seq1 = pF1KB3321.tfa, 2769 bp
seq2 = pF1KB3321/gi568815586r_47637570.tfa (gi568815586r:47637570_47858080), 220511 bp

>pF1KB3321 2769
>gi568815586r:47637570_47858080 (Chr12)

(complement)

1-219  (99996-100215)   98% ->
220-273  (106112-106165)   100% ->
274-380  (106252-106358)   100% ->
381-502  (106561-106682)   100% ->
503-671  (106865-107033)   99% ->
672-756  (107656-107740)   100% ->
757-817  (108091-108151)   100% ->
818-894  (108264-108340)   100% ->
895-1041  (108545-108691)   100% ->
1042-1154  (109150-109262)   100% ->
1155-1243  (109539-109627)   100% ->
1244-1322  (109929-110007)   100% ->
1323-1473  (110219-110369)   100% ->
1474-1556  (110455-110537)   100% ->
1557-1596  (111182-111221)   100% ->
1597-1678  (114013-114094)   100% ->
1679-1825  (114405-114551)   100% ->
1826-1923  (116479-116576)   100% ->
1924-2049  (117041-117166)   100% ->
2050-2231  (117258-117439)   100% ->
2232-2322  (117686-117776)   100% ->
2323-2373  (117890-117940)   100% ->
2374-2461  (118851-118938)   100% ->
2462-2526  (119327-119391)   100% ->
2527-2581  (119834-119888)   100% ->
2582-2653  (119988-120059)   100% ->
2654-2769  (120396-120511)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGA AGGTGGGCTGGCCAGGTGAGAGCTGCTGGCAGGTGGGCCTGGCTG
         | |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 GTCACAGGTGGGCTGGCCAGGTGAGAGCTGCTGGCAGGTGGGCCTGGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 TGGAGGATAGCCCAGCTCTGGGAGCACCGCGGGTGGGAGCCCTCCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 TGGAGGATAGCCCAGCTCTGGGAGCACCGCGGGTGGGAGCCCTCCCTGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 GTGGTGCCGGAGGGGACACTACTCAACATGGTGTTGAGAAGGATGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100096 GTGGTGCCGGAGGGGACACTACTCAACATGGTGTTGAGAAGGATGCACCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 GCCCCGAAGCTGCTCCTACCAGCTGCTGCTGGAGCACCAGCGTCCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100146 GCCCCGAAGCTGCTCCTACCAGCTGCTGCTGGAGCACCAGCGTCCGAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200 GCATCCAGGGGCTGCGCTGG         ACACCACTCACCAACAGCGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100196 GCATCCAGGGGCTGCGCTGGGTG...CAGACACCACTCACCAACAGCGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 GAGTCCCTGGATTTCAGCGAGAGCCTGGAGCAG         GCCTCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106133 GAGTCCCTGGATTTCAGCGAGAGCCTGGAGCAGGTA...AAGGCCTCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 AGAGCGGGTGCTCAGGGCTGGGAGGCAGCTGCATCGGCATCTGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106260 AGAGCGGGTGCTCAGGGCTGGGAGGCAGCTGCATCGGCATCTGCTGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332 CCTGCCCAAACCTCATCCGAGACCGGAAGTACCACCTTAGGCTCTATCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106310 CCTGCCCAAACCTCATCCGAGACCGGAAGTACCACCTTAGGCTCTATCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381         GCAGTGCTGCTCTGGCCGGGAGCTGGTGGATGGGATCTTGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106360 TG...TAGGCAGTGCTGCTCTGGCCGGGAGCTGGTGGATGGGATCTTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    423 CCTGGGACTTGGGGTCCATTCCCGGAGCCAAGTTGTGGGAATCTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106603 CCTGGGACTTGGGGTCCATTCCCGGAGCCAAGTTGTGGGAATCTGCCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    473 TGCTGCTGGATGAAGGTGCCCTCTGCCATG         TGAAACACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106653 TGCTGCTGGATGAAGGTGCCCTCTGCCATGGTG...CAGTGAAACACGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514 TGGGCCTTCCAGGACCGAGATGCCCAATTCTACCGGTTCCCCGGGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106876 TGGGCCTTCCAGGACCGAGATGCCCAATTCTACCGGTTCCCCGGGCCCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564 GCCCGAGCCCGTGGGAACTCATGAGATGGAGGAGGAGTTGGCCGAAGCTG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106926 GCCCGAGCCCGTGAGAACTCATGAGATGGAGGAGGAGTTGGCCGAAGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614 TGGCCCTGCTCTCCCAGCGGGGGCCTGACGCCCTGCTCACTGTGGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106976 TGGCCCTGCTCTCCCAGCGGGGGCCTGACGCCCTGCTCACTGTGGCACTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664 CGAAAGCC         CCCAGGTCAGCGCACGGATGAAGAGCTGGACCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107026 CGAAAGCCGTG...CAGCCCAGGTCAGCGCACGGATGAAGAGCTGGACCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    705 CATCTTTGAGGAGCTGCTGCACATCAAGGCTGTGGCCCACCTCTCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107689 CATCTTTGAGGAGCTGCTGCACATCAAGGCTGTGGCCCACCTCTCCAACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    755 CG         