seq1 = pF1KB3408.tfa, 2997 bp
seq2 = pF1KB3408/gi568815581r_3828663.tfa (gi568815581r:3828663_4064291), 235629 bp

>pF1KB3408 2997
>gi568815581r:3828663_4064291 (Chr17)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-136  (110582-110599)   100% ->
137-219  (110863-110945)   100% ->
220-324  (112607-112711)   100% ->
325-463  (112903-113041)   100% ->
464-544  (113519-113599)   100% ->
545-630  (113696-113781)   100% ->
631-1095  (116437-116901)   100% ->
1096-1184  (119144-119232)   100% ->
1185-1287  (119486-119588)   100% ->
1288-1419  (120770-120901)   100% ->
1420-1545  (121561-121686)   100% ->
1546-1764  (122638-122856)   100% ->
1765-2100  (122986-123321)   100% ->
2101-2321  (126656-126876)   99% ->
2322-2524  (127823-128025)   100% ->
2525-2610  (129015-129100)   100% ->
2611-2744  (133858-133991)   99% ->
2745-2862  (134847-134964)   100% ->
2863-2980  (135512-135629)   100% ->
2981-2997  (138851-138867)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCGGCGCATCTGCTCCCGGCCGCCGACGTGCTGCGCCACTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCGGCGCATCTGCTCCCGGCCGCCGACGTGCTGCGCCACTTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGACAGCCGAGGGCGGCCTGAGCCCGGCGCAGGTGACCGGCGCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGACAGCCGAGGGCGGCCTGAGCCCGGCGCAGGTGACCGGCGCGCGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCGCTACGGCCCCAACG         AGCTCCCGAGTGAGGAAG     
        ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||>>>..
 100101 AGCGCTACGGCCCCAACGGTG...CAGAGCTCCCGAGTGAGGAAGGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     GGAAGTCCCTGTGGGAGCTGGTGCTGGAACAGTTTGAGGACCTCCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110605 .CAGGGAAGTCCCTGTGGGAGCTGGTGCTGGAACAGTTTGAGGACCTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGTGCGCATCCTGCTGCTGGCTGCCCTTGTCTCCTTT         GTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 110909 GGTGCGCATCCTGCTGCTGGCTGCCCTTGTCTCCTTTGTA...CAGGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGGCCTGGTTCGAGGAGGGCGAGGAGACCACGACCGCCTTCGTGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112611 TGGCCTGGTTCGAGGAGGGCGAGGAGACCACGACCGCCTTCGTGGAGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGGTCATCATGCTGATCCTCGTGGCCAACGCCATTGTGGGCGTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112661 CTGGTCATCATGCTGATCCTCGTGGCCAACGCCATTGTGGGCGTGTGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         GAACGCAACGCCGAGAGTGCCATCGAGGCCCTGAAGGAGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112711 GGTG...CAGGAACGCAACGCCGAGAGTGCCATCGAGGCCCTGAAGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAGCCTGAGATGGGCAAGGTGATCCGCTCGGACCGCAAGGGCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112943 ATGAGCCTGAGATGGGCAAGGTGATCCGCTCGGACCGCAAGGGCGTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGGATCCGTGCCCGGGACATCGTCCCAGGGGACATTGTAGAAGTGGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112993 AGGATCCGTGCCCGGGACATCGTCCCAGGGGACATTGTAGAAGTGGCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464         TGGGGGACAAAGTGCCTGCTGACCTCCGCCTCATCGAGATCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113043 TA...CAGTGGGGGACAAAGTGCCTGCTGACCTCCGCCTCATCGAGATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGTCCACCACGCTGCGAGTGGACCAGTCCATCCTGACGG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113561 AGTCCACCACGCTGCGAGTGGACCAGTCCATCCTGACGGGTG...CAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAATCTGTGTCCGTGACCAAGCACACAGAGGCCATCCCAGACCCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113698 GAATCTGTGTCCGTGACCAAGCACACAGAGGCCATCCCAGACCCCAGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGTGAACCAGGACAAGAAGAACATGCTGTTTTCT         GGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113748 TGTGAACCAGGACAAGAAGAACATGCTGTTTTCTGTA...CAGGGCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ATATCACATCGGGCAAAGCGGTGGGTGTGGCCGTGGCCACCGGCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116444 ATATCACATCGGGCAAAGCGGTGGGTGTGGCCGTGGCCACCGGCCTGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACGGAGCTGGGCAAGATCCGGAGCCAGATGGCGGCAGTCGAGCCCGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116494 ACGGAGCTGGGCAAGATCCGGAGCCAGATGGCGGCAGTCGAGCCCGAGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GACGCCGCTGCAGCGCAAGCTGGACGAGTTTGGACGGCAGCTGTCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116544 GACGCCGCTGCAGCGCAAGCTGGACGAGTTTGGACGGCAGCTGTCCCACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCATCTCTGTGATCTGCGTGGCCGTGTGGGTCATCAACATCGGCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116594 CCATCTCTGTGATCTGCGTGGCCGTGTGGGTCATCAACATCGGCCACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCGACCCGGCCCACGGTGGCTCCTGGCTGCGTGGCGCTGTCTACTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116644 