCCTGCTCACACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101445 GGCCCAGGTTTAAATAAGGCAGGAAAGTTCCCTTCCCTGCTCACACACAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    423 CGAAAACATGGTGGCCAAAGTGGATGAGGTGAAGTCCACAATCAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101495 CGAAAACATGGTGGCCAAAGTGGATGAGGTGAAGTCCACAATCAAGTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473 AAATGAAGAAG         GTGTTATGTCTGGCTGTAGCTGTTGGTCAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101545 AAATGAAGAAGGTG...CAGGTGTTATGTCTGGCTGTAGCTGTTGGTCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514 GTGAAGATGACAGACGATGAGCTTGTGTATAACATTCACCTGGCTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101814 GTGAAGATGACAGACGATGAGCTTGTGTATAACATTCACCTGGCTGTCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564 CTTCTTGGTGTCATTGCTCAAGAAAAACTGGCAGAATGTCCGGGCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101864 CTTCTTGGTGTCATTGCTCAAGAAAAACTGGCAGAATGTCCGGGCCTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .
    614 ATATCAAGAGCACCATGGGCAAGCCCCAGCGCCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101914 ATATCAAGAGCACCATGGGCAAGCCCCAGCGCCTATAT