seq1 = pF1KB3356.tfa, 2577 bp
seq2 = pF1KB3356/gi568815590r_104390676.tfa (gi568815590r:104390676_104688897), 298222 bp

>pF1KB3356 2577
>gi568815590r:104390676_104688897 (Chr8)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-136  (156935-156991)   100% ->
137-272  (179824-179959)   100% ->
273-475  (189379-189581)   100% ->
476-1580  (190822-191926)   100% ->
1581-1713  (193689-193821)   100% ->
1714-2577  (197359-198222)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGTCGCTGGAGCACAAAAGAGTCTCCGCGGTGGAGGTCTGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGTCGCTGGAGCACAAAAGAGTCTCCGCGGTGGAGGTCTGCGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTTGCTTTTCCTCGCTGGGGTGTACG         GAAATGGTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 GCTCTTGCTTTTCCTCGCTGGGGTGTACGGTA...TAGGAAATGGTGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGCAGAACATTCTGAAAATGTGCATATTTCAGGAGTGTCAACTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 156947 TTGCAGAACATTCTGAAAATGTGCATATTTCAGGAGTGTCAACTGGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     CTTGTGGAGAGACTCCAGAGCAAATACGAGCACCAAGTGGCATAAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156997 .CAGCTTGTGGAGAGACTCCAGAGCAAATACGAGCACCAAGTGGCATAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACAAGCCCAGGCTGGCCTTCTGAATATCCTGCAAAAATCAACTGTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179870 CACAAGCCCAGGCTGGCCTTCTGAATATCCTGCAAAAATCAACTGTAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTTCATAAGGGCAAACCCAGGCGAAATCATTACTATAAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 179920 GGTTCATAAGGGCAAACCCAGGCGAAATCATTACTATAAGGTA...CAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTCAGGATTTTGATATTCAAGGATCCAGAAGGTGCAATTTGGACTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189380 TTTCAGGATTTTGATATTCAAGGATCCAGAAGGTGCAATTTGGACTGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GACAATAGAAACATACAAGAATATTGAAAGTTACAGAGCTTGTGGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189430 GACAATAGAAACATACAAGAATATTGAAAGTTACAGAGCTTGTGGTTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAATTCCACCTCCGTATATCTCTTCACAAGACCACATCTGGATTAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189480 CAATTCCACCTCCGTATATCTCTTCACAAGACCACATCTGGATTAGGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CATTCGGATGACAACATCTCTAGAAAGGGTTTCAGACTGGCATATTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189530 CATTCGGATGACAACATCTCTAGAAAGGGTTTCAGACTGGCATATTTTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AG         GGAAATCTGAGGAACCAAATTGTGCTTGTGATCAGTTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189580 AGGTG...CAGGGAAATCTGAGGAACCAAATTGTGCTTGTGATCAGTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GTTGTGGTAATGGAAAGTGTATACCAGAAGCCTGGAAATGTAATAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190861 GTTGTGGTAATGGAAAGTGTATACCAGAAGCCTGGAAATGTAATAACATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGAATGTGGAGATAGTTCCGATGAAGAGATCTGTGCCAAAGAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190911 GATGAATGTGGAGATAGTTCCGATGAAGAGATCTGTGCCAAAGAAGCAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCCTCCAACTGCTGCTGCTTTTCAACCCTGTGCTTACAACCAGTTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190961 TCCTCCAACTGCTGCTGCTTTTCAACCCTGTGCTTACAACCAGTTCCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTTATCCCGTTTTACCAAAGTTTACACTTGCCTCCCCGAATCTTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191011 GTTTATCCCGTTTTACCAAAGTTTACACTTGCCTCCCCGAATCTTTAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGTGATGGGAACATTGACTGCCTTGACCTAGGAGATGAGATAGACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191061 TGTGATGGGAACATTGACTGCCTTGACCTAGGAGATGAGATAGACTGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGTGCCAACATGTGGGCAATGGCTAAAATATTTTTATGGTACTTTTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191111 