seq1 = pF1KB3449.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KB3449/gi568815597r_45411332.tfa (gi568815597r:45411332_45619043), 207712 bp

>pF1KB3449 597
>gi568815597r:45411332_45619043 (Chr1)

(complement)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-260  (103237-103390)   100% ->
261-383  (104049-104171)   100% ->
384-514  (104407-104537)   100% ->
515-597  (107630-107712)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCAGGAAATGCTAAAATTGGGCACCCTGCCCCCAACTTCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTCAGGAAATGCTAAAATTGGGCACCCTGCCCCCAACTTCAAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAGCTGTTATGCCAGATGGTCAGTTTAAAGATATCAGCCTGTCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAGCTGTTATGCCAGATGGTCAGTTTAAAGATATCAGCCTGTCTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAAG         GAAAATATGTTGTGTTCTTCTTTTACCCTCTTGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAAAGGTG...CAGGAAAATATGTTGTGTTCTTCTTTTACCCTCTTGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCACCTTTGTGTGCCCCACGGAGATCATTGCTTTCAGTGATAGGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103272 TTCACCTTTGTGTGCCCCACGGAGATCATTGCTTTCAGTGATAGGGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAATTTAAGAAACTCAACTGCCAAGTGATTGGTGCTTCTGTGGATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103322 AGAATTTAAGAAACTCAACTGCCAAGTGATTGGTGCTTCTGTGGATTCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTTCTGTCATCTAGCATG         GGTCAATACACCTAAGAAACAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 103372 ACTTCTGTCATCTAGCATGGTA...TAGGGTCAATACACCTAAGAAACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGAGGACTGGGACCCATGAACATTCCTTTGGTATCAGACCCGAAGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104071 GGAGGACTGGGACCCATGAACATTCCTTTGGTATCAGACCCGAAGCGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATTGCTCAGGATTATGGGGTCTTAAAGGCTGATGAAGGCATCTCGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104121 CATTGCTCAGGATTATGGGGTCTTAAAGGCTGATGAAGGCATCTCGTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 G         GGGCCTTTTTATCATTGATGATAAGGGTATTCTTCGGCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104171 GGTA...CAGGGGCCTTTTTATCATTGATGATAAGGGTATTCTTCGGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCACTGTAAATGACCTCCCTGTTGGCCGCTCTGTGGATGAGACTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104447 ATCACTGTAAATGACCTCCCTGTTGGCCGCTCTGTGGATGAGACTTTGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACTAGTTCAGGCCTTCCAGTTCACTGACAAACATGGGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 104497 ACTAGTTCAGGCCTTCCAGTTCACTGACAAACATGGGGAAGGTA...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGTGCCCAGCTGGCTGGAAACCTGGCAGTGATACCATCAAGCCTGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107630 TGTGCCCAGCTGGCTGGAAACCTGGCAGTGATACCATCAAGCCTGATGTC

    600     .    :    .    :    .    :
    565 CAAAAGAGCAAAGAATATTTCTCCAAGCAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 107680 CAAAAGAGCAAAGAATATTTCTCCAAGCAGAAG