seq1 = pF1KB3434.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KB3434/gi568815579f_50623526.tfa (gi568815579f:50623526_50825464), 201939 bp

>pF1KB3434 969
>gi568815579f:50623526_50825464 (Chr19)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-334  (100380-100566)   100% ->
335-526  (100885-101076)   100% ->
527-969  (101497-101939)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGCAGCCTGGCTTTTGGGGGCTTTGGTGGTCCCCCAGCTCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGCAGCCTGGCTTTTGGGGGCTTTGGTGGTCCCCCAGCTCTTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGGCCATGGGGCTCGGGGAGCAGAGAGGGAGTGGGAGGGAGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGGCCATGGGGCTCGGGGAGCAGAGAGGGAGTGGGAGGGAGGCTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGTGCCCAGGAGGAGGAGCGGGAGAGGGAGGCCCTGATGCTGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 GAGGTGCCCAGGAGGAGGAGCGGGAGAGGGAGGCCCTGATGCTGAAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       CATCTGCAGGAAGCCCTAGGACTGCCTGCTGGGAGGGGGGATGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...CAGCATCTGCAGGAAGCCCTAGGACTGCCTGCTGGGAGGGGGGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAATCCTGCCGGAACTGTTGAGGGAAAAGAGGACTGGGAGATGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100424 GAATCCTGCCGGAACTGTTGAGGGAAAAGAGGACTGGGAGATGGAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCAGGGGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGCAACGCCAACCCCATCCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100474 ACCAGGGGGAGGAAGAGGAGGAGGAAGCAACGCCAACCCCATCCTCCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCAGCCCCTCTCCCACCCCTGAGGACATCGTCACTTACATCC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100524 CCCAGCCCCTCTCCCACCCCTGAGGACATCGTCACTTACATCCGTG...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    335   TGGGCCGCCTGGCCGGCCTGGACGCAGGCCTGCACCAGCTGCACGTCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100883 AGTGGGCCGCCTGGCCGGCCTGGACGCAGGCCTGCACCAGCTGCACGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCTGCACGCGTTGGACACCCGCGTGGTCGAGCTGACCCAGGGGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100933 GTCTGCACGCGTTGGACACCCGCGTGGTCGAGCTGACCCAGGGGCTGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGCTGCGGAACGCGGCAGGCGACACCCGCGATGCCGTGCAAGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100983 CAGCTGCGGAACGCGGCAGGCGACACCCGCGATGCCGTGCAAGCCCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGAGGCGCAGGGTCGCGCCGAGCGCGAGCACGGCCGCTTGGAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101033 GGAGGCGCAGGGTCGCGCCGAGCGCGAGCACGGCCGCTTGGAGGGTG...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527    GCTGCCTGAAGGGGCTGCGCCTGGGCCACAAGTGCTTCCTGCTCTCG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101494 CAGGCTGCCTGAAGGGGCTGCGCCTGGGCCACAAGTGCTTCCTGCTCTCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGCGACTTCGAAGCTCAGGCGGCGGCGCAGGCGCGGTGCACGGCGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101544 CGCGACTTCGAAGCTCAGGCGGCGGCGCAGGCGCGGTGCACGGCGCGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGGGAGCCTGGCGCAGCCGGCAGACCGCCAGCAGATGGAGGCGCTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101594 CGGGAGCCTGGCGCAGCCGGCAGACCGCCAGCAGATGGAGGCGCTCACTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGTACCTGCGCGCGGCGCTCGCTCCCTACAACTGGCCCGTGTGGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101644 GGTACCTGCGCGCGGCGCTCGCTCCCTACAACTGGCCCGTGTGGCTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTGCACGATCGGCGCGCCGAGGGCCTCTACCTCTTCGAAAACGGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101694 GTGCACGATCGGCGCGCCGAGGGCCTCTACCTCTTCGAAAACGGCCAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGTGTCCTTCTTCGCCTGGCATCGCTCACCCCGCCCCGAGCTCGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101744 CGTGTCCTTCTTCGCCTGGCATCGCTCACCCCGCCCCGAGCTCGGCGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGCCCAGCGCCTCGCCGCATCCGCTCAGCCCGGACCAGCCCAACGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101794 AGCCCAGCGCCTCGCCGCATCCGCTCAGCCCGGACCAGCCCAACGGTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACGCTCGAGAACTGCGTGGCGCAGGCCTCTGACGACGGCTCCTGGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101844 ACGCTCGAGAACTGCGTGGCGCAGGCCTCTGACGACGGCTCCTGGTGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    924 CCACGACTGCCAGCGGCGTCTCTACTACGTCTGCGAGTTCCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101894 CCACGACTGCCAGCGGCGTCTCTACTACGTCTGCGAGTTCCCCTTC