seq1 = pF1KB3433.tfa, 1281 bp
seq2 = pF1KB3433/gi568815595r_185317498.tfa (gi568815595r:185317498_185518778), 201281 bp

>pF1KB3433 1281
>gi568815595r:185317498_185518778 (Chr3)

(complement)

1-1281  (100001-101281)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTGTGCTCGCCCACTGATATCGGTGTACTCCGAAAAGGGGGAGTC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTGTGCTCGCCCAATGATATCGGTGTACTCCGAAAAGGGGGAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTGGCAAAAATGTCACTTTGCCTGCTGTATTCAAGGCTCCTATTCGAC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTGGCAAAAATGTCACTTAGCCTGCTGTATTCAAGGCTCCTATTCGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGATATTGTGAACTTTGTTCACACCAACTTGCGCAAAAACAACAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGATATTGTGAACTTTGTTCACACCAACTTGCGCAAAAACAACAGACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCTATGCTGTCAGTGAATTAGCAGGTCATCAGACTAGTGCTGAGTCTTG
        ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100151 CCCTACGCTGCCAGTGAATTAGCAGGTCATCAGACCAGTGCTGAGTCTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGTACTGGCAGAGCTGTGGCTCGAATTCCCAGAGTTCGAGGTGGTGGGA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGTACTGGCAGAGCTATGGCTCGAATTCCCAGAGTTCGAGGTGGTGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCACCGCTCTGGCCAGGGTGCTTTTGGAAACATGTGTCGTGGAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCACCGCTCTGGCCAGGGTGCTTTTGGAAACATGTGTCGTGGAGGCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTTGCACCAACCAAAACCTGGCGCCGTTGGCATCGTAGAGTGAACAC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGTTTGCACCAACCAAAACCTGGCGCCGTTGGCATCGTAGAGTGAACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AACCCAAAAACGATACGCCATCTGTTCTGCCCTGGCTGCCTCAGCCCTAC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AACCCAAAAACGATATGCCATCTGTTCTGCCCTGGCTGCCTCAGCCCTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGCACTGGTCATGTCTAAAGGTCATCGTATTGAGGAAGTTCCTGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGCACTGGTCATGTCTAAAGGTCATCGTATTGAGGAAGTTCCTGAACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTTTGGTAGTTGAAGATAAAGTTGAAGGCTACAAGAAGACCAAGGAAGC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTTTGGTATTTGAAGATAAAGTTGAAGGCTACAAGAAGACCAAGGAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTTTTGCTCCTTAAGAAACTTAAAGCCTGGAATGATATCAAAAAGGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100501 TGTTTTGCTCCTTAAGAAACTTAAAGCCTGGAATGATATCGAAAAGGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGCCTCTCAGCGAATGAGAGCTGGCAAAGGCAAAATGAGAAACCGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGCCTCTCAGCGAATGAGAGCTGGCAAAGGCAAAATGAGAAACCGTCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGTATCCAGCGCAGGGGCCCGTGCATCATCTATAATGAGGATAATGGTAT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGTATCCAGCGCAGGGGCCTGTGCATCATCTATAATGAGGATAATGGTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCAAGGCCTTCAGAAACATCCCTGGAATTACTCTGCTTAATGTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCAAGGCCTTCAGAAACATCCCTGGAATTACTCTGCTTAATGTAAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCTGAACATTTTGAAGCTTGCTCCTGGTGGGCATGTGGGACGTTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCTGAACATTTTGAAGCTTGCTCCTGGTGGGCATGTGGGACGTTTCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTTGGACTGAAAGTGCTTTCCGGAAGTTAGATGAATTGTACGGCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100751 ATTTGGACTGAAAGTGCTTTCCGGAAGTTAGATGAATTGTATGGCACTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCGTAAAGCCGCTTCCCTCAAGAGTAACTACAATCTTCCCATGCACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100801 GCGTAAAGCCGCTTCCCTCAAGAGTAACTACAATCTTCCCATGCACAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGATTAATACAGATCTTAGCAGAATCTTGAAAAGCCCAGAGATCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGATTAATACAGATCTTAGCAGAATCTTGAAAAGCCCAGAGATCCAAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCCTTCGAGCACCACGCAAGAAGATCCATCGCAGAGTCCTAAAGAAGAA
        |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100901 GCCCTTTGAGCACCACGCAAGAAGATTCATCGCAGAGTCCTAAAGAAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCCACTGAAAAACTTGAGAATCATGTTGAAGCTAAACCCATATGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCCACTGAAAAACTTGAGAATCATGTTGAAGCTAAACCCATATGCAAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCATGCGCCGGAACACCATTCTTTGCCAGGCCAGGAATCACAAGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCATGCGCCGGAACACCATTCTTCGCCAGGCCAGGAATCACAAGCTCCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTGGATAAGGCAGCTGCTGCAGCAGCGGCACTACAAGCCAAATCAGATGA
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
 101051 GTGGATAAGGCAGCTGCTGCAGCAGCAGCACTACCAGCCAAATCAGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAAGGCGGCGGTTGCAGGCAAGAAGCCTGTGGTAGGTAAGAAAGGAAAGA
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AAAGGCGGCGGTTGCAGGCAAGAAGCCTGTGGTAGGTAAGAAAGGAAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGGCTGCTGTTGGTGTTAAGAAGCAGAAGAAGCCTCTGGTGGGAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGGCTGCTGTTGGTGTTAAGAAGCAGAAGAAGCCTCTGGTGGGAAAAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCAGCAGCTACCAAGAAACCAGCCCCTGAAAAGAAGCCTGCAGAGAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 101201 GCAGCAGCTACCAAGAAACCAGCCCCTGAAAAGAAGCCTGCAGAAAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :
   1251 ACCTACTACAGAGGAGAAGAAGCCTGCTGCA
        ||||||||||||||| |||||||||||||||
 101251 ACCTACTACAGAGGAAAAGAAGCCTGCTGCA