GCCGACCCGGCCCACGGTGGCTCCTGGCTGCGTGGCGCTGTCTACTACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAAGATCGCCGTGGCCCTGGCGGTGGCGGCCATCCCCGAGGGCCTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116694 CAAGATCGCCGTGGCCCTGGCGGTGGCGGCCATCCCCGAGGGCCTCCCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTGTCATCACTACATGCCTGGCACTGGGCACGCGGCGCATGGCACGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116744 CTGTCATCACTACATGCCTGGCACTGGGCACGCGGCGCATGGCACGCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AACGCCATCGTGCGAAGCCTGCCGTCCGTGGAGACCCTGGGCTGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116794 AACGCCATCGTGCGAAGCCTGCCGTCCGTGGAGACCCTGGGCTGCACCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGTCATCTGCTCCGACAAGACGGGCACGCTCACCACCAATCAGATGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116844 AGTCATCTGCTCCGACAAGACGGGCACGCTCACCACCAATCAGATGTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCTGCCGG         ATGTTCGTGGTAGCCGAGGCCGATGCGGGCTCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 116894 TCTGCCGGGTG...CAGATGTTCGTGGTAGCCGAGGCCGATGCGGGCTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGCCTTTTGCACGAGTTCACCATCTCGGGTACCACGTATACCCCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119177 TGCCTTTTGCACGAGTTCACCATCTCGGGTACCACGTATACCCCCGAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CGAAGT         GCGGCAGGGGGATCAGCCTGTGCGCTGCGGCCAGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119227 CGAAGTGTG...CAGGCGGCAGGGGGATCAGCCTGTGCGCTGCGGCCAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCGACGGGCTGGTGGAGCTGGCGACCATCTGCGCCCTGTGCAACGACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119521 TCGACGGGCTGGTGGAGCTGGCGACCATCTGCGCCCTGTGCAACGACTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GCTCTGGACTACAACGAG         GCCAAGGGTGTGTATGAGAAGGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 119571 GCTCTGGACTACAACGAGGTG...CAGGCCAAGGGTGTGTATGAGAAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGGAGAGGCCACGGAGACAGCTCTGACTTGCCTGGTGGAGAAGATGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120793 GGGAGAGGCCACGGAGACAGCTCTGACTTGCCTGGTGGAGAAGATGAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGTTCGACACCGACCTGCAGGCTCTGTCCCGGGTGGAGCGAGCTGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120843 TGTTCGACACCGACCTGCAGGCTCTGTCCCGGGTGGAGCGAGCTGGCGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TGTAACACG         GTCATCAAGCAGCTGATGCGGAAGGAGTTCAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120893 TGTAACACGGTG...CAGGTCATCAAGCAGCTGATGCGGAAGGAGTTCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCTGGAGTTCTCCCGAGACCGGAAATCCATGTCCGTGTACTGCACGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121593 CCTGGAGTTCTCCCGAGACCGGAAATCCATGTCCGTGTACTGCACGCCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCCGCCCTCACCCTACTGGCCAGGGCAGCAAGATGTTTGTGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 121643 CCCGCCCTCACCCTACTGGCCAGGGCAGCAAGATGTTTGTGAAGGTG...

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546    GGGGCTCCTGAGAGTGTGATCGAGCGCTGTAGCTCAGTCCGCGTGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122635 CAGGGGGCTCCTGAGAGTGTGATCGAGCGCTGTAGCTCAGTCCGCGTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAGCCGCACAGCACCCCTGACCCCCACCTCCAGGGAGCAGATCCTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122685 GAGCCGCACAGCACCCCTGACCCCCACCTCCAGGGAGCAGATCCTGGCAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGATCCGGGATTGGGGCTCAGGCTCAGACACGCTGCGCTGCCTGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122735 AGATCCGGGATTGGGGCTCAGGCTCAGACACGCTGCGCTGCCTGGCACTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCCACCCGGGACGCGCCCCCAAGGAAGGAGGACATGGAGCTGGACGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122785 GCCACCCGGGACGCGCCCCCAAGGAAGGAGGACATGGAGCTGGACGACTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CAGCAAGTTTGTGCAGTACGAG         ACGGACCTGACCTTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 122835 CAGCAAGTTTGTGCAGTACGAGGTG...CAGACGGACCTGACCTTCGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCTGCGTAGGCATGCTGGACCCGCCGCGACCTGAGGTGGCTGCCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123005 GCTGCGTAGGCATGCTGGACCCGCCGCGACCTGAGGTGGCTGCCTGCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 ACACGCTGCTACCAGGCGGGCATCCGCGTGGTCATGATCACGGGGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123055 ACACGCTGCTACCAGGCGGGCATCCGCGTGGTCATGATCACGGGGGATAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CAAAGGCACTGCCGTGGCCATCTGCCGCAGGCTTGGCATCTTTGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123105 CAAAGGCACTGCCGTGGCCATCTGCCGCAGGCTTGGCATCTTTGGGGACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CGGAAGACGTGGCGGGCAAGGCCTACACGGGCCGCGAGTTTGATGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123155 