seq1 = pF1KB3444.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KB3444/gi568815581r_38750135.tfa (gi568815581r:38750135_38953107), 202973 bp

>pF1KB3444 420
>gi568815581r:38750135_38953107 (Chr17)

(complement)

4-97  (99996-100086)   95% ->
98-226  (100376-100504)   100% ->
227-340  (102633-102746)   100% ->
341-420  (102894-102973)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      4 TCGAAGCGAGGACGTGGTGGGTCCTCTGGTGCGAAATTCCGGATTTCCTT
        || -|-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 TCC A C AGGACGTGGTGGGTCCTCTGGTGCGAAATTCCGGATTTCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     54 GGGTCTTCCGGTAGGAGCTGTAATCAATTGTGCTGACAACACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100043 GGGTCTTCCGGTAGGAGCTGTAATCAATTGTGCTGACAACACAGGTG...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98    GAGCCAAAAACCTGTATATCATCTCCGTGAAGGGGATCAAGGGACGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100373 TAGGAGCCAAAAACCTGTATATCATCTCCGTGAAGGGGATCAAGGGACGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145 CTGAACAGACTTCCCGCTGCTGGTGTGGGTGACATGGTGATGGCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100423 CTGAACAGACTTCCCGCTGCTGGTGTGGGTGACATGGTGATGGCCACAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 CAAGAAAGGCAAACCAGAGCTCAGAAAAAAGG         TACATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100473 CAAGAAAGGCAAACCAGAGCTCAGAAAAAAGGGTG...CAGTACATCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236 CAGTGGTCATTCGACAACGAAAGTCATACCGTAGAAAAGATGGCGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102642 CAGTGGTCATTCGACAACGAAAGTCATACCGTAGAAAAGATGGCGTGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286 CTTTATTTTGAAGATAATGCAGGAGTCATAGTGAACAATAAAGGCGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102692 CTTTATTTTGAAGATAATGCAGGAGTCATAGTGAACAATAAAGGCGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    336 GAAAG         GTTCTGCCATTACAGGACCAGTAGCAAAGGAGTGTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102742 GAAAGGTA...CAGGTTCTGCCATTACAGGACCAGTAGCAAAGGAGTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    377 CAGACTTGTGGCCCCGGATTGCATCCAATGCTGGCAGCATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102930 CAGACTTGTGGCCCCGGATTGCATCCAATGCTGGCAGCATTGCA