seq1 = pF1KB3435.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KB3435/gi568815575r_92013245.tfa (gi568815575r:92013245_92214461), 201217 bp

>pF1KB3435 1218
>gi568815575r:92013245_92214461 (ChrX)

(complement)

1-1218  (100001-101217)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCGAGCCAGGATTCCCGATCCAGAGACAATGGCCCCGATGGGAT
        |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTAAGCCAGGATTCCTGATCCAGAGACAATGGCCCCGATGGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCCCGAAGGCGTCATCGAGAGTAACTGGAATGAGATTGTTGACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCCCGAAGGCGTCATCGAGAGTAACTGGAATGAGATTGTTGACAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGATGACATGAACCTCTCGGAGTCCCTTCTCCGTGGCATCTACGCCTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
 100101 TTGATGACATGAACCTCTCGGAGTCCCTTCTCCGTGACATCTATGCCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTTTTGAGAAGCCCTCTGCCATCCAGCAGCGAGCCATTCTACCTTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100151 GGTTTTGAGAAGCCCTCTGCCATCCAGCAGCAAGCCATTCTACCTTGTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGGGTTATGATGTGATTGCTCAAGCCCAATCTGGGACTGGGAAAACGG
        || ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||
 100201 CAGGGGTTATAATGTAATCGCTCAAGCCTGATCTGGGACTGGGAAAATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCACATTTGCCATATCGATTCTGCAGCAGATTGAATTAGATCTAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100251 CCACATTTGCCATATCGATTCTGCAGCAGATTGCATTAGATCTAAAAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCCAGGCCTTGGTCCTAGCACCCACTCGAGAATTGGCTCAGCAGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCCAGGCCTTGGTCCTAGCACCCACTCGAGAATTGGCTCAGCAGATACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGGTGGTCATGGCACTAGGAGACTACATGGGCGCCTCCTGTCACGCCT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||
 100351 GAAGGTGGTCATGGCACTAGTAGACTACATGGGTGCCTCCTGTCATGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTATCGGGGGCACCAACGTGCGTGCTGAGGTGCAGAAACTGCAGATGGAA
        ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTATCAGGGGCACCAATGTGCGTGCTGAGGTGCAGAAACTGCAGATGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTCCCCACATCATCGTGGGTACCCCTGGCCGTGTGTTTGATATGCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
 100451 GCTCCCCACATCATCGTGGGTACCCCTAGCTGTGTGTTTGATATGCTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGGAGATACCTGTCCCCCAAATACATCAAGATGTTTGTACTGGATGAAG
        |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGGAGATACCTATCTCCCAAATACATCAAGATGTTTGTACTGGATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGACGAAATGTTAAGCCGTGGATTCAAGGACCAGATCTATGACATATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGACGAAATGTTAAGCCGTGGATTCAAGGACCAGATCTATGACATATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAAAAGCTCAACAGCAACACCCAGGTAGTTTTGCTGTCAGCCACAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100601 CAAAAGCTCAACAGCAACACCCAGGTAGTTTTGCTGTCAGCTACAATGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCTGATGTGCTTGAGGTGACCAAGAAGTTCATGAGGGACCCCATTCGGA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTCTGATGTGCTTGAGGTGATCAAGAAGTTCATGAGGGACCCCATTCGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCTTGTCAAGAAGGAAGAGTTGACCCTGGAGGGTATCCGCCAGTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100701 TTCTTGTCAAGAAGGAAGAGTTGACCCTGGAGGGTATCCGCCAATTCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCAACGTGGAACGAGAGGAGTGGAAGCTGGACACACTATGTGACTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCAACGTGGAACGAGAGGAGTGGAAGCTGGACACACTATGTGACTTGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAAACCCTGACCATCACCCAGGCAGTCATCTTCATCAACACCCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100801 TGAAACCCTGACCATCACCCAGGCAGTCATCTTCATCAATACCCGGAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGTGGACTGGCTCACCGAGAAGATGCATGCTCGAGATTTCACTGTATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100851 AGGTGGACTGGCTCACCGAGAAGATGCATGCTCGAGATTTCACTGTCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCATGCATGGAGATATGGACCAAAAGGAACGAGACGTGATTATGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||
 100901 GCCATGCATGGAGATATGGACCAAAAGGAGCGAGACGTGATCACGAGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTTTCGTTCTGGCTCTAGCAGAGTTTTGATTACCACTGACCTGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTTTCGTTCTGGCTCTAGCAGAGTTTTGATTACCACTGACCTGCTGGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GAGGCATTGATGTGCAGCAGGTTTCTTTAGTCATCAACTATGACCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAGGCATTGATGTGCAGCAGGTTTCTTTAGTCATCAACTATGACCTTCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ACCAACAGGGAAAACTATATCCACAGAATCGGTCGAGGTGGACGGTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
 101051 ACCAACAGGGAAAACTATATCCACAGAATCAGTCGAGGTGGACAGTTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCGTAAAGGTGTGGCTATTAACATGGTGACAGAAGAAGACAAGAGGACTC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCGTAAAGATGTGGCTATTAACATGGTGACAGAAGAAGACAAGAGGACTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTCGAGACATTGAGACCTTCTACAACACCTCCATTGAGGAAATGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|
 101151 TTCGAGACATTGAGACCTTCTACAACACCTCCATTGAGGAAATGCCCC C

   1200     .    :    .
   1201 AATGTTGCTGACCTCATC
        ||||||||||||||||||
 101200 AATGTTGCTGACCTCATC