TGTGCCAACATGTGGGCAATGGCTAAAATATTTTTATGGTACTTTTAATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTCCCAATTATCCAGACTTTTATCCTCCTGGAAGCAATTGCACCTGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191161 CTCCCAATTATCCAGACTTTTATCCTCCTGGAAGCAATTGCACCTGGTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATAGACACTGGTGATCACCGTAAAGTCATTTTACGCTTCACTGACTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191211 ATAGACACTGGTGATCACCGTAAAGTCATTTTACGCTTCACTGACTTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 ACTTGATGGTACTGGTTATGGTGATTATGTCAAAATATATGATGGATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191261 ACTTGATGGTACTGGTTATGGTGATTATGTCAAAATATATGATGGATTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGGAGAATCCACACAAGCTTTTGCGTGTGTTGACAGCTTTTGATTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191311 AGGAGAATCCACACAAGCTTTTGCGTGTGTTGACAGCTTTTGATTCTCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCACCTCTTACAGTTGTTTCTTCTTCTGGACAGATAAGGGTACATTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191361 GCACCTCTTACAGTTGTTTCTTCTTCTGGACAGATAAGGGTACATTTTTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TGCTGATAAAGTGAATGCTGCAAGGGGATTTAATGCTACTTACCAAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191411 TGCTGATAAAGTGAATGCTGCAAGGGGATTTAATGCTACTTACCAAGTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ATGGGTTCTGTTTGCCATGGGAAATACCCTGTGGAGGTAACTGGGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191461 ATGGGTTCTGTTTGCCATGGGAAATACCCTGTGGAGGTAACTGGGGGTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TATACTGAGCAGCAGCGTTGTGATGGGTATTGGCATTGCCCAAATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191511 TATACTGAGCAGCAGCGTTGTGATGGGTATTGGCATTGCCCAAATGGAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGATGAAACCAATTGTACCATGTGCCAGAAGGAAGAATTTCCATGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191561 GGATGAAACCAATTGTACCATGTGCCAGAAGGAAGAATTTCCATGTTCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GAAATGGTGTCTGTTATCCTCGTTCTGATCGCTGCAACTACCAGAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191611 GAAATGGTGTCTGTTATCCTCGTTCTGATCGCTGCAACTACCAGAATCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TGCCCAAATGGCTCAGATGAAAAAAACTGCTTTTTTTGCCAACCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191661 TGCCCAAATGGCTCAGATGAAAAAAACTGCTTTTTTTGCCAACCAGGAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TTTCCATTGTAAAAACAATCGTTGTGTGTTTGAAAGTTGGGTGTGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191711 TTTCCATTGTAAAAACAATCGTTGTGTGTTTGAAAGTTGGGTGTGTGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CTCAAGATGACTGTGGTGATGGCAGCGATGAAGAAAATTGCCCAGTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191761 CTCAAGATGACTGTGGTGATGGCAGCGATGAAGAAAATTGCCCAGTAATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GTGCCTACAAGAGTCATCACTGCTGCCGTCATAGGGAGCCTCATCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191811 GTGCCTACAAGAGTCATCACTGCTGCCGTCATAGGGAGCCTCATCTGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CCTGTTACTCGTCATAGCATTGGGATGTACTTGTAAGCTTTATTCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191861 CCTGTTACTCGTCATAGCATTGGGATGTACTTGTAAGCTTTATTCTCTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GAATGTTTGAAAGAAG         ATCATTTGAAACACAGTTGTCAAGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 191911 GAATGTTTGAAAGAAGGTC...AAGATCATTTGAAACACAGTTGTCAAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GTGGAAGCAGAATTGTTAAGAAGAGAAGCTCCTCCCTCGTATGGACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193714 GTGGAAGCAGAATTGTTAAGAAGAGAAGCTCCTCCCTCGTATGGACAATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GATTGCTCAGGGTTTAATTCCACCAGTTGAAGATTTTCCTGTTTGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193764 