CGGAAGACGTGGCGGGCAAGGCCTACACGGGCCGCGAGTTTGATGACCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AGCCCCGAGCAGCAGCGCCAGGCCTGCCGCACCGCCCGCTGCTTCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123205 AGCCCCGAGCAGCAGCGCCAGGCCTGCCGCACCGCCCGCTGCTTCGCCCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CGTGGAGCCCGCACACAAGTCCCGCATCGTGGAGAACCTGCAGTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123255 CGTGGAGCCCGCACACAAGTCCCGCATCGTGGAGAACCTGCAGTCCTTTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 ACGAGATCACTGCTATG         ACCGGCGATGGAGTGAACGACGCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>|| |||||||||||||||||||||
 123305 ACGAGATCACTGCTATGGTG...CAGACTGGCGATGGAGTGAACGACGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CCAGCCCTGAAGAAAGCAGAGATCGGCATCGCCATGGGCTCAGGCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126680 CCAGCCCTGAAGAAAGCAGAGATCGGCATCGCCATGGGCTCAGGCACGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CGTGGCCAAGTCGGCGGCAGAGATGGTGCTGTCAGATGACAACTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126730 CGTGGCCAAGTCGGCGGCAGAGATGGTGCTGTCAGATGACAACTTTGCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCATCGTGGCTGCGGTGGAGGAGGGCCGGGCCATCTACAGCAACATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126780 CCATCGTGGCTGCGGTGGAGGAGGGCCGGGCCATCTACAGCAACATGAAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CAATTCATCCGCTACCTCATCTCCTCCAATGTTGGCGAGGTCGTCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 126830 CAATTCATCCGCTACCTCATCTCCTCCAATGTTGGCGAGGTCGTCTGGTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2322       CATCTTCCTCACGGCAATTCTGGGCCTGCCCGAAGCCCTGATCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126880 ...CAGCATCTTCCTCACGGCAATTCTGGGCCTGCCCGAAGCCCTGATCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 CTGTGCAGCTGCTCTGGGTGAACCTGGTGACAGACGGCCTACCTGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127867 CTGTGCAGCTGCTCTGGGTGAACCTGGTGACAGACGGCCTACCTGCCACG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 GCTCTGGGCTTCAACCCGCCAGACCTGGACATCATGGAGAAGCTGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127917 GCTCTGGGCTTCAACCCGCCAGACCTGGACATCATGGAGAAGCTGCCCCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 GAGCCCCCGAGAAGCCCTCATCAGTGGCTGGCTCTTCTTCCGATACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127967 GAGCCCCCGAGAAGCCCTCATCAGTGGCTGGCTCTTCTTCCGATACCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 CTATCGGAG         TGTACGTAGGCCTGGCCACAGTGGCTGCCGCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 128017 CTATCGGAGGTG...CAGTGTACGTAGGCCTGGCCACAGTGGCTGCCGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 ACCTGGTGGTTTGTGTATGACGCCGAGGGACCTCACATCAACTTCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129047 ACCTGGTGGTTTGTGTATGACGCCGAGGGACCTCACATCAACTTCTACCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 GCTG         AGGAACTTCCTGAAGTGCTCAGAAGACAACCCGCTCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 129097 GCTGGTG...CAGAGGAACTTCCTGAAGTGCTCCGAAGACAACCCGCTCT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 TTGCCGGCATCGACTGTGAGGTGTTCGAGTCACGCTTCCCCACCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133895 TTGCCGGCATCGACTGTGAGGTGTTCGAGTCACGCTTCCCCACCACCATG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GCCTTGTCCGTGCTCGTGACCATTGAAATGTGCAATGCCCTCAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 133945 GCCTTGTCCGTGCTCGTGACCATTGAAATGTGCAATGCCCTCAACAGGTA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2745       CGTCTCGGAGAACCAGTCGCTGCTGCGGATGCCGCCCTGGATGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133995 ...CAGCGTCTCGGAGAACCAGTCGCTGCTGCGGATGCCGCCCTGGATGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 ACCCCTGGCTGCTGGTGGCTGTGGCCATGTCCATGGCCCTGCACTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134891 ACCCCTGGCTGCTGGTGGCTGTGGCCATGTCCATGGCCCTGCACTTCCTC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 ATCCTGCTCGTGCCGCCCCTGCCT         CTCATTTTCCAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 134941 ATCCTGCTCGTGCCGCCCCTGCCTGTG...CAGCTCATTTTCCAGGTGAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 CCCACTGAGCGGGCGCCAGTGGGTGGTGGTGCTCCAGATATCTCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135529 CCCACTGAGCGGGCGCCAGTGGGTGGTGGTGCTCCAGATATCTCTGCCTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 TCATCCTGCTGGATGAGGCCCTCAAGTACCTGTCCCGGAACCACATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135579 TCATCCTGCTGGATGAGGCCCTCAAGTACCTGTCCCGGAACCACATGCAC

   3150     .    :    .    :    .
   2980 G         AAGAAATGAGCCAGAAG
        |>>>...>>>|||||||||||||||||
 135629 GGTG...CAGAAGAAATGAGCCAGAAG