GTGAAGCGAGAATTAGCGGCTGTTCTGCTCTTTGAACCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107739 CGGTC...CAGGTGAAGCGAGAATTAGCGGCTGTTCTGCTCTTTGAACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796 CACAGCAAGGCAGGGACCGTGT         TGTTCAGCCAGGGGGACAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108130 CACAGCAAGGCAGGGACCGTGTGTA...CAGTGTTCAGCCAGGGGGACAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    837 GGGCACTTCGTGGTACATTATCTGGAAGGGATCTGTCAACGTGGTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108283 GGGCACTTCGTGGTACATTATCTGGAAGGGATCTGTCAACGTGGTGACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    887 ATGGCAAG         GGGCTGGTGACCACCCTGCATGAGGGAGATGAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108333 ATGGCAAGGTG...CAGGGGCTGGTGACCACCCTGCATGAGGGAGATGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    928 TTTGGACAGCTGGCTCTGGTGAATGATGCACCCCGGGCAGCCACCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108578 TTTGGACAGCTGGCTCTGGTGAATGATGCACCCCGGGCAGCCACCATCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    978 CCTGCGAGAAGACAACTGTCATTTCCTGCGTGTGGACAAGCAGGACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108628 CCTGCGAGAAGACAACTGTCATTTCCTGCGTGTGGACAAGCAGGACTTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1028 ACCGTATCATCAAG         GATGTGGAGGCAAAGACCATGCGGCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108678 ACCGTATCATCAAGGTG...CAGGATGTGGAGGCAAAGACCATGCGGCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1069 GAAGAACATGGCAAAGTGGTGCTGGTGCTGGAGAGAGCCTCTCAGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109177 GAAGAACATGGCAAAGTGGTGCTGGTGCTGGAGAGAGCCTCTCAGGGCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119 CGGCCCTTCCCGACCCCCAACCCCAGGCAGGAACCG         GTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 109227 CGGCCCTTCCCGACCCCCAACCCCAGGCAGGAACCGGTA...TAGGTATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1160 CAGTGATGTCTGGCACCCCAGAGAAGATCCTAGAGCTTCTGTTGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109544 CAGTGATGTCTGGCACCCCAGAGAAGATCCTAGAGCTTCTGTTGGAGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1210 ATGGGACCAGATTCCAGTGCTCATGACCCAACAG         AGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109594 ATGGGACCAGATTCCAGTGCTCATGACCCAACAGGTA...CAGAGACATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCTCAGCGACTTCCTCCTGACCCACAGGGTCTTCATGCCCAGCGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109936 CCTCAGCGACTTCCTCCTGACCCACAGGGTCTTCATGCCCAGCGCCCAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TCTGCGCTGCCCTTCTGCACCA         CTTCCATGTGGAGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109986 TCTGCGCTGCCCTTCTGCACCAATA...CACCTTCCATGTGGAGCCTGCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GGTGGCAGCGAGCAGGAGCGCAGCACCTACGTCTGCAACAAGAGGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110238 GGTGGCAGCGAGCAGGAGCGCAGCACCTACGTCTGCAACAAGAGGCAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GATCTTGCGGCTGGTCAGCCAGTGGGTGGCCCTGTATGGCTCCATGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110288 GATCTTGCGGCTGGTCAGCCAGTGGGTGGCCCTGTATGGCTCCATGCTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ACACTGACCCTGTGGCCACCAGCTTCCTCCAG         AAACTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110338 ACACTGACCCTGTGGCCACCAGCTTCCTCCAGGTA...TAGAAACTCTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 GACCTGGTGGGCAGGGACACCCGACTCAGCAACCTGCTGAGGGAGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110464 GACCTGGTGGGCAGGGACACCCGACTCAGCAACCTGCTGAGGGAGCAGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GCCAGAGAGGCGGCGATGCCACAG         GTTGGAGAATGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 110514 GCCAGAGAGGCGGCGATGCCACAGGTG...CAGGTTGGAGAATGGCTGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GGAATGCATCTCCTCAGATGAAG         GCCCGGAACTTGCCTGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 111199 GGAATGCATCTCCTCAGATGAAGGTG...CAGGCCCGGAACTTGCCTGTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 TGGCTCCCCAACCAGGACGAGCCCCTTCCTGGCAGCAGCTGTGCCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114031 TGGCTCCCCAACCAGGACGAGCCCCTTCCTGGCAGCAGCTGTGCCATCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 AGTTGGGGATAAAG         TCCCCTATGACATCTGCCGGCCAGACC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 114081 AGTTGGGGATAAAGGTT...CAGTCCCCTATGACATCTGCCGGCCAGACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 ACTCAGTGTTGACCCTGCAGCTGCCTGTGACAGCCTCCGTGAGAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114432 ACTCAGTGTTGACCCTGCAGCTGCCTGTGACAGCCTCCGTGAGAGAGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 