seq1 = pF1KB3336.tfa, 1653 bp
seq2 = pF1KB3336/gi568815576r_37028099.tfa (gi568815576r:37028099_37244172), 216074 bp

>pF1KB3336 1653
>gi568815576r:37028099_37244172 (Chr22)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-203  (100538-100652)   100% ->
204-282  (101661-101739)   100% ->
283-388  (104951-105056)   100% ->
389-537  (106438-106586)   100% ->
538-703  (107780-107945)   100% ->
704-818  (108731-108845)   100% ->
819-903  (111705-111789)   100% ->
904-1653  (115325-116074)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCCCTGCTCTGTCCTGGCGTCTGCCCCTCCTCATCCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCCCTGCTCTGTCCTGGCGTCTGCCCCTCCTCATCCTCCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCCTGGCTACCTCTTGGGCATCTGCAGCGGTGAATG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 GCCCCTGGCTACCTCTTGGGCATCTGCAGCGGTGAATGGTG...CAGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTTCCCAGTTCACATGCTTCTACAACTCGAGAGCCAACATCTCCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100541 CTTCCCAGTTCACATGCTTCTACAACTCGAGAGCCAACATCTCCTGTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGAGCCAAGATGGGGCTCTGCAGGACACTTCCTGCCAAGTCCATGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100591 TGGAGCCAAGATGGGGCTCTGCAGGACACTTCCTGCCAAGTCCATGCCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCGGACAGACG         GCGGTGGAACCAAACCTGTGAGCTGCTCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100641 GCCGGACAGACGGTG...AAGGCGGTGGAACCAAACCTGTGAGCTGCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGTGAGTCAAGCATCCTGGGCCTGCAACCTGATCCTCGGAGCCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101690 CCGTGAGTCAAGCATCCTGGGCCTGCAACCTGATCCTCGGAGCCCCAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283          TCTCAGAAACTGACCACAGTTGACATCGTCACCCTGAGGGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101740 GTG...CAGTCTCAGAAACTGACCACAGTTGACATCGTCACCCTGAGGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCTGTGCCGTGAGGGGGTGCGATGGAGGGTGATGGCCATCCAGGACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104992 GCTGTGCCGTGAGGGGGTGCGATGGAGGGTGATGGCCATCCAGGACTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCCTTTGAGAACC         TTCGCCTGATGGCCCCCATCTCCCTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105042 AGCCCTTTGAGAACCGTG...CAGTTCGCCTGATGGCCCCCATCTCCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAAGTTGTCCACGTGGAGACCCACAGATGCAACATAAGCTGGGAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106464 CAAGTTGTCCACGTGGAGACCCACAGATGCAACATAAGCTGGGAAATCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAAGCCTCCCACTACTTTGAAAGACACCTGGAGTTCGAGGCCCGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106514 CCAAGCCTCCCACTACTTTGAAAGACACCTGGAGTTCGAGGCCCGGACGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGTCCCCAGGCCACACCTGGGAG         GAGGCCCCCCTGCTGACT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106564 TGTCCCCAGGCCACACCTGGGAGGTG...CAGGAGGCCCCCCTGCTGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTCAAGCAGAAGCAGGAATGGATCTGCCTGGAGACGCTCACCCCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107798 CTCAAGCAGAAGCAGGAATGGATCTGCCTGGAGACGCTCACCCCAGACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAGTATGAGTTTCAGGTGCGGGTCAAGCCTCTGCAAGGCGAGTTCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107848 CCAGTATGAGTTTCAGGTGCGGGTCAAGCCTCTGCAAGGCGAGTTCACGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCTGGAGCCCCTGGAGCCAGCCCCTGGCCTTCAGGACAAAGCCTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 107898 CCTGGAGCCCCTGGAGCCAGCCCCTGGCCTTCAGGACAAAGCCTGCAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    704        CCCTTGGGAAGGACACCATTCCGTGGCTCGGCCACCTCCTCGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107948 