seq1 = pF1KB3451.tfa, 792 bp
seq2 = pF1KB3451/gi568815583r_43015702.tfa (gi568815583r:43015702_43216493), 200792 bp

>pF1KB3451 792
>gi568815583r:43015702_43216493 (Chr15)

(complement)

1-792  (100001-100792)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTTGGCAAGAACAAGCGCCTTACGAAAGGCGGCAAAAAGGGAGC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGTTGGCAAGAACAAGAGCCTTACGAAAGGCGGCAAAAAGGGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGAAGAAAGTGGTTGATCCATTTTCTAAGAAAGATTGGTATGATGTGA
        ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||
 100051 CAAGAAGAAAGTGGTTGATCCGTTTTCTAAGAAAAATTGGTATGATACGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCACCTGCTATGTTCAATATAAGAAATATTGGAAAGACGCTCGTCACC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||
 100101 AAGCACCTGCTATGTTCAATATATGAAATATTGGAAAGATGCTGGTCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGACCCAAGGAACCAAAATTGCATCTGATGGTCTCAAGGGTCGTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
 100151 AGGACCCAAGGAACCAAAATTGCATCTGATGATCTCAAGGGTCATGTGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAAGTGAGTCTTGCTGATTTGCAGAATGATGAAGTTGCATTTAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAAGTGAGTCTTGCTGATTTGCAGAATGATGAAGTTGCATTTAGAAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAGCTGATTACTGAAGATGTTCAGGGTAAAAACTGCCTGACTAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAGCTGATTACTGAAGATGTTCAGGGTAAAAACTGCCTGACTAACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATGGCATGGATCTTACCCGTGACAAAATGTGTTCCATGGTCAAAAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100301 CATGGCATGGATCTTACCCGTGACAAAACGTGTTCCATGGTCAAAAAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGACAATGATTGAAGCTCACGTTGATGTCAAGACTACCGATGGTTACT
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGACAATGATTGAAGCTCATGTTGATGTCAAGACTACCGATGGTTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTTCGTCTGTTCTGTGTTGGTTTTACTAAAAAACGCAACAATCAGATA
        |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTTCATCTGTTCTGTGTTGGTTTTAATAAAAAACGCAACAATCAGATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGAAGACCTCTTATGCTCAGCACCAACAGGTCCGCCAAATCCGGAAGAA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGGAAGACCTCTTATGCTCAGCACCAACAGGTCCGCCAAATCCGGAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATGATGGAAATCATGACCCGAGAGGTGCAGACAAATGACTTGAAAGAAG
        |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100501 GATGATGGAAATCACGACCCGAGAGGTGCAGACTAATGACTTGAAAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGGTCAATAAATTGATTCCAGACAGCATTGGAAAAGACATAGAAAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGGTCAATAAATTGATTCCAGACAGCATTGGAAAAGACATAGAAAAGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGCCAATCTATTTATCCTCTCCATGATGTCTTCGTTAGAAAAGTAAAAAT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGCCAATCTATTTATCCTCTCCGTGATGTCTTCGTTAGAAAAGTAAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGAAGAAGCCCAAGTTTGAATTGGGAAAGCTCATGGAGCTTCATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100651 GCTGAAGAAGCCCAAGTTTGAATTGGGAAGGCTCATGGAGCTTCATGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGGCAGTAGTTCTGGAAAAGCCACTGGGGACGAGACAGGTGCTAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100701 AAGGCAGTAGTTCTGGAAAAGCCACTGGGGATGAGACAGGTGCTAAAGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAACGAGCTGATGGATATGAACCACCAGTCCAAGAATCTGTT
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGACGAGCTGATGGATATGAACCACCAGTCCAAGAATCTGTT