ATGGCAGCGTTGGCCCAGGAGGATGGCTGGACCAAGGGGCAGGTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114482 ATGGCAGCGTTGGCCCAGGAGGATGGCTGGACCAAGGGGCAGGTGCTGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GAAGGTCAATTCTGCAGGTG         ATGCCATTGGCCTGCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 114532 GAAGGTCAATTCTGCAGGTGGTG...CAGATGCCATTGGCCTGCAGCCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 ATGCCCGTGGTGTGGCCACATCTCTGGGGCTCAATGAGCGTCTCTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116500 ATGCCCGTGGTGTGGCCACATCTCTGGGGCTCAATGAGCGTCTCTTTGTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 GTCAACCCACAGGAAGTGCATGAGCTG         ATCCCACACCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116550 GTCAACCCACAGGAAGTGCATGAGCTGGTA...CAGATCCCACACCCTGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 CCAGCTGGGGCCCACTGTGGGCTCTGCTGAGGGGCTGGACCTGGTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117055 CCAGCTGGGGCCCACTGTGGGCTCTGCTGAGGGGCTGGACCTGGTGAGTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 CCAAGGACCTGGCAGGCCAGCTGACGGACCACGACTGGAGCCTCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117105 CCAAGGACCTGGCAGGCCAGCTGACGGACCACGACTGGAGCCTCTTCAAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 AGTATCCACCAG         GTGGAGCTGATCCACTATGTGCTGGGCCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 117155 AGTATCCACCAGGTA...CAGGTGGAGCTGATCCACTATGTGCTGGGCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 CCAGCATCTGCGGGATGTCACCACCGCCAACCTGGAGCGCTTCATGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117287 CCAGCATCTGCGGGATGTCACCACCGCCAACCTGGAGCGCTTCATGCGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 GCTTCAATGAGCTGCAGTACTGGGTGGCCACCGAGCTGTGTCTCTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117337 GCTTCAATGAGCTGCAGTACTGGGTGGCCACCGAGCTGTGTCTCTGCCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 GTGCCCGGCCCCCGGGCCCAGCTGCTCAGGAAGTTCATTAAGCTGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117387 GTGCCCGGCCCCCGGGCCCAGCTGCTCAGGAAGTTCATTAAGCTGGCGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 CCA         CCTCAAGGAGCAGAAGAATCTCAATTCCTTCTTTGCCG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117437 CCAGTG...CAGCCTCAAGGAGCAGAAGAATCTCAATTCCTTCTTTGCCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 TCATGTTTGGCCTCAGCAACTCGGCCATCAGCCGCCTAGCCCACACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117724 TCATGTTTGGCCTCAGCAACTCGGCCATCAGCCGCCTAGCCCACACCTGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 GAG         CGGCTGCCTCACAAAGTCCGGAAGCTGTACTCCGCCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117774 GAGGTA...CAGCGGCTGCCTCACAAAGTCCGGAAGCTGTACTCCGCCCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 CGAGAGGCTGCTG         GATCCCTCATGGAACCACCGGGTATACC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117928 CGAGAGGCTGCTGGTG...TAGGATCCCTCATGGAACCACCGGGTATACC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 GACTGGCCCTCGCCAAGCTCTCCCCTCCTGTCATCCCCTTCATGCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118879 GACTGGCCCTCGCCAAGCTCTCCCCTCCTGTCATCCCCTTCATGCCCCTT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 CTTCTCAAAG         ACATGACCTTCATTCATGAGGGAAACCACAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 118929 CTTCTCAAAGGTA...CAGACATGACCTTCATTCATGAGGGAAACCACAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 ACTAGTGGAGAATCTCATCAACTTTGAGAAGATG         AGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119358 ACTAGTGGAGAATCTCATCAACTTTGAGAAGATGGTG...CAGAGAATGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 TGGCCAGAGCCGCGCGGATGCTGCACCACTGCCGAAGCCACAACCCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 119841 TGGCCAGAGCCGCGCGGATGCTGCACCACTGCCGAAGCCACAACCCTGGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2582        TGCCTCTCTCACCACTCAGAAGCCGAGTTTCCCACCTCCACGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119891 G...CAGTGCCTCTCTCACCACTCAGAAGCCGAGTTTCCCACCTCCACGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 GGACAGCCAGGTGGCGAGGATTTCCACAT         GCTCGGAGCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 120031 GGACAGCCAGGTGGCGAGGATTTCCACATGTA...CAGGCTCGGAGCAGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 CCCTGAGCACCCGGAGTCCAGCCAGCACCTGGGCTTATGTCCAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120408 CCCTGAGCACCCGGAGTCCAGCCAGCACCTGGGCTTATGTCCAGCAGCTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 AAGGTCATTGACAACCAGCGGGAACTCTCCCGCCTCTCCCGAGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120458 AAGGTCATTGACAACCAGCGGGAACTCTCCCGCCTCTCCCGAGAGCTGGA

   3000 
   2766 GCCA
        ||||
 120508 GCCA