GATTGCTCAGGGTTTAATTCCACCAGTTGAAGATTTTCCTGTTTGTTCAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CTAATCAG         GCTTCTGTTTTGGAAAATCTGAGGCTAGCGGTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 193814 CTAATCAGGTA...TAGGCTTCTGTTTTGGAAAATCTGAGGCTAGCGGTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 CGATCTCAGCTTGGATTTACTTCAGTCAGGCTTCCTATGGCAGGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197392 CGATCTCAGCTTGGATTTACTTCAGTCAGGCTTCCTATGGCAGGCAGATC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 AAGCAACATTTGGAACCGTATTTTTAATTTTGCAAGATCACGTCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197442 AAGCAACATTTGGAACCGTATTTTTAATTTTGCAAGATCACGTCATTCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 GGTCATTGGCTTTGGTCTCAGCAGATGGAGATGAGGTTGTCCCTAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197492 GGTCATTGGCTTTGGTCTCAGCAGATGGAGATGAGGTTGTCCCTAGTCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 AGTACCAGTAGAGAACCTGAGAGAAATCATACTCACAGAAGTTTGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197542 AGTACCAGTAGAGAACCTGAGAGAAATCATACTCACAGAAGTTTGTTTTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 CGTGGAGTCTGATGATACAGACACAGAAAATGAGAGAAGAGATATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197592 CGTGGAGTCTGATGATACAGACACAGAAAATGAGAGAAGAGATATGGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 GAGCATCTGGTGGGGTTGCAGCTCCTTTGCCTCAAAAAGTCCCTCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197642 GAGCATCTGGTGGGGTTGCAGCTCCTTTGCCTCAAAAAGTCCCTCCCACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 ACGGCAGTAGAAGCGACAGTAGGAGCATGTGCAAGTTCCTCAACTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197692 ACGGCAGTAGAAGCGACAGTAGGAGCATGTGCAAGTTCCTCAACTCAGAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 TACCCGAGGTGGTCATGCAGATAATGGAAGGGATGTGACAAGTGTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197742 TACCCGAGGTGGTCATGCAGATAATGGAAGGGATGTGACAAGTGTGGAAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 CCCCAAGTGTGAGTCCAGCACGTCACCAGCTTACAAGTGCACTCAGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197792 CCCCAAGTGTGAGTCCAGCACGTCACCAGCTTACAAGTGCACTCAGTCGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 ATGACTCAGGGGCTACGCTGGGTACGTTTTACATTAGGACGATCAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197842 ATGACTCAGGGGCTACGCTGGGTACGTTTTACATTAGGACGATCAAGTTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 CCTAAGTCAGAACCAGAGTCCTTTGAGACAACTTGATAATGGGGTAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197892 CCTAAGTCAGAACCAGAGTCCTTTGAGACAACTTGATAATGGGGTAAGTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2297 GAAGAGAAGATGATGATGATGTTGAAATGCTAATTCCAATTTCTGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197942 GAAGAGAAGATGATGATGATGTTGAAATGCTAATTCCAATTTCTGATGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347 TCTTCAGACTTTGATGTGAATGACTGCTCCAGACCTCTTCTTGATCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197992 TCTTCAGACTTTGATGTGAATGACTGCTCCAGACCTCTTCTTGATCTTGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2397 CTCAGATCAAGGACAAGGGCTTAGACAACCATATAATGCAACAAATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198042 CTCAGATCAAGGACAAGGGCTTAGACAACCATATAATGCAACAAATCCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 GAGTAAGGCCAAGTAATCGAGATGGCCCCTGTGAGCGCTGTGGTATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198092 GAGTAAGGCCAAGTAATCGAGATGGCCCCTGTGAGCGCTGTGGTATTGTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2497 CACACTGCCCAGATACCAGACACTTGCTTAGAAGTAACACTGAAAAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198142 CACACTGCCCAGATACCAGACACTTGCTTAGAAGTAACACTGAAAAACGA

   2600     .    :    .    :    .    :
   2547 AACGAGTGATGATGAGGCTTTGTTACTTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 198192 AACGAGTGATGATGAGGCTTTGTTACTTTGT