seq1 = pF1KB3400.tfa, 315 bp
seq2 = pF1KB3400/gi568815591r_25023704.tfa (gi568815591r:25023704_25224119), 200416 bp

>pF1KB3400 315
>gi568815591r:25023704_25224119 (Chr7)

(complement)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-315  (100271-100416)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGATGTTGAGAAAGGCAAGAAGATTTTTATTATGAAGTGTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGATGTTGAGAAAGGCAAGAAGATTTTTATTATGAAGTGTTCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCCACACCGTTGAAAAGGGAGGCAAGCACAAGACTGGGCCAAATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCCACACCGTTGAAAAGGGAGGCAAGCACAAGACTGGGCCAAATCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGGTCTCTTTGGGCGGAAGACAGGTCAGGCCCCTGGATACTCTTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGGTCTCTTTGGGCGGAAGACAGGTCAGGCCCCTGGATACTCTTACACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGCCAATAAGAACAAAG         GCATCATCTGGGGAGAGGATAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGCCAATAAGAACAAAGGTA...TAGGCATCATCTGGGGAGAGGATAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTGATGGAGTATTTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100293 ACTGATGGAGTATTTGGAGAATCCCAAGAAGTACATCCCTGGAACAAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGATCTTTGTCGGCATTAAGAAGAAGGAAGAAAGGGCAGACTTAATAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100343 TGATCTTTGTCGGCATTAAGAAGAAGGAAGAAAGGGCAGACTTAATAGCT

    300     .    :    .    :
    292 TATCTCAAAAAAGCTACTAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||
 100393 TATCTCAAAAAAGCTACTAATGAG