A...CAGCCCTTGGGAAGGACACCATTCCGTGGCTCGGCCACCTCCTCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGGCCTCAGCGGGGCTTTTGGCTTCATCATCTTAGTGTACTTGCTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108774 GGGCCTCAGCGGGGCTTTTGGCTTCATCATCTTAGTGTACTTGCTGATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACTGCAGGAACACCGGGCCATG         GCTGAAGAAGGTCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108824 ACTGCAGGAACACCGGGCCATGGTA...CAGGCTGAAGAAGGTCCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TGTAACACCCCAGACCCCTCGAAGTTCTTTTCCCAGCTGAGCTCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111724 TGTAACACCCCAGACCCCTCGAAGTTCTTTTCCCAGCTGAGCTCAGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGGAGGAGACGTCCAG         AAGTGGCTCTCTTCGCCCTTCCCCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 111774 TGGAGGAGACGTCCAGGTA...CAGAAGTGGCTCTCTTCGCCCTTCCCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CATCGTCCTTCAGCCCTGGCGGCCTGGCACCTGAGATCTCGCCACTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115350 CATCGTCCTTCAGCCCTGGCGGCCTGGCACCTGAGATCTCGCCACTAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTGCTGGAGAGGGACAAGGTGACGCAGCTGCTCCTGCAGCAGGACAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115400 GTGCTGGAGAGGGACAAGGTGACGCAGCTGCTCCTGCAGCAGGACAAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCCTGAGCCCGCATCCTTAAGCAGCAACCACTCGCTGACCAGCTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115450 GCCTGAGCCCGCATCCTTAAGCAGCAACCACTCGCTGACCAGCTGCTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCAACCAGGGTTACTTCTTCTTCCACCTCCCGGATGCCTTGGAGATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115500 CCAACCAGGGTTACTTCTTCTTCCACCTCCCGGATGCCTTGGAGATAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCCTGCCAGGTGTACTTTACTTACGACCCCTACTCAGAGGAAGACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115550 GCCTGCCAGGTGTACTTTACTTACGACCCCTACTCAGAGGAAGACCCTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGAGGGTGTGGCCGGGGCACCCACAGGGTCTTCCCCCCAACCCCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115600 TGAGGGTGTGGCCGGGGCACCCACAGGGTCTTCCCCCCAACCCCTGCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTCTGTCAGGGGAGGACGACGCCTACTGCACCTTCCCCTCCAGGGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115650 CTCTGTCAGGGGAGGACGACGCCTACTGCACCTTCCCCTCCAGGGATGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTGCTGCTCTTCTCCCCCAGTCTCCTCGGTGGCCCCAGCCCCCCAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115700 CTGCTGCTCTTCTCCCCCAGTCTCCTCGGTGGCCCCAGCCCCCCAAGCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGCCCCTGGGGGCAGTGGGGCCGGTGAAGAGAGGATGCCCCCTTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115750 TGCCCCTGGGGGCAGTGGGGCCGGTGAAGAGAGGATGCCCCCTTCTTTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 AAGAAAGAGTCCCCAGAGACTGGGACCCCCAGCCCCTGGGGCCTCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115800 AAGAAAGAGTCCCCAGAGACTGGGACCCCCAGCCCCTGGGGCCTCCCACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CCAGGAGTCCCAGACCTGGTGGATTTTCAGCCACCCCCTGAGCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115850 CCAGGAGTCCCAGACCTGGTGGATTTTCAGCCACCCCCTGAGCTGGTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GCGAGAGGCTGGGGAGGAGGTCCCTGACGCTGGCCCCAGGGAGGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115900 GCGAGAGGCTGGGGAGGAGGTCCCTGACGCTGGCCCCAGGGAGGGAGTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GTTTCCCCTGGTCCAGGCCTCCTGGGCAGGGGGAGTTCAGGGCCCTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115950 GTTTCCCCTGGTCCAGGCCTCCTGGGCAGGGGGAGTTCAGGGCCCTTAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GCTCGCCTGCCCCTGAACACTGATGCCTACTTGTCCCTCCAAGAACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116000 GCTCGCCTGCCCCTGAACACTGATGCCTACTTGTCCCTCCAAGAACTCCA

   1700     .    :    .    :    .
   1629 GGGTCAGGACCCAACTCACTTGGTG
        |||||||||||||||||||||||||
 116050 GGGTCAGGACCCAACTCACTTGGTG