seq1 = pF1KB3446.tfa, 885 bp
seq2 = pF1KB3446/gi568815586r_68452998.tfa (gi568815586r:68452998_68653845), 200848 bp

>pF1KB3446 885
>gi568815586r:68452998_68653845 (Chr12)

(complement)

1-885  (99964-100848)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGAGCCCTTGATGTCCTGCAAATGAAGGAGGAGGATGTCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
  99964 ATGTCCGGAGCCCTTGATGTCCTGCAAATGAGGGAGGAGGATGTCCTTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCTTGCAGCAGGAACCCACTTAGGTGGCACCAATCTTGACTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 GTTCCTTGCAGCAGGAACCCACTTAGGTGGCACCAATCTTGACTTCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAACAGTACATCTATAAAAGGAAAAGTGATGGCATCTATATCATAAAT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100064 TGGAACAGTACATCTATGAAAGGAAAAGTGATGGCATCTATATCATAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAAGAGGACCTGGGAGAAGCTTCTGCTGGCAGCTCGTGCAATTGTTGC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
 100114 CTGAAGAGGACCTGGGAGAAGCTTCTGCTGGCAGCTCATGCTATTGTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTGAAAACCCTGCTGATGTCAGTGTTATATCCTCCAGGAATACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100164 CATTGAAAACCCTGCTGATGTCAGTGTTATATCCTCCAGGAATACTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAGGGCTGTGCTGAAGTTTGCTGCTGCCACTGGAGCCACTCCAATTGCT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100214 AGACGGCTGTGCTGAAGTTTGCTGCTGCCACTGGAGCCACTCCAATTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCGCTTCACTCCTGGAACCTTCACTAACCAGATCCAGGCAGCCTTCCG
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100264 GGGCGCTTCACTCCTGGAACCTTCACTAACCAGATCCAGGCAGCCTTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGCCACGGCTTCTTGTGGTTACTGACCCCAGGGCTGACCACCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100314 GGAGCCACGGCTTCTTGTGGTTACTGACCCCAGGGCTGACCACCAGCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACGGAGGCATCTTATGTTAACCTACCTACCATTGCGCTGTGTAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100364 TCACGGAGGCATCTTATGTTAACCTACCTACCATTGCGCTGTGTAACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATTCTCCTCTGCGCTATGTGGACATTGCCATCCCATGCAACAACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100414 GATTCTCCTCTGCGCTATGTGGACATTGCCATCCCATGCAACAACAAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCTCACTCAGTGGGTTTGATGTGGTGGATGCTGGCTCGGGAAGTTCTGC
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100464 AGCTTACTCAGTGGGTTTGATGTGGTGGATGCTGGCTCGGGAAGTTCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCATGCGTGGCACCATTTCCCGTGAACACCCATGGGAGGTCATGCCTGAT
        |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100514 GCATGCTTGGCACCATTTCCTGTGAACACCCATGGGAGGTCATGCCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTACTTCTACAGAGATCCTGAAGAGATTGAAAAAGAAGAGCAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100564 CTGTACTTCTACAGAGATCCTGAAGAGATTGAAAAAGAAGAGCAGGCTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCTGAGAAGGCAGTGACCAAGGAGGAATTTCAGGGTGAATGGACTGCTC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100614 TGCTGAAAAGGCAGTGACCAAGGAGGAATTTCAGGGTGAATGGACTGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCGCTCCTGAGTTCACTGCTACTCAGCCTGAGGTTGCAGACTGGTCTGAA
        | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100664 CAGCTCCTGAGTTCACTGCTATTCAGCCTGAGGTTGCAGACTGGTCTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTGTACAGGTGCCCTCTGTGCCTATTCAGCAATTCCCTACTGAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100714 GGTGTACAGGTGCCCTCTGTGCCTATTCAGCAATTCCCTACTGAAGACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAGCGCTCAGCCTGCCACGGAAGACTGGTCTGCAGCTCCCACTGCTCAGG
        |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100764 GAGCTCTCAGCCTGCCATGGAAGACTGGTCTGCAGCTCCCACTGCTCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .
    851 CCACTGAATGGGTAGGAGCAACCACTGACTGGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100814 CCACTGAATGGGTAGGAGCAACCACTGACTGGTCT