seq1 = pF1KB3401.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KB3401/gi568815589r_19276296.tfa (gi568815589r:19276296_19479620), 203325 bp

>pF1KB3401 747
>gi568815589r:19276296_19479620 (Chr9)

(complement)

1-138  (99998-100134)   97% ->
139-349  (100703-100913)   100% ->
350-496  (101107-101253)   100% ->
497-654  (102970-103127)   100% ->
655-747  (103233-103325)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTGAACATCTCCTTCCCAGCCACTGGCTGCCAGAAACTCATTGA
         | |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 CTTA GCTGAACATCTCCTTCCCAGCCACTGGCTGCCAGAAACTCATTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGACGATGAACGCAAACTTCGTACTTTCTATGAGAAGCGTATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 AGTGGACGATGAACGCAAACTTCGTACTTTCTATGAGAAGCGTATGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAAGTTGCTGCTGACGCTCTGGGTGAAGAATGGAAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100097 CAGAAGTTGCTGCTGACGCTCTGGGTGAAGAATGGAAGGTA...CAGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGTGGTCCGAATCAGTGGTGGGAACGACAAACAAGGTTTCCCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100706 TATGTGGTCCGAATCAGTGGTGGGAACGACAAACAAGGTTTCCCCATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGGGTGTCTTGACCCATGGCCGTGTCCGCCTGCTACTGAGTAAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100756 GCAGGGTGTCTTGACCCATGGCCGTGTCCGCCTGCTACTGAGTAAGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTCCTGTTACAGACCAAGGAGAACTGGAGAAAGAAAGAGAAAATCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100806 ATTCCTGTTACAGACCAAGGAGAACTGGAGAAAGAAAGAGAAAATCAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGTGGTTGCATTGTGGATGCAAATCTGAGCGTTCTCAACTTGGTTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100856 CGTGGTTGCATTGTGGATGCAAATCTGAGCGTTCTCAACTTGGTTATTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAAAAAAG         GAGAGAAGGATATTCCTGGACTGACTGATACTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100906 AAAAAAAGGTG...AAGGAGAGAAGGATATTCCTGGACTGACTGATACTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGTGCCTCGCCGCCTGGGCCCCAAAAGAGCTAGCAGAATCCGCAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101140 CAGTGCCTCGCCGCCTGGGCCCCAAAAGAGCTAGCAGAATCCGCAAACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTCAATCTCTCTAAAGAAGATGATGTCCGCCAGTATGTTGTAAGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101190 TTCAATCTCTCTAAAGAAGATGATGTCCGCCAGTATGTTGTAAGAAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTAAATAAAGAAG         GTAAGAAACCTAGGACCAAAGCACCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101240 CTTAAATAAAGAAGGTA...TAGGTAAGAAACCTAGGACCAAAGCACCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGATTCAGCGTCTTGTTACTCCACGTGTCCTGCAGCACAAACGGCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102997 AGATTCAGCGTCTTGTTACTCCACGTGTCCTGCAGCACAAACGGCGGCGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTGCTCTGAAGAAGCAGCGTACCAAGAAAAATAAAGAAGAGGCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103047 ATTGCTCTGAAGAAGCAGCGTACCAAGAAAAATAAAGAAGAGGCTGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATATGCTAAACTTTTGGCCAAGAGAATGAAG         GAGGCTAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103097 ATATGCTAAACTTTTGGCCAAGAGAATGAAGGTT...TAGGAGGCTAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGAAGCGCCAGGAACAAATTGCGAAGAGACGCAGACTTTCCTCTCTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103243 AGAAGCGCCAGGAACAAATTGCGAAGAGACGCAGACTTTCCTCTCTGCGA

    750     .    :    .    :    .    :
    715 GCTTCTACTTCTAAGTCTGAATCCAGTCAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 103293 GCTTCTACTTCTAAGTCTGAATCCAGTCAGAAA